Temperature-pressure shuffling outlier flooding method enhances the conformational sampling of proteins.

Harada, Ryuhei; Yoshino, Ryunosuke; Nishizawa, Hiroaki; Shigeta, Yasuteru

Harada, Ryuhei; Yoshino, Ryunosuke; Nishizawa, Hiroaki; Shigeta, Yasuteru.

Afiliação

Harada R; Center for Computational Sciences, University of Tsukuba, 1-1-1 Tennodai, Tsukuba, Ibaraki 305-8577, Japan.
Yoshino R; Transborder Medical Research Center, University of Tsukuba, 1-1-1 Tenodai Tsukuba, Ibaraki 305-8577, Japan.
Nishizawa H; Center for Computational Sciences, University of Tsukuba, 1-1-1 Tennodai, Tsukuba, Ibaraki 305-8577, Japan.
Shigeta Y; Center for Computational Sciences, University of Tsukuba, 1-1-1 Tennodai, Tsukuba, Ibaraki 305-8577, Japan.

J Comput Chem ; 40(15): 1530-1537, 2019 06 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30816578

Assuntos

Simulação de Dinâmica Molecular; Pressão; Proteínas/química; Temperatura; Conformação Proteica

Palavras-chave

Enhanced Sampling of Proteins; Extended OFLOOD; Molecular Dynamics; Protein Folding; Trp-Cage

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Pressão / Temperatura / Proteínas / Simulação de Dinâmica Molecular Idioma: En Revista: J Comput Chem Assunto da revista: QUIMICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Japão

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