Bi-allelic Mutations in NADSYN1 Cause Multiple Organ Defects and Expand the Genotypic Spectrum of Congenital NAD Deficiency Disorders.

Birth defects occur in up to 3% of all live births and are the leading cause of infant death. Here we present five individuals from four unrelated families, individuals who share similar phenotypes with disease-causal bi-allelic variants in NADSYN1, encoding NAD synthetase 1, the final enzyme of the nicotinamide adenine dinucleotide (NAD) de novo synthesis pathway. Defects range from the isolated absence of both kidneys to multiple malformations of the vertebrae, heart, limbs, and kidney, and no affected individual survived for more than three months postnatally. NAD is an essential coenzyme for numerous cellular processes. Bi-allelic loss-of-function mutations in genes required for the de novo synthesis of NAD were previously identified in individuals with multiple congenital abnormalities affecting the heart, kidney, vertebrae, and limbs. Functional assessments of NADSYN1 missense variants, through a combination of yeast complementation and enzymatic assays, show impaired enzymatic activity and severely reduced NAD levels. Thus, NADSYN1 represents an additional gene required for NAD synthesis during embryogenesis, and NADSYN1 has bi-allelic missense variants that cause NAD deficiency-dependent malformations. Our findings expand the genotypic spectrum of congenital NAD deficiency disorders and further implicate mutation of additional genes involved in de novo NAD synthesis as potential causes of complex birth defects.

Interventions et techniques de diagnostic prénatal visant l'obtention d'un prélèvement fœtal à des fins diagnostiques : Risques et avantages pour la mère et le fœtus.

OBJECTIF: Offrir aux fournisseurs de soins de maternité et à leurs patientes des lignes directrices factuelles contemporaines en ce qui concerne les services de counseling traitant des risques et des avantages maternels propres à la tenue des interventions diagnostiques prénatales orientées par échographie (et/ou des techniques permettant l'établissement d'un diagnostic génétique) nécessaires dans les cas où il a été établi pendant la période prénatale que la grossesse serait exposée à des risques, ainsi qu'en ce qui concerne la prise de décisions subséquentes quant à la prise en charge de la grossesse (questions abordant des aspects tels que le niveau du fournisseur de soins obstétricaux, la surveillance prénatale, le lieu où devraient se dérouler les soins et l'accouchement, et la décision de poursuivre ou d'interrompre la grossesse). La présente directive clinique se limite aux services de counseling traitant des risques et des avantages maternels, et aux décisions en matière de prise en charge de la grossesse pour les femmes qui nécessitent (ou qui envisagent) la mise en œuvre d'une intervention ou d'une technique effractive orientée par échographie aux fins de l'établissement d'un diagnostic prénatal. POPULATION DE PATIENTES: Femmes enceintes identifiées, à la suite de la mise en œuvre de protocoles établis de dépistage prénatal (taux sériques maternels ± imagerie, résultats d'analyse de l'ADN acellulaire indiquant des risques élevés, résultats anormaux au moment de l'imagerie fœtale diagnostique ou antécédents familiaux de troubles héréditaires), comme étant exposées à un risque accru d'anomalie génétique fœtale. Ces femmes pourraient nécessiter ou demander des services de counseling au sujet des risques et des avantages pour la grossesse de la tenue d'une intervention effractive orientée par échographie visant à déterminer l'étiologie, le diagnostic, et/ou la pathologie de possibles anomalies fœtales. RéSULTATS: La littérature publiée a été récupérée par l'intermédiaire de recherches menées dans Medline, PubMed et The Cochrane Library jusqu'en juin 2014 au moyen d'un vocabulaire contrôlé (« prenatal diagnosis ¼, « amniocentesis ¼, « chorionic villi sampling ¼, « cordocentesis ¼) et de mots clés (« prenatal screening ¼, « prenatal genetic counselling ¼, « post-procedural pregnancy loss rate ¼) appropriés. Les résultats ont été restreints aux analyses systématiques, aux études observationnelles et aux essais comparatifs randomisés / essais cliniques comparatifs publiés en anglais entre janvier 1985 et juin 2014. Les recherches ont été mises à jour de façon régulière et intégrées à la directive clinique jusqu'en juin 2014. La littérature grise (non publiée) a été identifiée par l'intermédiaire de recherches menées dans les sites Web d'organismes s'intéressant à l'évaluation des technologies dans le domaine de la santé et d'organismes connexes, dans des collections de directives cliniques, dans des registres d'essais cliniques et auprès de sociétés de spécialité médicale nationales et internationales. VALEURS: La qualité des résultats a été évaluée au moyen des critères décrits dans le rapport du Groupe d'étude canadien sur les soins de santé préventifs (Tableau 1). AVANTAGES, DéSAVANTAGES ET COûTS: Consentement éclairé de la patiente, transfert des connaissances, évaluation du risque génétique prénatal, soulagement de l'anxiété, création d'anxiété, défense des droits, compréhension du dépistage fœtal, limites du dépistage fœtal, choix en matière de prise en charge de la grossesse, complication de la grossesse ou fausse couche, soins opportuns et améliorés pour l'accouchement d'un enfant présentant une morbidité reconnue. RECOMMANDATIONS.

Joint SOGC-CCMG Opinion for Reproductive Genetic Carrier Screening: An Update for All Canadian Providers of Maternity and Reproductive Healthcare in the Era of Direct-to-Consumer Testing.

OBJECTIVE: This guideline was written to update Canadian maternity care and reproductive healthcare providers on pre- and postconceptional reproductive carrier screening for women or couples who may be at risk of being carriers for autosomal recessive (AR), autosomal dominant (AD), or X-linked (XL) conditions, with risk of transmission to the fetus. Four previous SOGC- Canadian College of Medical Geneticists (CCMG) guidelines are updated and merged into the current document. INTENDED USERS: All maternity care (most responsible health provider [MRHP]) and paediatric providers; maternity nursing; nurse practitioner; provincial maternity care administrator; medical student; and postgraduate resident year 1-7. TARGET POPULATION: Fertile, sexually active females and their fertile, sexually active male partners who are either planning a pregnancy or are pregnant (preferably in the first trimester of pregnancy, but any gestational age is acceptable). OPTIONS: Women and their partners will be able to obtain appropriate genetic carrier screening information and possible diagnosis of AR, AD, or XL disorders (preferably pre-conception), thereby allowing an informed choice regarding genetic carrier screening and reproductive options (e.g., prenatal diagnosis, preimplantation genetic diagnosis, egg or sperm donation, or adoption). OUTCOMES: Informed reproductive decisions related to genetic carrier screening and reproductive outcomes based on family history, ethnic background, past obstetrical history, known carrier status, or genetic diagnosis. SOGC REPRODUCTIVE CARRIER SCREENING SUMMARY STATEMENT (2016): Pre-conception or prenatal education and counselling for reproductive carrier screening requires a discussion about testing within the three perinatal genetic carrier screening/diagnosis time periods, which include pre-conception, prenatal, and neonatal for conditions currently being screened for and diagnosed. This new information should be added to the standard reproductive carrier screening protocols that are already being utilized by the most responsible maternity provider through the informed consent process with the patient. (III-A; GRADE low/moderate) SOGC OVERVIEW OF RECOMMENDATIONS QUALITY AND GRADE: There was a strong observational/expert opinion (quality and grade) for the genetic carrier literature with randomized controlled trial evidence being available only for the invasive testing. Both the Canadian Task Force on Preventive Health Care quality and classification and the GRADE evidence quality and grade are provided. EVIDENCE: MEDLINE; PubMed; government neonatal screening websites; key words/common reproductive genetic carrier screened diseases/previous SOGC Guidelines/medical academic societies (Society of Maternal-Fetal Medicine [SMFM]; American College of Medical Genetics and Genomics; American College of Obstetricians and Gynecologists [ACOG]; CCMG; Royal College Obstetrics and Gynaecology [RCOG] [UK]; American Society of Human Genetics [ASHG]; International Society of Prenatal Diagnosis [ISPD])/provincial neonatal screening policies and programs; search terms (carrier screening, prenatal screening, neonatal genetic/metabolic screening, cystic fibrosis (CF), thalassemia, hemoglobinopathy, hemophilia, Fragile X syndrome (FXS), spinal muscular atrophy, Ashkenazi Jewish carrier screening, genetic carrier screening protocols, AR, AD, XL). SEARCH PERIOD: 10 years (June 2005-September 2015); initial search dates June 30, 2015 and September 15, 2015; completed final search January 4, 2016. Validation of articles was completed by primary authors RD Wilson and I De Bie. BENEFITS, HARMS, AND COST: Benefits are to provide an evidenced based reproductive genetic carrier screening update consensus based on international opinions and publications for the use of Canadian women, who are planning a pregnancy or who are pregnant and have been identified to be at risk (personal or male partner family or reproductive history) for the transmission of a clinically significant genetic condition to their offspring with associated morbidity and/or mortality. Harm may arise from having counselling and informed testing of the carrier status of the mother, their partner, or their fetus, as well as from declining to have this counselling and informed testing or from not having the opportunity for counselling and informed testing. Costs will ensue both from the provision of opportunities for counselling and testing, as well as when no such opportunities are offered or are declined and the birth of a child with a significant inherited condition and resulting morbidity/mortality occurs; these comprise not only the health care costs to the system but also the social/financial/psychological/emotional costs to the family. These recommendations are based on expert opinion and have not been subjected to a health economics assessment and local or provincial implementation will be required. GUIDELINE UPDATE: This guideline is an update of four previous joint SOGC-CCMG Genetic Screening Guidelines dated 2002, 2006, 2008, and 2008 developed by the SOGC Genetic Committee in collaboration with the CCMG Prenatal Diagnosis Committee (now Clinical Practice Committee). 2016 CARRIER SCREENING RECOMMENDATIONS.

Prenatal Diagnosis Procedures and Techniques to Obtain a Diagnostic Fetal Specimen or Tissue: Maternal and Fetal Risks and Benefits.

OBJECTIVE: To provide maternity care providers and their patients with current evidence-based guidelines for maternal risk/benefit counselling for a prenatally identified at-risk pregnancy that requires ultrasound-guided prenatal diagnostic procedures and/or techniques for a genetic diagnosis and for subsequent pregnancy management decisions on questions such as level of obstetrical care provider, antenatal surveillance, location of care and delivery, and continuation or termination of pregnancy. This guideline is limited to maternal risk/benefit counselling and pregnancy management decisions for women who require, or are considering, an invasive ultrasound-guided procedure or technique for prenatal diagnosis. PATIENT POPULATION: Pregnant women identified as having an increased risk of a fetal genetic abnormality secondary to the process of established prenatal screening protocols (maternal serum±imaging, high-risk cell-free DNA results, abnormal diagnostic fetal imaging, or a positive family history of an inherited condition). These women may require or request counselling about pregnancy risks and benefits of an invasive ultrasound-guided procedure to determine the etiology, diagnosis, and/or pathology for the possible fetal anomaly or anomalies. EVIDENCE: Published literature was retrieved through searches of Medline, PubMed, and the Cochrane Library in and prior to June 2014 using an appropriate controlled vocabulary (prenatal diagnosis, amniocentesis, chorionic villi sampling, cordocentesis) and key words (prenatal screening, prenatal genetic counselling, post-procedural pregnancy loss rate). Results were restricted to systematic reviews, randomized control trials/controlled clinical trials, and observational studies written in English and published from January 1985 to June 2014. Searches were updated on a regular basis and incorporated in the guideline to June 2014. Grey (unpublished) literature was identified through searching the websites of health technology assessment and health technology-related agencies, clinical practice guideline collections, clinical trial registries, and national and international medical speciality societies. VALUES: The quality of evidence in this document was rated using the criteria described in the Report of the Canadian Task Force on Preventive Health Care (Table 1). Health benefits, side effects, and risks: Patient informed consent, knowledge translation, genetic prenatal risk assessment, anxiety relief, anxiety creation, advocacy, understanding or limitation for fetal testing, pregnancy management choice, pregnancy complication or loss, timely and improved care for birth of a neonate with recognized morbidity. Recommendations 1. The health care provider should counsel the at-risk pregnant woman on the different levels of genetic fetal testing in order for her to have a clear understanding and expectation of the level of testing and type of results that are offered. (III-B) 2. As part of the informed consent process, the health care provider should review with the at-risk pregnant woman the risks and benefits of in utero genetic diagnostic techniques associated with fetal genetic testing options. (III-A) 3. During risk/benefit counselling, the health care provider should advise that the best estimate of the pregnancy loss rate related to: a.amniocentesis is 0.5% to 1.0% (range 0.17 to 1.53%) (I) b.chorionic villus sampling is 0.5% to 1.0% (I) and c.cordocentesis or percutaneous umbilical blood sampling is 1.3% for fetuses with no anomalies and 1.3% to 25% for fetuses with single or multiple anomalies or intrauterine growth restriction. (II-2A).

Objectif : Offrir aux fournisseurs de soins de maternité et à leurs patientes des lignes directrices factuelles contemporaines en ce qui concerne les services de counseling traitant des risques et des avantages maternels propres à la tenue des interventions diagnostiques prénatales orientées par échographie (et/ou des techniques permettant l'établissement d'un diagnostic génétique) nécessaires dans les cas où il a été établi pendant la période prénatale que la grossesse serait exposée à des risques, ainsi qu'en ce qui concerne la prise de décisions subséquentes quant à la prise en charge de la grossesse (questions abordant des aspects tels que le niveau du fournisseur de soins obstétricaux, la surveillance prénatale, le lieu où devraient se dérouler les soins et l'accouchement, et la décision de poursuivre ou d'interrompre la grossesse). La présente directive clinique se limite aux services de counseling traitant des risques et des avantages maternels, et aux décisions en matière de prise en charge de la grossesse pour les femmes qui nécessitent (ou qui envisagent) la mise en œuvre d'une intervention ou d'une technique effractive orientée par échographie aux fins de l'établissement d'un diagnostic prénatal. Population de patientes : Femmes enceintes identifiées, à la suite de la mise en œuvre de protocoles établis de dépistage prénatal (taux sériques maternels ± imagerie, résultats d'analyse de l'ADN acellulaire indiquant des risques élevés, résultats anormaux au moment de l'imagerie fœtale diagnostique ou antécédents familiaux de troubles héréditaires), comme étant exposées à un risque accru d'anomalie génétique fœtale. Ces femmes pourraient nécessiter ou demander des services de counseling au sujet des risques et des avantages pour la grossesse de la tenue d'une intervention effractive orientée par échographie visant à déterminer l'étiologie, le diagnostic, et/ou la pathologie de possibles anomalies fœtales. Résultats : La littérature publiée a été récupérée par l'intermédiaire de recherches menées dans Medline, PubMed et The Cochrane Library jusqu'en juin 2014 au moyen d'un vocabulaire contrôlé (« prenatal diagnosis ¼, « amniocentesis ¼, « chorionic villi sampling ¼, « cordocentesis ¼) et de mots clés (« prenatal screening ¼, « prenatal genetic counselling ¼, « post-procedural pregnancy loss rate ¼) appropriés. Les résultats ont été restreints aux analyses systématiques, aux études observationnelles et aux essais comparatifs randomisés / essais cliniques comparatifs publiés en anglais entre janvier 1985 et juin 2014. Les recherches ont été mises à jour de façon régulière et intégrées à la directive clinique jusqu'en juin 2014. La littérature grise (non publiée) a été identifiée par l'intermédiaire de recherches menées dans les sites Web d'organismes s'intéressant à l'évaluation des technologies dans le domaine de la santé et d'organismes connexes, dans des collections de directives cliniques, dans des registres d'essais cliniques et auprès de sociétés de spécialité médicale nationales et internationales. Valeurs : La qualité des résultats a été évaluée au moyen des critères décrits dans le rapport du Groupe d'étude canadien sur les soins de santé préventifs (Tableau). Avantages, désavantages et coûts : Consentement éclairé de la patiente, transfert des connaissances, évaluation du risque génétique prénatal, soulagement de l'anxiété, création d'anxiété, défense des droits, compréhension du dépistage fœtal, limites du dépistage fœtal, choix en matière de prise en charge de la grossesse, complication de la grossesse ou fausse couche, soins opportuns et améliorés pour l'accouchement d'un enfant présentant une morbidité reconnue. Recommandations 1. Les fournisseurs de soins de santé devraient offrir, aux femmes enceintes exposées à des risques, des services de counseling au sujet des différents niveaux du dépistage génétique fœtal, de façon à ce qu'elles puissent bien comprendre le niveau du dépistage qui leur est offert et les types de résultats auxquels elles sont en droit de s'attendre. (III-B) 2. Les fournisseurs de soins de santé devraient offrir, aux femmes enceintes exposées à des risques, des services de counseling au sujet de la ou des techniques de diagnostic génétique in utero qui sont associées aux options de dépistage génétique fœtal et en passer en revue les risques et les avantages dans le cadre du processus de consentement éclairé. (III-A) 3. Dans le cadre des services de counseling sur les risques et les avantages, les fournisseurs de soins de santé devraient aviser leurs patientes des meilleures estimations suivantes en ce qui concerne le taux de fausse couche : a. amniocentèse = 0,5%-1,0 % (plage : 0,17-1,53 %) (I) b. prélèvement de villosités choriales = 0,5 %-1,0 % (I) et c. cordocentèse (ou prélèvement percutané de sang ombilical) = 1,3 %, dans le cas des fœtus sans anomalies, et 1,3 %-25 %, dans le cas des fœtus présentant une ou des anomalies ou un retard de croissance intra-utérin. (II-2A).

RETIRED: Technical Update: Preimplantation Genetic Diagnosis and Screening

This document has been archived because it contains outdated information. It should not be consulted for clinical use, but for historical research only. Please visit the journal website for the most recent guidelines.

Ce document a été archivé, car il contient des informations périmées. Il ne devrait pas être consulté pour un usage clinique, mais uniquement pour des recherches historiques. Veuillez consulter le site web du journal pour les directives les plus récentes.

Resolving severe oligohydramnios as an early prenatal presentation of renal coloboma syndrome-A report of two generations.

This report suggests that self-resolving oligohydramnios is an early sign of malfunctioning kidney in individuals with renal coloboma syndrome (RCS) and demonstrates how a genetic diagnosis can impact patient and fetal management as it outlines two generations of RCS.

TP63-mutation as a cause of prenatal lethal multicystic dysplastic kidneys.

BACKGROUND: Ectrodactyly-ectodermal dysplasia-clefting syndrome 3 (EEC) is one of the six overlapping syndromes caused by mutations in the tumor protein p63 gene (TP63). EEC is suspected when patients have cleft hands or feet, polydactyly, and syndactyly, abnormal development of the ectodermally derived structures, and orofacial clefting. Genitourinary (GU) anomalies have been identified in patients with EEC, yet these are often under-recognized and under-reported. The available literature on sonographic prenatal findings is sparse, especially when considering GU anomalies. METHODS: We present the case of a male stillborn fetus, who was found antenatally to have multicystic dysplastic kidneys and anhydramnios. Following the termination of pregnancy, examination and autopsy further revealed unilateral polydactyly and bilateral syndactyly which had not been previously identified on antenatal ultrasound. RESULTS: Whole-exome sequencing (WES) revealed a de novo heterozygous pathogenic variant in exon 5 of the TP63 gene: p.His247Arg: c.740A>G (NM_003722.4) which has been reported in the literature. The His247Arg variant has been published as a pathogenic variant in association with EEC, both with and without orofacial clefting. CONCLUSION: Our prenatal case expands the phenotypic spectrum of TP63-related disorders in general. In addition, it adds to the phenotype associated with the His247Arg pathogenic variant responsible for EEC. Further, we highlight the importance of WES as a postnatal tool to help clarify unexpected findings, and as a way to add to the spectrum of existing phenotypes of known single-gene disorders.