Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment.
Eur J Immunol
; 54(1): e2350590, 2024 Jan.
Article
em En
| MEDLINE
| ID: mdl-37944995
ABSTRACT
Standard single-cell RNA-sequencing alignment pipelines exhibit a propensity for misassigning killer immunoglobulin-like receptor (KIR) transcripts, thereby giving rise to inaccuracies in quantifying KIR expression. Alves et al. elucidated that these default workflows frequently misclassify activating KIR transcripts as inhibitory KIR expression, resulting in a skewed representation of the KIR repertoire.
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MEDLINE
Assunto principal:
Células Matadoras Naturais
/
Análise da Expressão Gênica de Célula Única
Idioma:
En
Revista:
Eur J Immunol
Ano de publicação:
2024
Tipo de documento:
Article
País de afiliação:
Austrália