Construction of an index of information from clinical practice in Radiology and Imaging Diagnosis based on text mining and thesaurus / Construção de um índex de informação da prática clínica em Radiologia e Diagnóstico por Imagem baseada em mineração de texto e tesauro

Objective To construct a Portuguese language index of information on the practice of diagnostic radiology in order to improve the standardization of the medical language and terminology. Materials and Methods A total of 61,461 definitive reports were collected from the database of the Radiology Information System at Hospital das Clínicas – Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (RIS/HCFMRP) as follows: 30,000 chest x-ray reports; 27,000 mammography reports; and 4,461 thyroid ultrasonography reports. The text mining technique was applied for the selection of terms, and the ANSI/NISO Z39.19-2005 standard was utilized to construct the index based on a thesaurus structure. The system was created in *html. Results The text mining resulted in a set of 358,236 (n = 100%) words. Out of this total, 76,347 (n = 21%) terms were selected to form the index. Such terms refer to anatomical pathology description, imaging techniques, equipment, type of study and some other composite terms. The index system was developed with 78,538 *html web pages. Conclusion The utilization of text mining on a radiological reports database has allowed the construction of a lexical system in Portuguese language consistent with the clinical practice in Radiology. .

O perfil brasileiro de propriedade intelectual em radiologia e diagnóstico por imagem em um contexto internacional, nos anos 2000-2009 / The Brazilian profile of intellectual property in radiology and imaging diagnosis in an international context in the years 2000 to 2009

OBJETIVO: Analisar a inovação tecnológica brasileira na área de radiologia e diagnóstico por imagem, em termos de indicadores de patentes. MATERIAIS E MÉTODOS: Este é um estudo analítico-exploratório de informações recuperadas por meio de consultas cruzadas nas bases de dados dos escritórios de propriedade intelectual do Brasil (Instituto Nacional da Propriedade Industrial - INPI), dos Estados Unidos (United States Patent and Trademark Office - USPTO) e da Europa (European Patent Office - EPO). RESULTADOS: Foram encontradas 277.057 patentes. Desse total, 7.800 foram registradas no INPI (3 por cento), 65.428 (24 por cento) registradas no EPO e 203.829 (73 por cento) emitidas no USPTO. O Brasil é o país signatário em 1.732 patentes publicadas no INPI, 80 no EPO e 26 no escritório USPTO. Globalmente, 219.993 (79 por cento) patentes referiam-se a dispositivos eletrônicos ligados a informática em saúde, ultrassonografia, ressonância magnética, tomografia computadorizada e procedimentos de geração, comunicação e arquivamento de imagens, e 57.064 (21 por cento) das patentes tratavam das tecnologias relacionadas a radioproteção e dosimetria, física nuclear, eletroterapia, terapia magnética e radioterapia. CONCLUSÃO: Os resultados obtidos apontam para a fragilidade da produção nacional de inovação tecnológica registrada em patentes, no campo de radiologia e diagnóstico por Imagem.

OBJECTIVE: To analyze the Brazilian technological innovation in the field of radiology and imaging diagnosis, in terms of patent indicators. MATERIALS AND METHODS: Exploratory analytical study of information retrieved through cross queries in databases of intellectual property offices in Brazil (State Industrial Property Office [Instituto Nacional da Propriedade Industrial - INPI]), United States (United States Patent and Trademark Office - USPTO) and Europe (European Patent Office - EPO). RESULTS: There were 277,057 patents in the field of radiology and imaging diagnosis. Of this total, 7,800 were registered at INPI (3 percent), 65,428 (24 percent) registered at the EPO and 203,829 (73 percent) issued by USPTO. Brazil is a signatory to 1,732 patents published by the INPI, 80 by the EPO and 26 by the USPTO. Overall, 219,993 (79 percent) patents were related to electronic devices strongly linked to information technology in health care, ultrasonography, tomography, magnetic resonance imaging procedures as well as to images generation, communication and archiving, and 57,064 patents (21 percent) dealt with technologies related to radiation protection and dosimetry, nuclear physics, electrotherapy, magnetic therapy and radiotherapy. CONCLUSION: The results indicate the weakness of the domestic production of patented technological innovation in the field of radiology and imaging diagnosis.

Uso de mineração de texto como ferramenta de avaliação da qualidade informacional em laudos eletrônicos de mamografia / Text mining as a tool for assessment of informational quality of electronic mammographic reports

OBJETIVO: Investigação do uso da técnica de mineração de texto como forma de avaliar a qualidade informacional de laudos eletrônicos de mamografia, tendo como parâmetro de qualidade a adesão ao léxico BI-RADS®. MATERIAIS E MÉTODOS: Foram extraídos 22.247 laudos de mamografia do banco de dados do sistema de informação em radiologia do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, no período de janeiro de 2000 até junho de 2006. Foram realizados dois experimentos, um buscando-se verificar a utilização mais correta dos termos do léxico - experimento 1 (especificidade do método de mineração), e outro buscando-se verificar toda e qualquer tentativa de uso ou alusão ao léxico - experimento 2 (sensibilidade do método de mineração). RESULTADOS: Experimento 1: variação entre 11 por cento e 61 por cento de laudos contendo termos do léxico em sua conclusão, distribuída de forma aleatória ao longo do tempo, a partir do ano de 2001. Experimento 2: variação entre 44 por cento e 100 por cento de laudos que se referem de alguma forma ao léxico em sua conclusão. CONCLUSÃO: Os resultados indicam um bom potencial da aplicação da ferramenta de mineração de texto para a avaliação da qualidade das informações contidas em laudos eletrônicos de mamografia.

OBJECTIVE: To investigate the utilization of text mining technique for evaluating the informational quality of electronic mammographic reports considering adherence to the BI-RADS® lexicon as a quality parameter. MATERIALS AND METHODS: A total of 22,247 mammography reports of the period between January, 2000 and June, 2006 were collected from the radiology information database of Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, SP, Brazil. Two experiments were undertaken - experiment 1 to evaluate the accuracy in the adoption of the lexicon terms (text mining method specificity), and experiment 2 to identify all and any attempt to utilize or refer to the lexicon (text mining method sensitivity). RESULTS: Experiment 1: variation between 11 percent and 61 percent in reports including lexicon terms in their conclusion, randomly distributed over time since 2001. Experiment 2: variation between 44 percent and 100 percent in reports that somehow refer to the lexicon in their conclusion. CONCLUSION: Results indicate a good potential for text mining tool application for assessing the quality of information included in electronic mammography reports.