The linkage method: a novel approach for SNP detection and haplotype reconstruction from a single diploid individual using next-generation sequence data.

Sasaki, Eriko; Sugino, Ryuichi P; Innan, Hideki

Sasaki, Eriko; Sugino, Ryuichi P; Innan, Hideki.

Afiliação

Sasaki E; Graduate University for Advanced Studies, Hayama, Kanagawa, Japan. eriko.sasaki@gmi.oeaw.ac.at

Mol Biol Evol ; 30(9): 2187-96, 2013 Sep.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-23728796

Assuntos

Algoritmos; Diploide; Drosophila melanogaster/genética; Haplótipos; Polimorfismo de Nucleotídeo Único; Análise de Sequência de DNA/métodos; Software; Alelos; Animais; Sequência de Bases; Ligação Genética; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Dados de Sequência Molecular; Taxa de Mutação

Palavras-chave

SNP calling; algorithm; haplotype phasing; next generation sequence; software

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Haplótipos / Software / Análise de Sequência de DNA / Polimorfismo de Nucleotídeo Único / Diploide / Drosophila melanogaster Tipo de estudo: Diagnostic_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: Mol Biol Evol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2013 Tipo de documento: Article País de afiliação: Japão

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