Norovirus RNA-dependent RNA polymerase: A computational study of metal-binding preferences.

Shaik, Md Munan; Bhattacharjee, Nicholus; Feliks, Mikolaj; Ng, Kenneth K-S; Field, Martin J

Shaik, Md Munan; Bhattacharjee, Nicholus; Feliks, Mikolaj; Ng, Kenneth K-S; Field, Martin J.

Afiliação

Shaik MM; Division of Molecular Medicine, Boston Children's Hospital, Boston, Massachusetts, 02115.
Bhattacharjee N; Department of Pediatrics, Harvard Medical School, 3 Blackfan Street, Boston, Massachusetts, 02115.
Feliks M; Dynamo Team/DYNAMOP Group, UMR5075, Université Grenoble I, CEA, CNRS, Institut de Biologie Structurale, 71 Avenue des Martyrs, CS 10090, Grenoble Cedex 9, 38044, France.
Ng KK; Dynamo Team/DYNAMOP Group, UMR5075, Université Grenoble I, CEA, CNRS, Institut de Biologie Structurale, 71 Avenue des Martyrs, CS 10090, Grenoble Cedex 9, 38044, France.
Field MJ; Department of Biological Sciences and Alberta Glycomics Centre, University of Calgary, Calgary, Alberta, Canada.

Proteins ; 85(8): 1435-1445, 2017 Aug.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28383118

Assuntos

Cobre/química; Manganês/química; Norovirus/química; Oligorribonucleotídeos/química; RNA Polimerase Dependente de RNA/química; Proteínas Virais/química; Motivos de Aminoácidos; Sítios de Ligação; Domínio Catalítico; Cátions Bivalentes; Cobalto/química; Cristalografia por Raios X; Ferro/química; Cinética; Simulação de Dinâmica Molecular; Níquel/química; Norovirus/enzimologia; Ligação Proteica; Conformação Proteica em alfa-Hélice; Conformação Proteica em Folha beta; Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas; Teoria Quântica; RNA Polimerase Dependente de RNA/genética; RNA Polimerase Dependente de RNA/metabolismo; Proteínas Recombinantes/química; Proteínas Recombinantes/genética; Proteínas Recombinantes/metabolismo; Especificidade por Substrato; Termodinâmica; Proteínas Virais/genética; Proteínas Virais/metabolismo; Zinco/química

Palavras-chave

RNA-dependent RNA polymerase; gastroenteritis; metal binding; norovirus; quantum chemical/molecular mechanical hybrid potentials

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Oligorribonucleotídeos / Proteínas Virais / RNA Polimerase Dependente de RNA / Cobre / Norovirus / Manganês Idioma: En Revista: Proteins Assunto da revista: BIOQUIMICA Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article

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