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Nat Commun ; 12(1): 5933, 2021 10 11.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34635670

RESUMO

GTPases are regulators of cell signaling acting as molecular switches. The translational GTPase EF-G stands out, as it uses GTP hydrolysis to generate force and promote the movement of the ribosome along the mRNA. The key unresolved question is how GTP hydrolysis drives molecular movement. Here, we visualize the GTPase-powered step of ongoing translocation by time-resolved cryo-EM. EF-G in the active GDP-Pi form stabilizes the rotated conformation of ribosomal subunits and induces twisting of the sarcin-ricin loop of the 23 S rRNA. Refolding of the GTPase switch regions upon Pi release initiates a large-scale rigid-body rotation of EF-G pivoting around the sarcin-ricin loop that facilitates back rotation of the ribosomal subunits and forward swiveling of the head domain of the small subunit, ultimately driving tRNA forward movement. The findings demonstrate how a GTPase orchestrates spontaneous thermal fluctuations of a large RNA-protein complex into force-generating molecular movement.


Assuntos
Escherichia coli/genética , Fator G para Elongação de Peptídeos/química , Biossíntese de Proteínas , RNA Mensageiro/química , RNA Ribossômico 23S/química , RNA de Transferência/química , Ribossomos/metabolismo , Sítios de Ligação , Fenômenos Biomecânicos , Microscopia Crioeletrônica , Escherichia coli/metabolismo , Guanosina Trifosfato/química , Guanosina Trifosfato/metabolismo , Hidrólise , Cinética , Modelos Moleculares , Fator G para Elongação de Peptídeos/genética , Fator G para Elongação de Peptídeos/metabolismo , Ligação Proteica , Conformação Proteica em alfa-Hélice , Conformação Proteica em Folha beta , Dobramento de Proteína , Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas , RNA Mensageiro/genética , RNA Mensageiro/metabolismo , RNA Ribossômico 23S/genética , RNA Ribossômico 23S/metabolismo , RNA de Transferência/genética , RNA de Transferência/metabolismo , Ribossomos/ultraestrutura , Termodinâmica
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