RESUMO
We examined the environmental dissemination of Acinetobacter nosocomialis multilocus sequence typing clonal complex 260/71 in Rio de Janeiro, Brazil, including water from a dam and food samples. The increasing use of sequence based methods has demonstrated a large, previously unpredicted, dissemination of bacteria that may serve as opportunistic pathogens.
Assuntos
Infecções por Acinetobacter/microbiologia , Acinetobacter/isolamento & purificação , Estado Terminal , Microbiologia de Alimentos , Microbiologia da Água , Acinetobacter/classificação , Acinetobacter/genética , Infecções por Acinetobacter/epidemiologia , Brasil/epidemiologia , Análise por Conglomerados , Genótipo , Humanos , Epidemiologia Molecular , Tipagem de Sequências MultilocusAssuntos
Antibacterianos/farmacologia , Farmacorresistência Bacteriana , Gonorreia/epidemiologia , Gonorreia/microbiologia , Neisseria gonorrhoeae/efeitos dos fármacos , Neisseria gonorrhoeae/genética , Filogenia , Brasil/epidemiologia , Feminino , Genoma Bacteriano , Genômica/métodos , Humanos , Masculino , Testes de Sensibilidade Microbiana , Tipagem de Sequências Multilocus , Neisseria gonorrhoeae/classificação , Sequenciamento Completo do GenomaRESUMO
The main objective of this study was to assess the frequency and possible sources of colonization and infection by Acinetobacter in the intensive care unit (ICU) of a university hospital in Rio de Janeiro, Brazil, and characterize the isolates for relatedness to internationally and locally disseminated lineages. Patients consecutively admitted to the ICU from April 2007 to April 2008 were screened for colonization and infection. Species were identified by rpoB sequencing. The presence of acquired and intrinsic carbapenemase genes was assessed by polymerase chain reaction (PCR). Strains were typed by random amplification of polymorphic DNA (RAPD)-PCR, pulsed-field gel electrophoresis, and multilocus sequence typing (MLST) using the schemes hosted at the University of Oxford (UO) and Institut Pasteur (IP). Of 234 patients, 98 (42%) had at least one specimen positive for the Acinetobacter isolate, and 24 (10%) had infection. A total of 22 (92%) infections were caused by Acinetobacter baumannii and one each (4%) by Acinetobacter nosocomialis and Acinetobacter berezinae. A. baumannii isolates from 60 patients belonged to RAPD types that corresponded to MLST clonal complexes (CCs) 109/1 (UO/IP scheme, known as International Clone I), CC 110/110 (UO/IP), CC 113/79 (UO/IP), and CC 104/15 (UO/IP). Most CCs were carbapenem resistant and carried the bla(OXA-23)-like gene. Strains were introduced by patients transferred from other wards of the same hospital (11 patients, 18%) or acquired from cross-transmission within the ICU (49 patients, 82%). A. nosocomialis lineage sequence type 260 colonized 10% of the whole study population. A. baumannii have become established in this hospital as a part of a global epidemic of successful clones. Once introduced into the hospital, such clones have become entrenched among patients in the ICU.
Assuntos
Infecções por Acinetobacter/epidemiologia , Acinetobacter baumannii/isolamento & purificação , Antibacterianos/farmacologia , Unidades de Terapia Intensiva , Acinetobacter/efeitos dos fármacos , Acinetobacter/genética , Acinetobacter/isolamento & purificação , Infecções por Acinetobacter/microbiologia , Acinetobacter baumannii/efeitos dos fármacos , Acinetobacter baumannii/genética , Proteínas de Bactérias/genética , Técnicas de Tipagem Bacteriana , Brasil , Carbapenêmicos/farmacologia , Estudos de Coortes , Infecção Hospitalar/epidemiologia , Infecção Hospitalar/microbiologia , Farmacorresistência Bacteriana , Eletroforese em Gel de Campo Pulsado , Hospitais Universitários , Humanos , Tipagem de Sequências Multilocus , Reação em Cadeia da Polimerase , Estudos Prospectivos , Técnica de Amplificação ao Acaso de DNA Polimórfico , beta-Lactamases/genéticaAssuntos
Antibacterianos/farmacologia , Cefixima/farmacologia , Ceftriaxona/farmacologia , Gonorreia/tratamento farmacológico , Neisseria gonorrhoeae/genética , Adulto , Brasil , Feminino , Gonorreia/microbiologia , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala , Humanos , Masculino , Testes de Sensibilidade Microbiana , Pessoa de Meia-Idade , Mutação , Neisseria gonorrhoeae/efeitos dos fármacos , Neisseria gonorrhoeae/isolamento & purificação , Análise de Sequência de DNA , Espectrometria de Massas por Ionização e Dessorção a Laser Assistida por Matriz , Sequenciamento Completo do Genoma , Adulto JovemRESUMO
Objetivos: Investigar isolados de Pseudomonas aeruginosa de uma estação de tratamento de efluentes hospitalares (ETAR), enfocando os mecanismos enzimáticos de resistência aos b-lactâmicos e a relação genética entre os isolados. Métodos e Resultados: Quarenta e um Ps. aeruginosas recuperadas de aHWTP foram identificadas pela amplificação do gene 16S rRNA. A produção de b-lactamase foi rastreada por difusão em disco, CHROMagar de espectro estendido de lactamase (ESBL) e tiras de b-lactamase. Os isolados produtores de b-lactamase e ESBL foram investigados por PCR quanto à presença de Genes codificadores de ESBL, metalo-b-lactamase e Klebsiella pneumoniaecarbapenemase. Trinta e quatro isolados (83%) foram resistentes a pelo menos um antibiótico pertencente a três ou mais classes. Destes 34 isolados, 28 (82%) foram classificados como multirresistentes (MDR) e 6 (18%) extensivamente resistentes (XDR). e 15 tipos de sequenciamento respectivamente. Clonal Complex 244 (CC244) mostra o potencial patogênico deste clone portador de cepas MDR e XDR de fontes clínicas, ambientais e de resíduos hospitalares. o Estudo: A grande diversidade genética de Ps. aeruginos são recuperados de HWTP constantemente liberados em sistemas aquáticos permitem a disseminação de organismos e genes resistentes a antimicrobianos.