DeepSE: Detecting super-enhancers among typical enhancers using only sequence feature embeddings.

Ji, Qiao-Ying; Gong, Xiu-Jun; Li, Hao-Min; Du, Pu-Feng

Ji, Qiao-Ying; Gong, Xiu-Jun; Li, Hao-Min; Du, Pu-Feng.

Afiliação

Ji QY; College of Intelligence and Computing, Tianjin University, Tianjin 300350, China.
Gong XJ; College of Intelligence and Computing, Tianjin University, Tianjin 300350, China.
Li HM; College of Intelligence and Computing, Tianjin University, Tianjin 300350, China.
Du PF; College of Intelligence and Computing, Tianjin University, Tianjin 300350, China. Electronic address: pdu@tju.edu.cn.

Genomics ; 113(6): 4052-4060, 2021 11.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34666191

Assuntos

Cromatina; Elementos Facilitadores Genéticos; Linhagem Celular; Cromatina/genética; Redes Neurais de Computação; Fatores de Transcrição/genética; Fatores de Transcrição/metabolismo

Palavras-chave

Convolutional neural network; Super-enhancers; dna2vec

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Cromatina / Elementos Facilitadores Genéticos Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: China

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