Bayesian reconstruction of a vancomycin-resistant Enterococcus transmission route using epidemiologic data and genomic variants from whole genome sequencing.

Fujikura, Y; Hamamoto, T; Kanayama, A; Kaku, K; Yamagishi, J; Kawana, A

Fujikura, Y; Hamamoto, T; Kanayama, A; Kaku, K; Yamagishi, J; Kawana, A.

Afiliação

Fujikura Y; Department of Medical Risk Management and Infection Control, National Defense Medical College Hospital, Saitama, Japan; Division of Infectious Diseases and Respiratory Medicine, Department of Internal Medicine, National Defense Medical College, Saitama, Japan. Electronic address: fujikura@ndmc.ac.jp
Hamamoto T; Department of Clinical Laboratory, National Defense Medical College Hospital, Saitama, Japan.
Kanayama A; Division of Infectious Diseases Epidemiology and Control, National Defense Medical College Research Institute, Saitama, Japan.
Kaku K; Division of Infectious Diseases Epidemiology and Control, National Defense Medical College Research Institute, Saitama, Japan.
Yamagishi J; Research Center for Zoonosis Control, Hokkaido University, Sapporo, Japan.
Kawana A; Division of Infectious Diseases and Respiratory Medicine, Department of Internal Medicine, National Defense Medical College, Saitama, Japan.

J Hosp Infect ; 103(4): 395-403, 2019 Dec.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31425718

Assuntos

Transmissão de Doença Infecciosa; Enterococcus faecium/isolamento & purificação; Infecções por Bactérias Gram-Positivas/epidemiologia; Infecções por Bactérias Gram-Positivas/transmissão; Epidemiologia Molecular; Enterococos Resistentes à Vancomicina/isolamento & purificação; Sequenciamento Completo do Genoma; Adulto; Idoso; Idoso de 80 Anos ou mais; Teorema de Bayes; Infecção Hospitalar/epidemiologia; Infecção Hospitalar/transmissão; Surtos de Doenças; Enterococcus faecium/classificação; Enterococcus faecium/genética; Feminino; Genótipo; Humanos; Masculino; Pessoa de Meia-Idade; Tipagem Molecular; Fatores de Risco; Enterococos Resistentes à Vancomicina/classificação; Enterococos Resistentes à Vancomicina/genética

Palavras-chave

Bayesian approach; Epidemiology; Outbreak; Vancomycin-resistant enterococcus; Whole genome sequence

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Infecções por Bactérias Gram-Positivas / Enterococcus faecium / Epidemiologia Molecular / Transmissão de Doença Infecciosa / Enterococos Resistentes à Vancomicina / Sequenciamento Completo do Genoma Tipo de estudo: Etiology_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Adult / Aged / Aged80 / Female / Humans / Male / Middle aged Idioma: En Revista: J Hosp Infect Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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