Efficient mapping of accurate long reads in minimizer space with mapquik.

Ekim, Baris; Sahlin, Kristoffer; Medvedev, Paul; Berger, Bonnie; Chikhi, Rayan

Ekim, Baris; Sahlin, Kristoffer; Medvedev, Paul; Berger, Bonnie; Chikhi, Rayan.

Afiliación

Ekim B; Computer Science and Artificial Intelligence Laboratory (CSAIL), Massachusetts Institute of Technology (MIT), Cambridge, Massachusetts 02139, USA.
Sahlin K; Department of Mathematics, Massachusetts Institute of Technology (MIT), Cambridge, Massachusetts 02139, USA.
Medvedev P; Department of Mathematics, Science for Life Laboratory, Stockholm University, SE-106 91 Stockholm, Sweden.
Berger B; Department of Computer Science and Engineering, The Pennsylvania State University, University Park, Pennsylvania 16802, USA.
Chikhi R; Department of Biochemistry and Molecular Biology, The Pennsylvania State University, University Park, Pennsylvania 16802, USA.

Genome Res ; 33(7): 1188-1197, 2023 07.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-37399256

Asunto(s)

Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Programas Informáticos; Humanos; Algoritmos; Análisis de Secuencia de ADN; Genoma Humano

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Límite: Humans Idioma: En Revista: Genome Res Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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