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Use of environmental DNA in assessment of fish functional and phylogenetic diversity.
Marques, Virginie; Castagné, Paul; Polanco, Andréa; Borrero-Pérez, Giomar Helena; Hocdé, Régis; Guérin, Pierre-Édouard; Juhel, Jean-Baptiste; Velez, Laure; Loiseau, Nicolas; Letessier, Tom Bech; Bessudo, Sandra; Valentini, Alice; Dejean, Tony; Mouillot, David; Pellissier, Loïc; Villéger, Sébastien.
Afiliação
  • Marques V; MARBEC, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, IRD, Montpellier, France.
  • Castagné P; CEFE, Univ. Montpellier, CNRS, EPHE-PSL University, IRD, Univ Paul Valery Montpellier 3, Montpellier, France.
  • Polanco A; MARBEC, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, IRD, Montpellier, France.
  • Borrero-Pérez GH; Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras-INVEMAR, Colombia, Museo de Historia Natural Marina de Colombia (MHNMC), Programa de Biodiversidad y Ecosistemas Marinos, Santa Marta, Colombia.
  • Hocdé R; Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras-INVEMAR, Colombia, Museo de Historia Natural Marina de Colombia (MHNMC), Programa de Biodiversidad y Ecosistemas Marinos, Santa Marta, Colombia.
  • Guérin PÉ; MARBEC, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, IRD, Montpellier, France.
  • Juhel JB; CEFE, Univ. Montpellier, CNRS, EPHE-PSL University, IRD, Univ Paul Valery Montpellier 3, Montpellier, France.
  • Velez L; MARBEC, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, IRD, Montpellier, France.
  • Loiseau N; MARBEC, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, IRD, Montpellier, France.
  • Letessier TB; MARBEC, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, IRD, Montpellier, France.
  • Bessudo S; Institute of Zoology, Zoological Society of London, London, UK.
  • Valentini A; Fundación Malpelo y Otros Ecosistemas Marinos, Bogotá, Colombia.
  • Dejean T; SPYGEN, Le Bourget-du-Lac, France.
  • Mouillot D; SPYGEN, Le Bourget-du-Lac, France.
  • Pellissier L; MARBEC, Univ. Montpellier, CNRS, Ifremer, IRD, Montpellier, France.
  • Villéger S; Institut Universitaire de France, Paris, France.
Conserv Biol ; 35(6): 1944-1956, 2021 12.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34224158
RESUMEN
Uso de ADN Ambiental en la Evaluación de la Diversidad Funcional y Filogenética de los Peces Resumen La evaluación del impacto de los cambios globales y la efectividad de la protección es un paso fundamental para el monitoreo de peces marinos. La mayoría de los métodos tradicionales de censos son demandantes o destructivos, por lo que las estrategias no letales y no intrusivas basadas en videograbaciones y en el ADN ambiental (ADNa) son alternativas a los censos visuales submarinos y a la pesca. Sin embargo, todavía no se conoce la habilidad que tienen estos métodos para detectar diferentes factores de la biodiversidad más allá de la diversidad taxonómica. Para los peces óseos y los elasmobranquios, comparamos el desempeño de la caracterización genética con ADNa y del video remoto de larga duración para evaluar la diversidad funcional y filogenética de las especies. Usamos diez muestras de ADNa tomadas de 30 litros de agua cada una y 25 horas de vídeos submarinos grabados durante cuatro días en la Isla Malpelo (costa del Pacífico de Colombia), un área marina protegida remota. La caracterización genética con el ADNa detectó 66% más unidades taxonómicas moleculares operacionales (UTMOs) que el video. Encontramos 66 y 43 entidades funcionales con un solo marcador de ADNa y con el video, respectivamente, y una riqueza funcional más alta para el ADNa que el video. A pesar de los vacíos en las bases de datos genéticos usadas como referencia, el ADNa también detectó una diversidad filogenética más alta que aquella en los videos; las curvas de acumulación mostraron cómo un solo transecto de ADNa detectó tanta diversidad filogenética como 25 horas de video. La caracterización genética con ADN ambiental puede usarse para censar los factores de biodiversidad de manera asequible, eficiente y certera en los sistemas marinos. Aunque las atribuciones taxonómicas todavía están limitadas por la cobertura de especies en las bases de datos genéticos de referencia, el uso de los UTMOs resalta el potencial que tiene la caracterización genética con ADNa una vez que las bases de datos de referencia sean expandidas.
Assuntos
Palavras-chave

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: DNA Ambiental Limite: Animals Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: DNA Ambiental Limite: Animals Idioma: En Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article