Importance of protein intrinsic conformational dynamics and transient nature of non-covalent interactions in ligand binding affinity.

Kekez, Mario; Zanki, Vladimir; Anticevic, Ivan; Rokov-Plavec, Jasmina; Marsavelski, Aleksandra

Kekez, Mario; Zanki, Vladimir; Anticevic, Ivan; Rokov-Plavec, Jasmina; Marsavelski, Aleksandra.

Afiliación

Kekez M; Division of Biochemistry, Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Zagreb, Croatia.
Zanki V; Division of Biochemistry, Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Zagreb, Croatia.
Anticevic I; Division of Biochemistry, Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Zagreb, Croatia.
Rokov-Plavec J; Division of Biochemistry, Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Zagreb, Croatia. Electronic address: rokov@chem.pmf.hr.
Marsavelski A; Division of Biochemistry, Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Zagreb, Croatia. Electronic address: aleksandra.marsavelski@chem.pmf.hr.

Int J Biol Macromol ; 192: 692-700, 2021 Dec 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34655583

Asunto(s)

Ligandos; Simulación del Acoplamiento Molecular; Simulación de Dinámica Molecular; Conformación Proteica; Proteínas/química; Algoritmos; Secuencia de Aminoácidos; Sitios de Unión; Enlace de Hidrógeno; Unión Proteica; Relación Estructura-Actividad

Palabras clave

BEN1; Binding affinity; Distant protein truncation; Intrinsic protein dynamics; Microscale thermophoresis; Molecular-dynamics simulations; NADP cofactor

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Conformación Proteica / Proteínas / Simulación de Dinámica Molecular / Simulación del Acoplamiento Molecular / Ligandos Idioma: En Revista: Int J Biol Macromol Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Croacia

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