Detalhe da pesquisa
1.
Using Unassigned NMR Chemical Shifts to Model RNA Secondary Structure.
J Phys Chem A
; 126(17): 2739-2745, 2022 May 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35470661
2.
Navigating Chemical Space by Interfacing Generative Artificial Intelligence and Molecular Docking.
J Chem Inf Model
; 61(11): 5589-5600, 2021 11 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34633194
3.
CS-Annotate: A Tool for Using NMR Chemical Shifts to Annotate RNA Structure.
J Chem Inf Model
; 61(4): 1545-1549, 2021 04 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33797909
4.
PyShifts: A PyMOL Plugin for Chemical Shift-Based Analysis of Biomolecular Ensembles.
J Chem Inf Model
; 60(3): 1073-1078, 2020 03 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32011127
5.
A rapid solvent accessible surface area estimator for coarse grained molecular simulations.
J Comput Chem
; 38(15): 1270-1274, 2017 06 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28419507
6.
Can Holo NMR Chemical Shifts be Directly Used to Resolve RNA-Ligand Poses?
J Chem Inf Model
; 56(2): 368-76, 2016 Feb 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26771259
7.
Slowdown of Interhelical Motions Induces a Glass Transition in RNA.
Biophys J
; 108(12): 2876-85, 2015 Jun 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26083927
8.
PCASSO: a fast and efficient Cα-based method for accurately assigning protein secondary structure elements.
J Comput Chem
; 35(24): 1757-61, 2014 Sep 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24995959
9.
Discovery of selective bioactive small molecules by targeting an RNA dynamic ensemble.
Nat Chem Biol
; 7(8): 553-9, 2011 Jun 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21706033
10.
In Silico Discovery of Group II Intron RNA Splicing Inhibitors.
ACS Chem Biol
; 18(9): 1968-1975, 2023 09 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37602469
11.
Structural basis for control of bacterial RNA polymerase pausing by a riboswitch and its ligand.
Nat Struct Mol Biol
; 30(7): 902-913, 2023 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37264140
12.
Lifetime of ground conformational state determines the activity of structured RNA.
Res Sq
; 2023 May 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37292668
13.
Using Selectively Scaled Molecular Dynamics Simulations to Assess Ligand Poses in RNA Aptamers.
J Chem Theory Comput
; 18(9): 5703-5709, 2022 Sep 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35926894
14.
Structure and function of glycosylated tandem repeats from Candida albicans Als adhesins.
Eukaryot Cell
; 9(3): 405-14, 2010 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19820118
15.
Constructing RNA dynamical ensembles by combining MD and motionally decoupled NMR RDCs: new insights into RNA dynamics and adaptive ligand recognition.
Nucleic Acids Res
; 37(11): 3670-9, 2009 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19369218
16.
Mining for Ligandable Cavities in RNA.
ACS Med Chem Lett
; 12(6): 928-934, 2021 Jun 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34141071
17.
RNA Ensembles from Solvent Accessibility Data: Application to the SAM-I Riboswitch Aptamer Domain.
J Phys Chem B
; 125(14): 3486-3493, 2021 04 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33818089
18.
Probabilistic Modeling of RNA Ensembles Using NMR Chemical Shifts.
J Phys Chem B
; 125(35): 9970-9978, 2021 09 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34449236
19.
Quantum Mechanics Helps Uncover Atypical Recognition Features in the Flavin Mononucleotide Riboswitch.
J Phys Chem B
; 125(30): 8342-8350, 2021 08 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34310879
20.
Constructing atomic-resolution RNA structural ensembles using MD and motionally decoupled NMR RDCs.
Methods
; 49(2): 167-73, 2009 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19699798