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Microfluidic PCR combined with pyrosequencing for identification of allelic variants with phenotypic associations among targeted Salmonella genes.
Yue, Min; Schmieder, Robert; Edwards, Robert A; Rankin, Shelley C; Schifferli, Dieter M.
Afiliação
  • Yue M; Department of Pathobiology, School of Veterinary Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, Pennsylvania, USA.
Appl Environ Microbiol ; 78(20): 7480-2, 2012 Oct.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-22885744
A novel targeted massive parallel sequencing approach identified genetic variation in eight known or predicted fimbrial adhesins for 46 Salmonella strains. The results highlight associations between specific adhesin alleles, host species, and antimicrobial resistance. The differentiation of allelic variants has potential applications for diagnostic microbiology and epidemiological investigations.
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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Salmonella / Variação Genética / Reação em Cadeia da Polimerase / Adesinas Bacterianas / Técnicas Analíticas Microfluídicas / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Appl Environ Microbiol Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos
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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Salmonella / Variação Genética / Reação em Cadeia da Polimerase / Adesinas Bacterianas / Técnicas Analíticas Microfluídicas / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Appl Environ Microbiol Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos