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A Comprehensive Approach to Sequence-oriented IsomiR annotation (CASMIR): demonstration with IsomiR profiling in colorectal neoplasia.
Wu, Chung Wah; Evans, Jared M; Huang, Shengbing; Mahoney, Douglas W; Dukek, Brian A; Taylor, William R; Yab, Tracy C; Smyrk, Thomas C; Jen, Jin; Kisiel, John B; Ahlquist, David A.
Afiliação
  • Wu CW; Division of Gastroenterology and Hepatology, Mayo Clinic, 200 First Street SW, Rochester, MN, 55905, USA.
  • Evans JM; Division of Biomedical Statistics and Informatics, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA.
  • Huang S; Division of Bioinformatics and Computational Biology, University of Minnesota Rochester, Rochester, MN, USA.
  • Mahoney DW; Division of Biomedical Statistics and Informatics, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA.
  • Dukek BA; Division of Gastroenterology and Hepatology, Mayo Clinic, 200 First Street SW, Rochester, MN, 55905, USA.
  • Taylor WR; Division of Gastroenterology and Hepatology, Mayo Clinic, 200 First Street SW, Rochester, MN, 55905, USA.
  • Yab TC; Division of Gastroenterology and Hepatology, Mayo Clinic, 200 First Street SW, Rochester, MN, 55905, USA.
  • Smyrk TC; Division of Anatomic Pathology, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA.
  • Jen J; Genome Analysis Core, Medical Genome Facility, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA.
  • Kisiel JB; Division of Experimental Pathology, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA.
  • Ahlquist DA; Division of Gastroenterology and Hepatology, Mayo Clinic, 200 First Street SW, Rochester, MN, 55905, USA.
BMC Genomics ; 19(1): 401, 2018 May 25.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29801434
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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Neoplasias Colorretais / Análise de Sequência de RNA / Perfilação da Expressão Gênica / MicroRNAs / Anotação de Sequência Molecular / Isoformas de RNA Limite: Female / Humans / Male / Middle aged Idioma: En Revista: BMC Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos
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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Neoplasias Colorretais / Análise de Sequência de RNA / Perfilação da Expressão Gênica / MicroRNAs / Anotação de Sequência Molecular / Isoformas de RNA Limite: Female / Humans / Male / Middle aged Idioma: En Revista: BMC Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos