OCMA: Fast, Memory-Efficient Factorization of Prohibitively Large Relationship Matrices.

Xiong, Zhi; Zhang, Qingrun; Platt, Alexander; Liao, Wenyuan; Shi, Xinghua; de Los Campos, Gustavo; Long, Quan

Xiong, Zhi; Zhang, Qingrun; Platt, Alexander; Liao, Wenyuan; Shi, Xinghua; de Los Campos, Gustavo; Long, Quan.

Afiliação

Xiong Z; Department of Computer Science, Shantou University, China.
Zhang Q; Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Calgary, Canada.
Platt A; Annie Charbonneau Cancer Institute, University of Calgary, Canada.
Liao W; Center for Computational Genetics and Genomics, Temple University, USA.
Shi X; Department of Mathematics and Statistics, University of Calgary, Canada.
de Los Campos G; Department of Bioinformatics and Genomics, University of North Carolina at Charlotte, USA.
Long Q; Department of Epidemiology & Biostatistics, Statistics & Probability and Institute for Quantitative Health Science and Engineering, Michigan State University, USA.

G3 (Bethesda) ; 9(1): 13-19, 2019 01 09.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30482799

Assuntos

Genoma/genética; Genômica; Modelos Genéticos; Algoritmos; Animais; Bancos de Espécimes Biológicos/tendências; Cruzamento; Simulação por Computador; Genótipo; Humanos; Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética; Análise de Componente Principal; Software

Palavras-chave

Eigen decomposition; Gene mapping; Genetic matrices; Genomic selection; Genotype-based phenotype prediction; Memory virtualization; Singular value decomposition

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma / Genômica / Modelos Genéticos Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: G3 (Bethesda) Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: China

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