Bifidobacterias como indicadoras de contaminación fecal en aguas tropicales

La contaminación fecal humana en el agua constituye un importante riesgo para la salud pública, sin embargo, los microorganismos indicadores comúnmente utilizados para detectar contaminación fecal no identifican su fuente específica. La detección de ciertas especies del género Bifidobacterium como B. adolescentis y B. dentium ha sido propuesta como un efectivo marcador de contaminación fecal humana, pero esto no ha sido evaluado en las condiciones ambientales tropicales. El objetivo de este trabajo fue determinar el perfil de bifidobacterias, en una muestra de agua de la Ciénaga de Mesolandia en el Caribe Colombiano y en 260 muestras fecales humanas y 94 de animales domésticos de un asentamiento humano periférico a la ciénaga. El ADN extraído de cada una de las muestras fue amplificado por PCR mediante el uso de cebadores específicos de género basados en la secuencia del gen 16S ARNr y separados por DGGE (Electroforesis en Gel con Gradiente Desnaturalizante). Las bandas obtenidas en DGGE, fueron extraídas del gel, re-amplificadas, secuenciadas y las secuencias comparadas con la base de datos del GenBank. El perfil de bifidobacterias en DGGE mostró la presencia de ocho especies de Bifidobacterias en la muestra de agua, las cuales también fueron identificadas en las heces humanas. B. adolescentis y B. dentium propuestas como marcadores de contaminación fecal humana, también fueron encontradas en animales domésticos. En este estudio bajo las condiciones ambientales y experimentales evaluadas no fue posible encontrar una especie de Bifidobacteria específica para ser utilizada como marcador de contaminación fecal humana en ambientes tropicales. Sin embargo, el método aplicado permitió una aproximación más cercana al origen de la contaminación fecal en relación con los métodos culturales tradicionales, ya que fue posible encontrar secuencias de ADN idénticas en el agua y en las muestras fecales.

Human fecal pollution in water constitute a serious risk to the public health, nevertheless the indicator microorganisms commonly used to detect the levels of fecal pollution does not identify the specific source. The detection of certain Bifidobacterium species as B. adolescentis and B. dentium have been proposed as an effective marker of human fecal contamination, but this has not yet been demonstrated in tropical environmental conditions. The aim of the present work was to determine the Bifidobacteria profile in one sample of water from the Mesolandia Swamp in the Colombian Caribbean and feces samples of 260 human and 94 domestic animals from a human settlement around the swamp. DNA from all the samples was amplified by PCR using specific specie primers based on the 16S rRNA gene sequence and separated by DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis). DGGE bands were excised, reamplified, sequenced, and compared to GenBank database. Bifidobacterial DGGE profiles showed that eight species of Bifidobacterium that were found in the water sample, were also present in the human and animal feces. Bifidobacterium adolescentis and B. dentium described as potential human fecal pollution indicators were found in domestic animals. In this study under the environmental and experimental conditions evaluated was not possible to find a Bifidobacterium species as specific marker of human fecal contamination in tropical areas. However, the applied method in this study could be useful to detect fecal pollution in tropical waters allowing a nearest approximation to the origin of the fecal pollution compared with cultural traditional methods, since it was possible to find identical DNA sequences in the water and in the fecal samples.

Prevalence of cryptococcosis in Atlántico, department of Colombia assessed with an active epidemiological search

Abstract INTRODUCTION Cryptococcosis is the second most frequent cause of opportunistic infections in human immunodeficiency virus (HIV) patients in Colombia. We aimed to determine the prevalence of cryptococcosis in the Colombian department of Atlántico. METHODS An active search for cryptococcosis cases was conducted between 2015 and 2017 in health institutions by distributing surveys to clinicians and characterizing samples phenotypically and genotypically. RESULTS Thirty-eight cryptococcosis cases were identified (81.6% men, 76.3% HIV patients). The calculated annual prevalence was 5.08/1 million inhabitants. Cryptococcus neoformans var. grubii VNI was isolated in 34 cases. CONCLUSIONS These results provide the basis for passive surveillance of cryptococcosis.

Parasitismo intestinal en poblaciones con alto grado de vulnerabilidad del Caribe colombiano / Intestinal parasitism in populations with a high degree of vulnerability in the Colombian Caribbean

Introducción: Los parásitos intestinales tienen alto impacto en la salud de la población mundial y pueden constituir un factor más de riesgo en poblaciones en alto grado de vulnerabilidad por desplazamientos humanos a causa de la pobreza, violencia o catástrofes naturales. Objetivo: Evaluar el parasitismo intestinal en los habitantes de dos asentamientos humanos en alto grado de vulnerabilidad. Métodos: estudio descriptivo de corte transversal, en el que se analizaron 367 muestras fecales de los habitantes de dos asentamientos humanos en estado de vulnerabilidad del departamento del Atlántico-Colombia, durante los años 2015 y 2016. Se realizó examen directo de las heces en solución salina, lugol y concentración con el método formol-éter. Se estableció la frecuencia absoluta y relativa de los parásitos presentes y se compararon los resultados entre los dos lugares de muestreo. Resultados: el 91,28 por ciento de la población analizada tenía parásitos intestinales. Las helmintiasis presentaron una frecuencia del 52,32 por ciento. Los parásitos más frecuentes fueron Blastocystis sp. (49,05 por ciento) y Trichuris trichiura (44,96 por ciento). Conclusiones: La alta prevalencia de parásitos en las poblaciones vulnerables analizadas, plantea la necesidad de implementar estrategias para el control del parasitismo intestinal dentro de los planes de prevención y mitigación de riesgos(AU)

Introduction: Intestinal parasites have high impact in the health of the world population and can constitute another risk factor in populations with a high degree of vulnerability by human displacements because of poverty, violence or natural catastrophes. Objective: To evaluate intestinal parasitism in inhabitants of two populations with high degree of vulnerability. Methods: Cross sectional, descriptive study in which 367 stool samples were analyzed from the inhabitants of two populations with high vulnerability's degree, in Atlántico-Colombia department during the years 2015 and 2016. The parasitological analysis was performed by direct examination of the stool samples in saline, lugol and concentration solutions by the formalin-ether method. The absolute and relative frequencies of the parasites present were established and the results between the sampled places were compared. Results: 91.28 percent of the population was infected with intestinal parasites. Helminthiasis showed a frequency of 52.32 percent. The most frequents parasites were Blastocystis sp. (49.05 percent) and Trichuris trichiura (44.96 percent). Conclusions: The high prevalence of parasites in the analyzed populations with a high degree of vulnerability expresses the need of implementing strategies for the control of intestinal parasitism in the prevention and risk's mitigation planning(AU)