Integrated Genome-Scale Analysis and Northern Blot Detection of Retrotransposon siRNAs Across Plant Species.

Böhrer, Marcel; Rymen, Bart; Himber, Christophe; Gerbaud, Aude; Pflieger, David; Laudencia-Chingcuanco, Debbie; Cartwright, Amy; Vogel, John; Sibout, Richard; Blevins, Todd

Böhrer, Marcel; Rymen, Bart; Himber, Christophe; Gerbaud, Aude; Pflieger, David; Laudencia-Chingcuanco, Debbie; Cartwright, Amy; Vogel, John; Sibout, Richard; Blevins, Todd.

Afiliação

Böhrer M; Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, CNRS UPR2357, Université de Strasbourg, Strasbourg, France.
Rymen B; Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, CNRS UPR2357, Université de Strasbourg, Strasbourg, France.
Himber C; Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, CNRS UPR2357, Université de Strasbourg, Strasbourg, France.
Gerbaud A; Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, CNRS UPR2357, Université de Strasbourg, Strasbourg, France.
Pflieger D; Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, CNRS UPR2357, Université de Strasbourg, Strasbourg, France.
Laudencia-Chingcuanco D; USDA ARS Western Regional Research Center, Albany, CA, USA.
Cartwright A; DOE Joint Genome Institute, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, USA.
Vogel J; DOE Joint Genome Institute, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, USA.
Sibout R; INRAE, UR BIA, Nantes, France.
Blevins T; Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR 1318, INRAE, AgroParisTech, CNRS, Université Paris-Saclay, Versailles, France.

Methods Mol Biol ; 2166: 387-411, 2020.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32710422

Assuntos

Arabidopsis/genética; Northern Blotting/métodos; Brachypodium/genética; Genoma de Planta; RNA de Plantas/genética; RNA de Plantas/metabolismo; RNA Interferente Pequeno/genética; RNA Interferente Pequeno/metabolismo; Retroelementos/genética; Proteínas de Arabidopsis/genética; RNA Polimerases Dirigidas por DNA/genética; Plantas Geneticamente Modificadas; Interferência de RNA; RNA de Cadeia Dupla/genética; RNA-Seq; Sequências Repetidas Terminais/genética

Palavras-chave

Arabidopsis thaliana; Brachypodium distachyon; Long terminal repeat (LTR) retrotransposon; Northern blotting; RNA polymerase IV (Pol IV); siRNAs

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Northern Blotting / Arabidopsis / RNA de Plantas / Retroelementos / Genoma de Planta / RNA Interferente Pequeno / Brachypodium Tipo de estudo: Diagnostic_studies Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: França

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