Molecular Detection of Histoplasma capsulatum in Antarctica.

We detected Histoplasma capsulatum in soil and penguin excreta in the Antarctic Peninsula by sequencing after performing species-specific PCR, confirming previous observations that this pathogen occurs more broadly than suspected. This finding highlights the need for surveillance of emerging agents of systemic mycoses and their transmission among regions, animals, and humans in Antarctica.

Epidemiological, clinical, and genomic landscape of coccidioidomycosis in northeastern Brazil.

Coccidioidomycosis, listed as a priority mycosis by the WHO, is endemic in the United States but often overlooked in Central and South America. Employing a multi-institutional approach, we investigate how disease characteristics, pathogen genetic variation, and environmental factors impact coccidioidomycosis epidemiology and outcomes in South America. We identified 292 cases (1978-2021) and 42 outbreaks in Piauí and Maranhão states, Brazil, the largest series outside the US/Mexico epidemic zone. The male-to-female ratio was 57.4:1 and the most common activity was armadillo hunting (91.1%) 4 to 30 days before symptom onset. Most patients (92.8%) exhibited typical acute pulmonary disease, with cough (93%), fever (90%), and chest pain (77%) as predominant symptoms. The case fatality rate was 8%. Our negative binomial regression model indicates that reduced precipitation levels in the current (p = 0.015) and preceding year (p = 0.001) predict heightened incidence. Unlike other hotspots, acidic soil characterizes this region. Brazilian strains differ genomically from other C. posadasii lineages. Northeastern Brazil presents a distinctive coccidioidomycosis profile, with armadillo hunters facing elevated risks. Low annual rainfall emerges as a key factor in increasing cases. A unique C. posadasii lineage in Brazil suggests potential differences in environmental, virulence, and/or pathogenesis traits compared to other Coccidioides genotypes.

Candida tropicalis: Epidemiologia Molecular de isolados clínicos em Hospital Universitário de Minas Gerais

O aumento da prevalência de infecções nosocomiais causadas por Candida tropicalis descreve a espécie como um patógeno emergente em escala mundial. Esse fenômeno, somado a fatores predisponentes como o aumento no número de casos de pacientes gravemente imunocomprometidos, elevam as taxas de morbimortalidade associadas às infecções por C. tropicalis. Frente a esse cenário, o estudo objetivou avaliar por meio de ferramentas moleculares de menor custo, a epidemiologia dos isolados de C. tropicalis identificados como agentes etiológicos de quadros de candidíase invasiva em um Hospital Universitário de Minas Gerais. Um número de 110 isolados fúngicos, oriundos de episódios de candidíase que ocorreram no período de janeiro de 2013 a janeiro de 2017, presuntivamente identificados como C. tropicalis, por meio de metodologia convencional, foram incluídos no estudo. A identificação fenotípica dos isolados envolveu avaliação em CHROMagar® Candida, onde 93 isolados desenvolveram coloração azul e 17 apresentaram coloração inespecífica. A avaliação da macromorfologia dos isolados exibiu 4 variantes morfológicas descritas como cotonosa, micelial, lisa e rugosa. A identificação bioquímica dos isolados foi realizada em sistema Vitek® 2 YST Card e apresentou 17 perfis bioquímicos distintos compatíveis com a identificação de C. tropicalis. No entanto, o sistema não conseguiu identificar 4 dos 110 isolados testados. A identificação molecular dos isolados foi realizada pela amplificação e posterior sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2 do DNA ribossomal, e a partir da avaliação das sequências de DNA dos isolados foi possível avaliar a existência de 12 haplótipos com alta taxa de diversidade haplotípica. A análise filogenética dos haplótipos determinou o agrupamento dos haplótipos em 4 clados. O clado 1 agrupa os haplótipos 1, 3, 4 e 6 e concentra 76% dos isolados. A tipagem dos isolados pela amplificação das regiões repetitivas hipervariáveis (minissatélites) M13 evidenciou a existência de 7 perfis moleculares. Os isolados inseridos no estudo foram provenientes de 64 pacientes, dos quais 52% eram do sexo masculino, a mediana de idade observada foi de 61,7 anos e o principal motivo de internação foi associado a doenças crônico-degenerativas, seguido pelas doenças hematológicas e/ou neoplasias. A análise multivariada dos fatores de risco associados ao quadro de candidíase invasiva, nos permitiu inferir que o uso de sonda urinária [OR 84,4, IC95% 4,4-1634,2], submissão ao procedimento de transfusão sanguínea [OR 8,0, IC95% 1,1- 56,8], internação no CTI [OR 77,7, IC95% 3,7-1651,3] e o não uso de antifúngicos [OR 4,5, IC95% 1,3-15,1] foram associados a um aumento da chance de óbito. Enquanto, a análise de sobrevida determinou que os pacientes que apresentaram infecção por cepas pertencentes ao clado ITS 3 (H2) exibiram o menor tempo de sobrevida e maior risco de óbito [HR 12,49, IC95% 2,27-68,77] comparado aos pacientes acometidos por isolados do clado ITS 4 (H5, H8 e H10). As metodologias empregadas nesse estudo demonstraram robustez e poder discriminatório para avaliar os perfis genotípicos circulantes na unidade hospitalar, elucidaram aspectos epidemiológicos e identificaram as prováveis correlações clínicas entre os aspectos genotípicos dos isolados e o desfecho clínico do paciente.