CellTICS: an explainable neural network for cell-type identification and interpretation based on single-cell RNA-seq data.

Yin, Qingyang; Chen, Liang

Yin, Qingyang; Chen, Liang.

Afiliación

Yin Q; Department of Quantitative and Computational Biology, University of Southern California, 1050 Childs Way, Los Angeles, CA 90089, United States.
Chen L; Department of Quantitative and Computational Biology, University of Southern California, 1050 Childs Way, Los Angeles, CA 90089, United States.

Brief Bioinform ; 25(1)2023 11 22.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-38061196

Asunto(s)

Análisis de la Célula Individual; Análisis de Expresión Génica de una Sola Célula; Análisis de la Célula Individual/métodos; Redes Neurales de la Computación; Aprendizaje Automático; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Análisis por Conglomerados

Palabras clave

cell type identification; explainable neural network; pathways; scRNA-seq data

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Análisis de la Célula Individual / Análisis de Expresión Génica de una Sola Célula Idioma: En Revista: Brief Bioinform Asunto de la revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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