When the Scaffold Cannot Be Ignored: The Role of the Hydrophobic Core in Ligand Binding and Specificity.

Koulechova, Diana A; Tripp, Katherine W; Horner, Geoffrey; Marqusee, Susan

Koulechova, Diana A; Tripp, Katherine W; Horner, Geoffrey; Marqusee, Susan.

Afiliação

Koulechova DA; California Institute for Quantitative Biosciences- Berkeley, University of California, Berkeley, CA 94720-3220, USA; Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, CA 94720-3220, USA.
Tripp KW; Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, CA 94720-3220, USA.
Horner G; California Institute for Quantitative Biosciences- Berkeley, University of California, Berkeley, CA 94720-3220, USA; Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, CA 94720-3220, USA.
Marqusee S; California Institute for Quantitative Biosciences- Berkeley, University of California, Berkeley, CA 94720-3220, USA; Department of Molecular and Cell Biology, University of California, Berkeley, CA 94720-3220, USA. Electronic address: marqusee@berkeley.edu.

J Mol Biol ; 427(20): 3316-3326, 2015 Oct 09.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26301601

Assuntos

Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo; Proteínas de Escherichia coli/metabolismo; Proteínas Repressoras/metabolismo; Termodinâmica; Proteínas Virais Reguladoras e Acessórias/metabolismo; Dicroísmo Circular; Proteínas de Ligação a DNA/genética; Escherichia coli/metabolismo; Proteínas de Escherichia coli/genética; Interações Hidrofóbicas e Hidrofílicas; Ligantes; Modelos Moleculares; Ligação Proteica; Estrutura Terciária de Proteína; Proteínas Repressoras/genética; Proteínas Virais Reguladoras e Acessórias/genética

Palavras-chave

DNA binding; energy landscape; hydrophobic core; ligand binding

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas Repressoras / Termodinâmica / Proteínas de Escherichia coli / Proteínas de Ligação a DNA / Proteínas Virais Reguladoras e Acessórias Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: J Mol Biol Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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