Predicting transcription factor binding motifs from DNA-binding domains, chromatin accessibility and gene expression data.

Zamanighomi, Mahdi; Lin, Zhixiang; Wang, Yong; Jiang, Rui; Wong, Wing Hung

Zamanighomi, Mahdi; Lin, Zhixiang; Wang, Yong; Jiang, Rui; Wong, Wing Hung.

Afiliação

Zamanighomi M; Department of Statistics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA.
Lin Z; Department of Statistics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA.
Wang Y; Academy of Mathematics and Systems Science, National Center for Mathematics and Interdisciplinary Sciences, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190, China.
Jiang R; MOE Key Laboratory of Bioinformatics, Bioinformatics Division and Center for Synthetic & Systems Biology, TNLIST, Department of Automation, Tsinghua University, Beijing 100084, China.
Wong WH; Department of Statistics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA.

Nucleic Acids Res ; 45(10): 5666-5677, 2017 Jun 02.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28472398

Assuntos

Algoritmos; Cromatina/química; DNA/química; Regulação da Expressão Gênica; Modelos Estatísticos; Fatores de Transcrição/genética; Sítios de Ligação; Cromatina/metabolismo; DNA/genética; DNA/metabolismo; Genoma Humano; Humanos; Motivos de Nucleotídeos; Ligação Proteica; Técnica de Seleção de Aptâmeros; Fatores de Transcrição/metabolismo

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Fatores de Transcrição / Algoritmos / DNA / Cromatina / Regulação da Expressão Gênica / Modelos Estatísticos Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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