Beware to ignore the rare: how imputing zero-values can improve the quality of 16S rRNA gene studies results.

Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; Di Camillo, Barbara

Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; Di Camillo, Barbara.

Afiliação

Baruzzo G; Department of Information Engineering, University of Padova, Padua, Italy.
Patuzzi I; Department of Information Engineering, University of Padova, Padua, Italy.
Di Camillo B; Microbial Ecology Unit, Istituto Zooprofilattico Sperimentale Delle Venezie, Padua, Italy.

BMC Bioinformatics ; 22(Suppl 15): 618, 2022 Feb 07.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35130833

Assuntos

Bactérias; Análise de Dados; Bactérias/genética; Genes de RNAr; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; RNA Ribossômico 16S/genética; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

16S rDNA-Seq; Benchmarking; Count data; Count preprocessing; Count simulation; Normalization; Sparsity; Zero-imputation

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Análise de Dados Idioma: En Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article

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