RESUMO
The paired detection of the transcriptome and proteome at single-cell resolution provides exquisite insight to immune mechanisms in health and disease. Here, we describe a detailed protocol wherein we combine cellular indexing of transcriptomes and epitopes by sequencing (CITE-Seq), a technique utilizing antibody-derived tags (ADTs) to profile mRNA and proteins simultaneously via sequencing, with fluorescence-activated cell sorting to enrich cell populations. Our protocol provides step-by-step guidance on co-staining cells with both fluorescent antibodies and ADTs simultaneously, instructions on cell sorting and an overview of the single-cell capture workflow using the BD Rhapsody™ system. This method is useful for in-depth single-cell characterization on sorted rare cell populations.
Assuntos
Perfilação da Expressão Gênica , Transcriptoma , Perfilação da Expressão Gênica/métodos , Epitopos , Separação Celular , Anticorpos , Análise de Célula Única/métodosRESUMO
A imunodeficiência comum variável (CVID) é uma doença caracterizada por hipogamaglobulinemia, infecções recorrentes, especialmente das vias aéreas, enfermidades auto-imunes e neoplasias. Alguns pacientes com CVID possuem diversos distúrbios do sistema imune como alterações no número e proporção de diferentes populações leucocitárias; resposta proliferativa linfocitária diminuída para antígenos e mitógenos; produção alterada de citocinas e alteração na expressão de moléculas de superfície. Neste trabalho, são discutidas várias destas alterações imunológicas procurando correlacioná-las aos achados clínicos dos pacientes e incorporar aos dados da literatura os nossos próprios achados.