Improving RNA Assembly via Safety and Completeness in Flow Decompositions.

Khan, Shahbaz; Kortelainen, Milla; Cáceres, Manuel; Williams, Lucia; Tomescu, Alexandru I

Khan, Shahbaz; Kortelainen, Milla; Cáceres, Manuel; Williams, Lucia; Tomescu, Alexandru I.

Afiliação

Khan S; Department of Computer Science and Engineering, IIT Roorkee, Roorkee, India.
Kortelainen M; Department of Computer Science, University of Helsinki, Helsinki, Finland.
Cáceres M; Department of Computer Science, University of Helsinki, Helsinki, Finland.
Williams L; Department of Computer Science, University of Helsinki, Helsinki, Finland.
Tomescu AI; School of Computing, Montana State University, Bozeman, Montana, USA.

J Comput Biol ; 29(12): 1270-1287, 2022 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-36288562

Assuntos

Algoritmos; RNA; RNA/genética; Biologia Computacional/métodos; Heurística; Análise de Sequência de RNA

Palavras-chave

RNA assembly; directed acyclic graphs; flow decomposition; flow networks; safety

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / RNA Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: J Comput Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article País de afiliação: Índia

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