Systematic evaluation of differential splicing tools for RNA-seq studies.

Mehmood, Arfa; Laiho, Asta; Venäläinen, Mikko S; McGlinchey, Aidan J; Wang, Ning; Elo, Laura L

Mehmood, Arfa; Laiho, Asta; Venäläinen, Mikko S; McGlinchey, Aidan J; Wang, Ning; Elo, Laura L.

Afiliação

Mehmood A; Turku Bioscience Centre, University of Turku and Åbo Akademi University, Turku, Finland.
Laiho A; Department of Physiology, University of Turku, Turku, Finland.
Venäläinen MS; Turku Bioscience Centre, University of Turku and Åbo Akademi University, Turku, Finland.
McGlinchey AJ; Turku Bioscience Centre, University of Turku and Åbo Akademi University, Turku, Finland.
Wang N; Turku Bioscience Centre, University of Turku and Åbo Akademi University, Turku, Finland.
Elo LL; School of Medical Sciences, Örebro University, Örebro, Sweden.

Brief Bioinform ; 21(6): 2052-2065, 2020 12 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31802105

Assuntos

Splicing de RNA; RNA-Seq; Análise de Sequência de RNA; Éxons; Isoformas de Proteínas; Reprodutibilidade dos Testes; Análise de Sequência de RNA/métodos

Palavras-chave

RNA-seq; differential splicing; event-based methods; exon-based methods; isoform-based methods; splicing events

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Splicing de RNA / Análise de Sequência de RNA / RNA-Seq Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Brief Bioinform Assunto da revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Finlândia

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