RESUMEN
Abstract Introduction: Urinary tract infections (UTI) are the second most frequent disease caused by bacteria, mainly Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae. Furthermore, the emergence of multidrug-resistant extended-spectrum ß-lactamases (ESBL)-producing bacteria is a serious public health issue. Objective: To describe the molecular characteristics of ESBL-producing E. coli and K. pneumoniae isolates obtained from urinary samples of Peruvian patients with UTI. Materials and methods: Retrospective, descriptive, cross-sectional study, in which 118 isolates obtained from urine cultures of patients with UTI treated at 2 hospitals located in the province of Lima and 1 in the province of Callao between April and August, 2019, were analyzed. A MicroScan™ automated system and a conventional polymerase chain reaction (PCR) test were used to identify resistance profiles and detect ESBL genes, respectively. Results: All the bacteria isolated in the 3 hospitals were multi-drug resistant (105 E. coli and 13 K. pneumoniae). Coexistence of ESBL genes (blarEM, blacrx-M, blasHv) was observed in 32.20% of the isolates (28.57% of E. coli and 61.53% of K. pneumoniae isolates). Coexistence of 2 and 3 genes was found in 12.71 % and 21.18 % of isolates, respectively. In addition, blarEM was the ESBL gene most frequently expressed in the isolates (45.76%). Conclusions: Multiple drug resistance was found in all isolates analyzed. Additionally, coexistence of ESBL genes was observed in almost one third of the isolates, showing that antibiotic resistance is a real problem in public hospitals in the provinces of Lima and Callao.
Resumen Introducción. Las infecciones del tracto urinario (ITU) son la segunda enfermedad más frecuente causada por bacterias, principalmente por Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae; además, la aparición de bacterias multidrogorresistentes productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) representa un serio problema de salud pública. Objetivo. Describir las características moleculares de aislamientos de E. coli y K. pneumoniae productoras de BLEE obtenidos de muestras de orina de pacientes peruanos con ITU. Materiales y métodos. Estudio retrospectivo, transversal y descriptivo. Se analizaron 118 aislamientos de urocultivos de pacientes con ITU atendidos en 2 hospitales de la provincia de Lima y 1 de la provincia del Callao procesados entre abril y agosto del 2019. Los perfiles de resistencia se identificaron utilizando el sistema automatizado MicroScan™ y para la detección de los genes BLEE se empleó una prueba de reacción de cadena de la polimerasa convencional. Resultados. El 100% de las bacterias aisladas en los tres hospitales fueron multidrogorresistentes (105 de E. coli y 13 de K. pneumoniae). La coexistencia de genes BLEE (blarEM, blacrx-M, blasHv) se observó en 32.20% de los aislamientos (28.57% de los de E. coli y 61.53% de los de K. pneumoniae), hallándose coexistencia de 2 genes y 3 genes en 12.71% y 21.18%, respectivamente; además, blarEM fue el gen BLEE más frecuentemente expresado en los aislamientos (45.76%). Conclusiones. Se halló multidrogoresistencia en todos los aislamientos analizados. Además, se observó coexistencia de genes BLEE en casi un tercio de todos los aislamientos, lo que evidencia que la resistencia a los antibióticos es una problemática real en los hospitales públicos de las provincias de Lima y Callao.
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Objetivo : Determinar la susceptibilidad antimicrobiana de cepas de Streptococcus agalactiae (EGB) aisladas entre 2015-2020 en un hospital materno-infantil. Material y métodos : Estudio descriptivo realizado entre 2015 y 2020. La identificación y susceptibilidad antimicrobiana se determinaron por el sistema automatizado Vitek® 2. La base de datos obtenida fue transferida al programa WHONET versión 5.6. Se incluyeron 506 aislamientos de EGB. Resultados : 500 (98,8%) fueron en mujeres. La edad media fue de 31,9 ± 11,8 años. Todos fueron sensibles a penicilina, ampicilina y vancomicina, la resistencia a eritromicina, clindamicina y levofloxacino fue de 38,5%, 37,4% y 28%, respectivamente, mostrando un pico de resistencia en 2018. Conclusión : Se observó un incremento en la resistencia de EGB a los antimicrobianos, especialmente el año 2018.
SUMMARY Objective : To determine the antimicrobial susceptibility of S. agalactiae (SA) strains isolated from 2015-2020 in a maternal-infant hospital in Lima, Peru. Methods : A descriptive study was carried-out from 2015 to 2020. Identification and susceptibility were performed using Vitek®2. Data base was transferred to the WHONET version 5.6 program; 506 isolates were analyzed. Results: 500 (98.8%) were females; mean age was 31.9 ± 11.8 years. All strains were susceptible to penicillin, ampicillin and vancomycin. Resistance to erythromycin, clindamycin and levofloxacin were 38.5%, 37.4% and 28%, respectively, showing the highest value in 2018. Conclusions : An increase in resistance of SA to antimicrobials was observed, especially in 2018.
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RESUMEN El objetivo del estudio fue identificar molecularmente los genes de virulencia y resistencia a macrólidos en aislamientos clínicos de Streptococcus agalactiae (EGB), recuperados en 2019 a partir de secreción vaginal (n=9) y orina (n=22), en dos establecimientos de salud de Lima. La identificación y susceptibilidad antimicrobiana se determinaron por el sistema automatizado Vitek® 2, se confirmó la identificación fenotípicamente; la resistencia a macrólidos por el método D-test; la identificación de genes de virulencia (lmb, bca y rib) y de resistencia a macrólidos (ermB, ermTR y mefA) por reacción en cadena de la polimerasa (PCR). El fenotipo y genotipo de resistencia a macrólidos predominante fue cMLSb (12/31) y ermB (11/31), y el gen de virulencia más frecuente fue lmb (23/31). Todos fueron sensibles a penicilina, ampicilina y vancomicina. Estos hallazgos muestran la necesidad de implementar estudios de epidemiología molecular que permitan un adecuado conocimiento y seguimiento de EGB en el Perú.
ABSTRACT The aim of the study was to molecularly identify virulence and macrolide resistance genes in clinical isolates of Streptococcus agalactiae (GBS), recovered in 2019 from vaginal discharge (n=9) and urine (n=22), from two health facilities in Lima. Identification and antimicrobial susceptibility were determined by the Vitek® 2 automated system, identification was confirmed phenotypically; macrolide resistance was determined by the D-test method. Identification of virulence genes (lmb, bca and rib) and macrolide resistance genes (ermB, ermTR and mefA) was carried out by polymerase chain reaction (PCR). The predominant macrolide resistance phenotype and genotype were cMLSb (12/31) and ermB (11/31); the most frequent virulence gene was lmb (23/31). All were sensitive to penicillin, ampicillin and vancomycin. These findings show the need to implement molecular epidemiology studies that allow adequate knowledge and follow-up of GBS in Peru.
Asunto(s)
Streptococcus agalactiae , Virulencia , Resistencia a Medicamentos , Pruebas de Sensibilidad Microbiana , Penicilinas , Reacción en Cadena de la Polimerasa , Macrólidos , GenesRESUMEN
Introducción. La aparición de enterobacterias multirresistentes y productoras de betalactamasas de espectro extendido en pacientes ambulatorios con infecciones urinarias representa un problema de salud pública en Perú. Objetivo. Comparar los perfiles de resistencia de Escherichia coli uropatógenas e identificar los fenotipos de cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido en tres establecimientos privados de salud localizados en las regiones de la costa, la sierra y la selva de Perú. Materiales y métodos. Se llevó a cabo durante el 2016 un estudio descriptivo de 98 muestras de orina de pacientes con infección urinaria, 35 procedentes de Lima (costa), 38 de Juliaca (sierra) y 25 de Iquitos (selva), en el que se determinó la sensibilidad antimicrobiana utilizando ocho discos antibióticos. Asimismo, se evaluó la producción de betalactamasas de espectro extendido con discos de cefotaxima, de ceftazidima o de su combinación, con ácido clavulánico en agar Mueller-Hinton. Resultados. Se identificaron 18 perfiles de resistencia que incluían desde los sensibles a todos los antibióticos hasta los resistentes simultáneamente a siete antibióticos, con el 18,4 % de aislamientos resistentes a un antibiótico y el 54,0 % de multirresistentes. Se detectó producción de betalactamasas en el 28,6 % de las cepas procedentes de la región de Puno. También, se observó un mayor número de casos en el rango de edad de 31 a 45 años con resistencia a ceftazidima, ceftriaxona, gentamicina y trimetoprim-sulfametoxazol en el establecimiento de salud de Puno. Conclusión. Los perfiles de resistencia variaron según la localización geográfica del establecimiento de salud, observándose mayor resistencia a los antibióticos en la región de la sierra de Perú, con el 28,6 % de cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido.
Introduction: The appearance of multidrug-resistant and beta-lactamase producing enterobacteria in outpatient care facilities represent a public health problem in Perú. Objective: To compare the resistance profiles of uropathogenic Escherichia coli and to identify extended-spectrum beta-lactamase-producing phenotypes in three private health facilities located in the Peruvian coast, Andean and jungle regions. Materials and methods: We conducted a descriptive study on 98 urine samples from Lima (coast), Juliaca (Andean region) and Iquitos (jungle region) during 2016. We determined the antimicrobial susceptibility in 35 samples from Lima, 38 from Juliaca and 25 from Iquitos using eight antibiotic disks in samples from patients diagnosed with urinary infection. We also evaluated the production of extended-spectrum beta-lactamases with cefotaxime and ceftazidime disks and a combination of both with clavulanic acid on Mueller-Hinton agar. Results: We identified 18 resistance profiles ranging from those sensitive to others simultaneously resistant to seven antibiotics: 18.4% resistant to one and 54.0% to multiple antibiotics. We detected beta-lactamase production in 28.6% of the strains from the Puno region. Likewise, we observed a greater number of cases with resistance to ceftazidime, ceftriaxone, gentamicin, and trimethoprim-sulfamethoxazole in Puno's health facility in patients within the 31 to 45 year age range. Conclusion: Resistance profiles varied according to the geographical location of the health facilities under study. Resistance to antibiotics was higher in the Andean region with 28.6% of strains producing extended-spectrum beta-lactamases.
Asunto(s)
Infecciones Urinarias , Resistencia a Medicamentos , Enterobacteriaceae , Perú , beta-Lactamasas , Pruebas Antimicrobianas de Difusión por DiscoRESUMEN
Con el objetivo de detectar y caracterizar molecularmente las metalo-ß-lactamasas (MßL) en aislamientos clínicos de Pseudomonas aeruginosa, se realizó un estudio trasversal en seis hospitales de referencia de Lima (Perú) en agosto de 2011. Se evaluó 51 aislamientos de P. aeruginosa, resistentes a ceftazidima y con sensibilidad reducida a carbapenémicos. El ensayo fenotípico se realizó con el método de aproximación de discos con sustratos (ceftazidima, imipenem y meropenem) y con ácido etilendiaminotetraacético (EDTA). La detección de genes MßL se realizó mediante la técnica de reacción en cadena de polimerasa multiplex. A través del método fenotípico se detectaron MßL en el 15,7% de los aislamientos, en todos ellos la detección de genes mostró la presencia del gen blaIMP. La descripción del primer reporte de MßL en aislamientos de P. aeruginosa en el Perú debería alertar a los equipos de vigilancia epidemiológica intrahospitalaria para promover su control y prevenir su diseminación.
The aim of this study was to detect and characterize molecularly metallo-ß-lactamase (MßL) in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa. We carry out a cross sectional study in six publics hospital in Lima on August 2011. 51 isolates of P. aeruginosa resistant to ceftazidime and reduced susceptibility to carbapenemes were evaluated.The phenotypic assay was performed using the approximation method with substrate disks (ceftazidime, imipenem and meropenem) and ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA). MßL gene detection was performed using the technique of polymerase chain reaction (PCR) multiplex. Through MßL detected phenotypic method in 15.7% of isolates. Detection of genes revealed the presence of the gene in the 8 isolates blaIMP. The first report of MßL in P. aeruginosa in Peru was described, this should alert the monitoring equipment in the institutions to promote control their spread.