Detalhe da pesquisa
1.
Infection and inflammation stimulate expansion of a CD74+ Paneth cell subset to regulate disease progression.
EMBO J
; 42(21): e113975, 2023 11 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37718683
2.
Benchmarking cell-type clustering methods for spatially resolved transcriptomics data.
Brief Bioinform
; 24(1)2023 01 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36410733
3.
Differential variability analysis of single-cell gene expression data.
Brief Bioinform
; 24(5)2023 09 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37598422
4.
Expression activation of over 70% of Chlamydia trachomatis genes during the first hour of infection.
Infect Immun
; 92(3): e0053923, 2024 Mar 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38299827
5.
Metabolomic and Transcriptomic Correlative Analyses in Germ-Free Mice Link Lacticaseibacillus rhamnosus GG-Associated Metabolites to Host Intestinal Fatty Acid Metabolism and ß-Oxidation.
Lab Invest
; 104(4): 100330, 2024 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38242234
6.
scAce: an adaptive embedding and clustering method for single-cell gene expression data.
Bioinformatics
; 39(9)2023 09 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37672035
7.
Selecting gene features for unsupervised analysis of single-cell gene expression data.
Brief Bioinform
; 22(6)2021 11 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34351383
8.
Phitest for analyzing the homogeneity of single-cell populations.
Bioinformatics
; 38(9): 2639-2641, 2022 04 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35238346
9.
Temporal and structural patterns of hepatitis B virus integrations in hepatocellular carcinoma.
J Med Virol
; 95(10): e29187, 2023 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37877809
10.
AIDE: annotation-assisted isoform discovery with high precision.
Genome Res
; 29(12): 2056-2072, 2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31694868
11.
EpiAlign: an alignment-based bioinformatic tool for comparing chromatin state sequences.
Nucleic Acids Res
; 47(13): e77, 2019 07 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31045217
12.
A statistical simulator scDesign for rational scRNA-seq experimental design.
Bioinformatics
; 35(14): i41-i50, 2019 07 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31510652
13.
Epigenome overlap measure (EPOM) for comparing tissue/cell types based on chromatin states.
BMC Genomics
; 17 Suppl 1: 10, 2016 Jan 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26817822
14.
spVC for the detection and interpretation of spatial gene expression variation.
Genome Biol
; 25(1): 103, 2024 Apr 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38641849
15.
scBiG for representation learning of single-cell gene expression data based on bipartite graph embedding.
NAR Genom Bioinform
; 6(1): lqae004, 2024 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38288376
16.
Requirement of GrgA for Chlamydia infectious progeny production, optimal growth, and efficient plasmid maintenance.
mBio
; 15(1): e0203623, 2024 Jan 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38112466
17.
Lactobacillus rhamnosus GG Stimulates Dietary Tryptophan-Dependent Production of Barrier-Protecting Methylnicotinamide.
Cell Mol Gastroenterol Hepatol
; 2024 Apr 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38641207
18.
Requirement of GrgA for Chlamydia infectious progeny production, optimal growth, and efficient plasmid maintenance.
bioRxiv
; 2023 Aug 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37577610
19.
scINSIGHT for interpreting single-cell gene expression from biologically heterogeneous data.
Genome Biol
; 23(1): 82, 2022 03 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35313930
20.
The scINSIGHT Package for Integrating Single-Cell RNA-Seq Data from Different Biological Conditions.
J Comput Biol
; 29(11): 1233-1236, 2022 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35920848