Detalhe da pesquisa
1.
Differences in molecular sampling and data processing explain variation among single-cell and single-nucleus RNA-seq experiments.
Genome Res
; 34(2): 179-188, 2024 Mar 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38355308
2.
A Bayesian framework to study tumor subclone-specific expression by combining bulk DNA and single-cell RNA sequencing data.
Genome Res
; 34(1): 94-105, 2024 Feb 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38195207
3.
quickBAM: a parallelized BAM file access API for high-throughput sequence analysis informatics.
Bioinformatics
; 39(8)2023 08 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37498562
4.
GIGGLE: a search engine for large-scale integrated genome analysis.
Nat Methods
; 15(2): 123-126, 2018 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29309061
5.
Subclonal evolution of CLL driver mutations is associated with relapse in ibrutinib- and acalabrutinib-treated patients.
Blood
; 140(4): 401-405, 2022 07 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35476648
6.
SpeedSeq: ultra-fast personal genome analysis and interpretation.
Nat Methods
; 12(10): 966-8, 2015 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26258291
7.
An integrated map of genetic variation from 1,092 human genomes.
Nature
; 491(7422): 56-65, 2012 Nov 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23128226
8.
Mapping copy number variation by population-scale genome sequencing.
Nature
; 470(7332): 59-65, 2011 Feb 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21293372
9.
Tangram: a comprehensive toolbox for mobile element insertion detection.
BMC Genomics
; 15: 795, 2014 Sep 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25228379
10.
Whole genome profiling of spontaneous and chemically induced mutations in Toxoplasma gondii.
BMC Genomics
; 15: 354, 2014 May 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24885922
11.
Scotty: a web tool for designing RNA-Seq experiments to measure differential gene expression.
Bioinformatics
; 29(5): 656-7, 2013 Mar 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23314327
12.
Demographic history and rare allele sharing among human populations.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(29): 11983-8, 2011 Jul 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21730125
13.
A comprehensive map of mobile element insertion polymorphisms in humans.
PLoS Genet
; 7(8): e1002236, 2011 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21876680
14.
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotype and phenotype in chronic lymphocytic leukemia.
bioRxiv
; 2024 Mar 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38559060
15.
Variant discovery in targeted resequencing using whole genome amplified DNA.
BMC Genomics
; 14: 468, 2013 Jul 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23837845
16.
Genetic basis for phenotypic differences between different Toxoplasma gondii type I strains.
BMC Genomics
; 14: 467, 2013 Jul 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23837824
17.
ART: a next-generation sequencing read simulator.
Bioinformatics
; 28(4): 593-4, 2012 Feb 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22199392
18.
Copy Number Variation detection from 1000 Genomes Project exon capture sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 13: 305, 2012 Nov 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23157288
19.
bam.iobio: a web-based, real-time, sequence alignment file inspector.
Nat Methods
; 11(12): 1189, 2014 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25423016
20.
BamTools: a C++ API and toolkit for analyzing and managing BAM files.
Bioinformatics
; 27(12): 1691-2, 2011 Jun 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21493652