RESUMO
Public health concerns about recent viral epidemics have motivated researchers to seek novel ways to understand pathogen infection in native, wildlife hosts. With its deep history of tools and perspectives for understanding the abundance and distribution of organisms, ecology can shed new light on viral infection dynamics. However, datasets allowing deep explorations of viral communities from an ecological perspective are lacking. We sampled 1086 bats from two, adjacent Puerto Rican caves and tested them for infection by herpesviruses, resulting in 3131 short, viral sequences. Using percent identity of nucleotides and a machine learning algorithm (affinity propagation), we categorized herpesviruses into 43 operational taxonomic units (OTUs) to be used in place of species in subsequent ecological analyses. Herpesvirus metacommunities demonstrated long-tailed rank frequency distributions at all analyzed levels of host organization (i.e., individual, population, and community). Although 13 herpesvirus OTUs were detected in more than one host species, OTUs generally exhibited host specificity by infecting a single core host species at a significantly higher prevalence than in all satellite species combined. We describe the natural history of herpesvirus metacommunities in Puerto Rican bats and suggest that viruses follow the general law that communities comprise few common and many rare species. To guide future efforts in the field of viral ecology, hypotheses are presented regarding mechanisms that contribute to these patterns.
RESUMO
Este estudo compara a resposta de uma comunidade aves à exploração madeireira de baixo impacto através da distribuição das espécies em floresta controle e manejada ao longo de cinco anos com amostragem pré e pós-exploração. O procedimento de ordenação mostrou que a similaridade da comunidade de aves após a exploração madeireira foi menor que a similaridade entre as amostras do período de pré-exploração. Além disso, a ordem das abundâncias das 43 espécies mais comuns foi alterada entre o período anterior à exploração e 3 a 4 anos após a exploração na floresta manejada. A exploração afetou as taxas de captura de 20 espécies, diretamente ou através de uma interação com o tempo. Os insetívoros terrícolas e os insetívoros que seguem bandos mistos foram as guildas mais afetadas pela exploração madeireira. Ambas as guildas mostraram declínio, correlacionado com o tempo, em suas abundâncias em floresta manejada. Insetívoros seguidores de formigas e insetívoros arborícolas não apresentaram diferenças entre a floresta manejada e controle, apesar de algumas espécies dessas guildas terem apresentado efeitos relacionados ao manejo florestal, diretamente ou através de uma interação entre o tempo e o manejo. Frugívoros também não apresentaram efeitos significativos relacionados ao manejo florestal. Nectarívoros aumentaram tanto na floresta explorada como na floresta controle. Efeitos temporais de aumento ou declínio observados em guildas e em 12 espécies ocorreram tanto na floresta controle como na floresta explorada. Este resultado sugere que mudanças temporais na área explorada podem estar relacionadas à sucessão enquanto que mudanças temporais na floresta controle podem estar relacionados à exploração com intensidade de 40m³/ha de parcelas adjacentes.
This study compares the avian response to low impact selective logging by comparing bird species distribution in control and cut forest during five years, with before and post-harvest samples. Ordination analysis showed that the similarity of the bird community post-harvest was lesser than the similarity of samples before harvest. Moreover, the order of abundances of the 43 most common species changed between before and 3 to 4 years post-harvest in the logged forest. Logging affected capture rates for 20 species, either directly or with an interaction with time. The terrestrial insectivorous and mixed-species flocks were the guilds most affected by logging. Both guilds showed decline, correlated with time, in abundances in cut forest. Obligate army ant followers and arboreal insectivorous did not show differences between cut and control forest, but some species in these guilds showed logging effects, either directly or with an interaction between time and logging. Frugivores also did not show logging effects. Nectarivores increased in both the cut forest and in the control forest. Temporal effects of increase or decline occurred in guilds and in 12 species occurring in the cut and control forest. This result suggests that temporal changes in the cut forest may have resulted from succession and temporal changes in the control forest may have resulted from nearby harvest with 40m³/ha intensity in adjacent forest blocks.
Assuntos
Aves , Florestas , Ecossistema Amazônico , Exploração de Recursos NaturaisRESUMO
O estado toxionômico dos mamíferos da Caatinga, avaliado por Mares et al. (1981), é modificado aqui, e uma lista dos mamíferos sobrevivente é incluída. Uma revista breve das contribuiçöes recentes a literatura científica sobre os mamíferos da Caatinga é transmitida também