peaksat: an R package for ChIP-seq peak saturation analysis.

Boyd, Joseph R; Gao, Cong; Quinn, Kathleen; Fritz, Andrew; Stein, Janet; Stein, Gary; Glass, Karen; Frietze, Seth

Boyd, Joseph R; Gao, Cong; Quinn, Kathleen; Fritz, Andrew; Stein, Janet; Stein, Gary; Glass, Karen; Frietze, Seth.

Afiliação

Boyd JR; Department of Biomedical and Health Sciences, University of Vermont, 106 Carrigan Drive, 302 Rowell, VT, 04505, Burlington, USA.
Gao C; Department of Biomedical and Health Sciences, University of Vermont, 106 Carrigan Drive, 302 Rowell, VT, 04505, Burlington, USA.
Quinn K; Department of Biomedical and Health Sciences, University of Vermont, 106 Carrigan Drive, 302 Rowell, VT, 04505, Burlington, USA.
Fritz A; Department of Biochemistry, University of Vermont, Burlington, VT, USA.
Stein J; Department of Biochemistry, University of Vermont, Burlington, VT, USA.
Stein G; University of Vermont Cancer Center, Burlington, VT, USA.
Glass K; Department of Biochemistry, University of Vermont, Burlington, VT, USA.
Frietze S; University of Vermont Cancer Center, Burlington, VT, USA.

BMC Genomics ; 24(1): 43, 2023 Jan 25.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-36698077

Assuntos

Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação/métodos; Análise de Sequência de DNA/métodos; Biblioteca Gênica

Palavras-chave

ChIP-Seq; Peak saturation; Read depth estimate

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Texto completo: 1 Bases de dados: MEDLINE Assunto principal: Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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