A strategy for predicting gene functions from genome and metagenome sequences on the basis of oligopeptide frequency distance.

Abe, Takashi; Ikarashi, Ryo; Mizoguchi, Masaya; Otake, Masashi; Ikemura, Toshimichi

Abe, Takashi; Ikarashi, Ryo; Mizoguchi, Masaya; Otake, Masashi; Ikemura, Toshimichi.

Afiliação

Abe T; Department of Information Engineering, Faculty of Engineering, Niigata University.
Ikarashi R; Department of Information Engineering, Faculty of Engineering, Niigata University.
Mizoguchi M; Department of Information Engineering, Faculty of Engineering, Niigata University.
Otake M; Department of Information Engineering, Faculty of Engineering, Niigata University.
Ikemura T; Department of Bioscience, Nagahama Institute of Bio-Science and Technology.

Genes Genet Syst ; 95(1): 11-19, 2020 Apr 22.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32161228

Assuntos

Algoritmos; Eucariotos/genética; Metagenoma/genética; Metagenômica; Anotação de Sequência Molecular; Oligopeptídeos/genética; Sequência de Aminoácidos; Mapeamento Cromossômico; Proteínas/genética; Proteínas/metabolismo; Alinhamento de Sequência

Palavras-chave

alignment-free; metagenome; oligopeptide frequency; protein function

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Oligopeptídeos / Algoritmos / Metagenoma / Eucariotos / Metagenômica / Anotação de Sequência Molecular Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Genes Genet Syst Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / BIOTECNOLOGIA Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article

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