Detalhe da pesquisa
1.
MetaMicrobesOnline: phylogenomic analysis of microbial communities.
Nucleic Acids Res
; 41(Database issue): D648-54, 2013 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23203984
2.
RegPrecise web services interface: programmatic access to the transcriptional regulatory interactions in bacteria reconstructed by comparative genomics.
Nucleic Acids Res
; 40(Web Server issue): W604-8, 2012 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22700702
3.
Finished genome of the fungal wheat pathogen Mycosphaerella graminicola reveals dispensome structure, chromosome plasticity, and stealth pathogenesis.
PLoS Genet
; 7(6): e1002070, 2011 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21695235
4.
A bacterial sensor taxonomy across earth ecosystems for machine learning applications.
mSystems
; 9(1): e0002623, 2024 Jan 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38078749
5.
Metagenome-assembled genome extraction and analysis from microbiomes using KBase.
Nat Protoc
; 18(1): 208-238, 2023 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36376589
6.
A universal TagModule collection for parallel genetic analysis of microorganisms.
Nucleic Acids Res
; 38(14): e146, 2010 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20494978
7.
MicrobesOnline: an integrated portal for comparative and functional genomics.
Nucleic Acids Res
; 38(Database issue): D396-400, 2010 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19906701
8.
iVirus 2.0: Cyberinfrastructure-supported tools and data to power DNA virus ecology.
ISME Commun
; 1(1): 77, 2021 Dec 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36765102
9.
A genomic catalog of Earth's microbiomes.
Nat Biotechnol
; 39(4): 499-509, 2021 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33169036
10.
FastTree: computing large minimum evolution trees with profiles instead of a distance matrix.
Mol Biol Evol
; 26(7): 1641-50, 2009 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19377059
11.
The DNA sequence and biology of human chromosome 19.
Nature
; 428(6982): 529-35, 2004 Apr 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15057824
12.
Genome sequence of the lignocellulose-bioconverting and xylose-fermenting yeast Pichia stipitis.
Nat Biotechnol
; 25(3): 319-26, 2007 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17334359
13.
Snapshot of iron response in Shewanella oneidensis by gene network reconstruction.
BMC Genomics
; 10: 131, 2009 Mar 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19321007
14.
Contribution of mobile genetic elements to Desulfovibrio vulgaris genome plasticity.
Environ Microbiol
; 11(9): 2244-52, 2009 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19737303
15.
Metabolic flux analysis of Shewanella spp. reveals evolutionary robustness in central carbon metabolism.
Biotechnol Bioeng
; 102(4): 1161-9, 2009 Mar 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19031428
16.
Two rounds of whole genome duplication in the ancestral vertebrate.
PLoS Biol
; 3(10): e314, 2005 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16128622
17.
Orthologous transcription factors in bacteria have different functions and regulate different genes.
PLoS Comput Biol
; 3(9): 1739-50, 2007 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17845071
18.
TreeFam: a curated database of phylogenetic trees of animal gene families.
Nucleic Acids Res
; 34(Database issue): D572-80, 2006 Jan 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16381935
19.
Publisher Correction: Metagenome-assembled genome extraction and analysis from microbiomes using KBase.
Nat Protoc
; 18(2): 658, 2023 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36451056
20.
Complete genome sequence of Pseudomonas stutzeri strain RCH2 isolated from a Hexavalent Chromium [Cr(VI)] contaminated site.
Stand Genomic Sci
; 12: 23, 2017.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28194258