RÉSUMÉ
Abstract Background Infectious meningoencephalitis is a potentially fatal clinical condition that causes inflammation of the central nervous system secondary to the installation of different microorganisms. The FilmArray meningitis/encephalitis panel allows the simultaneous detection of 14 pathogens with results in about one hour. Objective This study is based on retrospectively evaluating the implementation of the FilmArray meningitis/encephalitis panel in a hospital environment, highlighting the general results and, especially, analyzing the consistency of the test results against the clinical and laboratory conditions of the patients. Methods Data were collected through the results reported by the BioFire FilmArray system software from the meningitis/encephalitis panel. The correlated laboratory tests used in our analysis, when available, included biochemical, cytological, direct and indirect microbiological tests. Results In the analyzed period, there were 496 samples with released results. Of the total of 496 samples analyzed, 88 (17.75%) were considered positive, and 90 pathogens were detected, and in 2 of these (2.27%) there was co-detection of pathogens. Viruses were the agents most frequently found within the total number of pathogens detected. Of the 496 proven samples, 20 (4.03%) were repeated, 5 of which were repeated due to invalid results, 6 due to the detection of multiple pathogens and 9 due to disagreement between the panel results and the other laboratory tests and/or divergence of the clinical-epidemiological picture. Of these 20 repeated samples, only 4 of them (20%) maintained the original result after repeating the test, with 16 (80%) being non-reproducible. The main factor related to the disagreement of these 16 samples during retesting was the detection of bacterial agents without any relationship with other laboratory tests or with the patients' clinical condition. Conclusion In our study, simply reproducing tests with atypical results from the FilmArray meningitis/encephalitis panel proved, in most cases, effective and sufficient for interpreting these results.
Resumo Antecedentes A meningoencefalite infecciosa é uma condição clínica potencialmente fatal que causa inflamação do sistema nervoso central secundária à instalação de diversos microrganismos. O painel de meningite/encefalite FilmArray permite a detecção simultânea de 14 patógenos, com resultados em cerca de uma hora. Objetivo Este estudo baseia-se em avaliar retrospectivamente a implementação do painel de meningite/encefalite FilmArray em ambiente hospitalar, destacando os resultados gerais e, principalmente, analisando a consistência dos resultados do teste frente às condições clínicas e laboratoriais dos pacientes. Métodos Os dados foram coletados por meio dos resultados relatados pelo software do sistema BioFire FilmArray do painel de meningite/encefalite. Os exames laboratoriais correlacionados utilizados em nossa análise, quando disponíveis, incluíram exames bioquímicos, citológicos, microbiológicos diretos e indiretos. Resultados No período analisado, foram 496 amostras com resultados divulgados. Do total de 496 amostras analisadas, 88 (17,75%) foram consideradas positivas e 90 patógenos foram detectados, sendo que em duas destas (2,27%) houve codetecção de patógenos. Os vírus foram os agentes mais frequentemente encontrados dentro do total de patógenos detectados. Das 496 amostras analisadas, 20 (4,03%) foram repetidas, sendo 5 repetidas por resultado inválido, 6 pela detecção de múltiplos patógenos e 9 por discordância dos resultados do painel com os demais exames laboratoriais e/ou divergência do quadro clínico-epidemiológico. Destas 20 amostras repetidas, apenas 4 delas (20%) mantiveram o resultado original após a repetição do teste, sendo 16 (80%) não reprodutíveis. O principal fator relacionado à discordância destas 16 amostras na retestagem foi a detecção de agentes bacterianos sem qualquer relação com os demais exames laboratoriais ou com o quadro clínico dos pacientes. Conclusão Em nosso estudo, a simples repetição dos testes com resultados atípicos do painel de meningite/encefalite FilmArray mostrou-se, na maior dos casos, efetiva e suficiente para a interpretação destes achados.
RÉSUMÉ
ABSTRACT During the COVID-19 pandemic, a case of a long-term persistence of SARS-CoV-2 infection (from March 26 to May 20, 2020) was identified at a private hospital in São Paulo, SP, Brazil. The long-term positivity for SARS-CoV-2 in reverse transcriptase polymerase chain reaction tests of a patient diagnosed with COVID-19 suggests, at least part of patients who recovered, may still carry and transmit the SARS-CoV-2 virus. This fact emphasizes the importance of having at least two negative reverse transcriptase polymerase chain reaction test results for SARS-CoV-2. Serological assays were not particularly helpful in the case described, since the patient had very low antibodies titers at the end of the follow-up period. Low viral loads may not be detected by current molecular methods, leading to wrong conclusions regarding viral clearance.
RESUMO Durante a pandemia da COVID-19, um caso de persistência de longo prazo de infecção por SARS-CoV-2, de 26 de março a 20 de maio de 2020, foi identificado em um hospital privado localizado em São Paulo, SP, Brasil. A positividade de longo prazo para SARS-CoV-2 nos exames de reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa de uma paciente diagnosticada com COVID-19 sugere que parte dos pacientes que se recuperaram podem ser portadores e transmitir o SARS-CoV-2. Esse fato enfatiza a importância da obtenção de pelo menos dois resultados negativos para SARS-CoV-2 no exame de reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa. Os ensaios sorológicos não foram de grande utilidade no caso descrito, uma vez que a paciente apresentava baixos títulos de anticorpos no final do período de acompanhamento. Baixas cargas virais podem não ser detectadas pelos métodos moleculares vigentes, levando a conclusões equivocadas a respeito da eliminação do vírus.