Combining ability analysis in bitter gourd (Momordica charantia L. ) for potential quality improvement / Análise de capacidade de combinação em cabaça-amarga (Momordica charantia L. ) para melhoria potencial da qualidade

Abstract Combining ability analysis provides useful information for the selection of parents, also information regarding the nature and magnitude of involved gene actions. Crops improvement involves strategies for enhancing yield potentiality and quality components. Targeting the improvement of respective characters in bitter gourd, combining ability and genetic parameters for 19 characters were estimated from a 6×6 full diallel analysis technique. The results revealed that the variances due to general combining ability (GCA) and specific combining ability (SCA) were highly significant for most of the important characters. It indicated the importance of both additive and non-additive gene actions. GCA variances were higher in magnitude than SCA variances for all the characters studied indicating the predominance of the additive gene effects in their inheritance. The parent P2 (BG 009) appeared as the best general combiner for earliness; P1 (BG 006) for number of fruits, average single fruit weight and fruit yield; P4 (BG 027) for node number of first female flower and days to seed fruit maturity; P3 (BG 011) for fruit length and thickness of the fruit flesh; P5 (BG 033) for 100-seed weight; and P6 for number of nodes per main vine. The SCA effect as well as reciprocal effect was also significant for most of the important characters in different crosses.

Resumo A análise da capacidade de combinação fornece informações úteis para a seleção dos pais, também informações sobre a natureza e a magnitude das ações dos genes envolvidos. A melhoria das safras envolve estratégias para aumentar a potencialidade da produção e os componentes de qualidade. Visando ao aprimoramento dos respectivos caracteres em cabaça-amarga, capacidade de combinação e parâmetros genéticos para 19 caracteres, foram estimados a partir de uma técnica de análise dialélica completa 6 × 6. Os resultados revelaram que as variâncias, devido à capacidade geral de combinação (GCA) e capacidade específica de combinação (SCA), foram altamente significativas para a maioria dos caracteres importantes. Indicou a importância das ações gênicas aditivas e não aditivas. As variâncias GCA foram maiores em magnitude do que as variâncias SCA para todos os caracteres estudados, indicando a predominância dos efeitos do gene aditivo em sua herança. O pai P2 (BG 009) apareceu como o melhor combinador geral para o início; P1 (BG 006) para número de frutos, peso médio de um único fruto e produção de frutos; P4 (BG 027) para número de nó da primeira flor fêmea e dias para a maturidade do fruto da semente; P3 (BG 011) para comprimento do fruto e espessura da polpa do fruto; P5 (BG 033) para peso de 100 sementes; e P6 para o número de nós por videira principal. O efeito SCA, bem como o efeito recíproco, também foi significativo para a maioria dos personagens importantes em cruzamentos diferentes.

Combining ability analysis in bitter gourd (Momordica charantia L.) for potential quality improvement

Abstract Combining ability analysis provides useful information for the selection of parents, also information regarding the nature and magnitude of involved gene actions. Crops improvement involves strategies for enhancing yield potentiality and quality components. Targeting the improvement of respective characters in bitter gourd, combining ability and genetic parameters for 19 characters were estimated from a 6×6 full diallel analysis technique. The results revealed that the variances due to general combining ability (GCA) and specific combining ability (SCA) were highly significant for most of the important characters. It indicated the importance of both additive and non-additive gene actions. GCA variances were higher in magnitude than SCA variances for all the characters studied indicating the predominance of the additive gene effects in their inheritance. The parent P2 (BG 009) appeared as the best general combiner for earliness; P1 (BG 006) for number of fruits, average single fruit weight and fruit yield; P4 (BG 027) for node number of first female flower and days to seed fruit maturity; P3 (BG 011) for fruit length and thickness of the fruit flesh; P5 (BG 033) for 100-seed weight; and P6 for number of nodes per main vine. The SCA effect as well as reciprocal effect was also significant for most of the important characters in different crosses.

Resumo A análise da capacidade de combinação fornece informações úteis para a seleção dos pais, também informações sobre a natureza e a magnitude das ações dos genes envolvidos. A melhoria das safras envolve estratégias para aumentar a potencialidade da produção e os componentes de qualidade. Visando ao aprimoramento dos respectivos caracteres em cabaça-amarga, capacidade de combinação e parâmetros genéticos para 19 caracteres, foram estimados a partir de uma técnica de análise dialélica completa 6 × 6. Os resultados revelaram que as variâncias, devido à capacidade geral de combinação (GCA) e capacidade específica de combinação (SCA), foram altamente significativas para a maioria dos caracteres importantes. Indicou a importância das ações gênicas aditivas e não aditivas. As variâncias GCA foram maiores em magnitude do que as variâncias SCA para todos os caracteres estudados, indicando a predominância dos efeitos do gene aditivo em sua herança. O pai P2 (BG 009) apareceu como o melhor combinador geral para o início; P1 (BG 006) para número de frutos, peso médio de um único fruto e produção de frutos; P4 (BG 027) para número de nó da primeira flor fêmea e dias para a maturidade do fruto da semente; P3 (BG 011) para comprimento do fruto e espessura da polpa do fruto; P5 (BG 033) para peso de 100 sementes; e P6 para o número de nós por videira principal. O efeito SCA, bem como o efeito recíproco, também foi significativo para a maioria dos personagens importantes em cruzamentos diferentes.

Bayesian threshold analysis of litter size in sheep

Background: Litter size at birth (LSB) is one of the most important economic traits in sheep and could be used in genetic improvement schemes for meat production. LSB is inherently a categorical trait and should be analysed with threshold models. Objective: Bayesian threshold models were used to analyze sheep LSB to estimate genetic parameters. Methods: Data was based on 7,901 LSB records from 14,968 dams and 682 sires collected from 1986 to 2012 at Makouie Sheep Breeding Station in Iran. Means of posterior distributions (MPDs) of LSB's genetic parameters were estimated, and the best-fitted models were selected using the deviance information criterion. Results: In the repeated measurement analysis, the estimated direct and maternal heritabilities, and permanent environmental effect (±SE), according to the best-fitted model (model 5), were 0.01 (0.010), 0.02 (0.014), and 0.01 (0.011), respectively. In the univariate analysis, the best estimates of direct and maternal heritabilities were 0.12 (0.064) and 0.08 (0.045), respectively. An increasing trend for direct and maternal heritabilities was observed in parity 2 (0.15 (0.082) and 0.25 (0.083), respectively). In the bivariate analysis, the best estimates of direct and maternal heritabilities for LSB were 0.03 (0.027) and 0.22 (0.041), respectively. The direct and maternal genetic correlations among parities were 0.25 (0.054) and 0.12 (0.021), respectively. Conclusions: The results showed a considerable influence of environmental factors on LSB in each parity of sheep; also, statistically different genetic parameters (p<0.05) were obtained from one parity to another, indicating the different and large influences of genetic and environmental factors for each parity.

Antecedentes: El tamaño de la camada al nacer (LSB) es inherentemente un rasgo categórico y debe analizarse con modelos de umbral. El LSB es uno de los rasgos de producción de carne más importantes en las ovejas y podría usarse en esquemas de mejora genética para la producción de carne. Objetivo: Se utilizaron modelos de umbral bayesiano para analizar el tamaño de la camada de ovejas al nacer (LSB) y estimar parámetros genéticos. Métodos: Los datos se basaron en 7.901 registros de LSB de 14.968 ovejas y 682 carneros recolectados de 1986 a 2012 en la estación de cría de ovejas Makouie en Irán. Se estimaron las medias de distribuciones posteriores (MPD) de los parámetros genéticos de LSB y se seleccionaron los modelos mejor ajustados utilizando el criterio de información de desviación. Resultados: En los análisis de medición repetida, la heredabilidad materna y directa estimada y el efecto ambiental permanente (±SE), según el modelo mejor ajustado (modelo 5), fueron 0,01 (0,010), 0,02 (0,014) y 0,01 (0,011), respectivamente. En el análisis univariado, las mejores estimaciones de heredabilidad directa y materna fueron 0,12 (0,064) y 0,08 (0,045), respectivamente. Se observó una tendencia creciente de heredabilidades directas y maternas en la paridad 2 (0,15 (0,082) y 0,25 (0,083), respectivamente). En el análisis bivariado, las mejores estimaciones de heredabilidad directa y materna para LSB fueron 0,03 (0,027) y 0,22 (0,041), respectivamente. Las correlaciones genéticas directas y maternas entre partos fueron 0,25 (0,054) y 0,12 (0,021), respectivamente. Conclusiones: Los resultados mostraron una influencia considerable de los factores ambientales sobre el LSB en cada parto de las ovejas; además, se obtuvieron parámetros genéticos estadísticamente diferentes (p<0.05) de un parto a otro, indicando las diferentes y grandes influencias de factores genéticos y ambientales para cada parto en ovejas. Los resultados de este estudio se pueden precisar aún más utilizando datos de SNP de todo el genoma sobre diferentes partes para manejar una amplia gama de problemas relacionados con la interacción del entorno genético del rasgo LSB.

Antecedentes: O tamanho da ninhada ao nascer (LSB) é inerentemente uma característica categórica e deve ser analisada com modelos de limiar. LSB é uma das características mais importantes de produção de carne em ovinos e pode ser usado em esquemas de melhoramento genético para a produção de carne. Objetivo: Modelos de limiar bayesiano foram usados para analisar o tamanho da ninhada de ovelhas ao nascer (LSB) para estimar parâmetros genéticos. Métodos: Os dados foram baseados em 7.901 registros LSB de 14.968 ovelhas e 682 carneiros coletados de 1986 a 2012 na Estação de Criação de Ovinos Makouie no Irã. Médias de distribuições posteriores (MPDs) dos parâmetros genéticos de LSB foram estimadas e os modelos mais bem ajustados foram selecionados usando o critério de informação de desvio. Resultados: Nas análises de medidas repetidas, as herdabilidades diretas e maternas estimadas e o efeito do ambiente permanente (±SE), de acordo com o modelo mais bem ajustado (modelo 5), foram 0,01 (0,010), 0,02 (0,014) e 0,01 (0,011), respectivamente. Na análise univariada, as melhores estimativas das herdabilidades direta e materna foram 0,12 (0,064) e 0,08 (0,045), respectivamente. Uma tendência crescente para as herdabilidades direta e materna foi observada na paridade 2 (0,15 (0,082) e 0,25 (0,083), respectivamente). Na análise bivariada, as melhores estimativas de herdabilidades direta e materna para LSB foram 0,03 (0,027) e 0,22 (0,041), respectivamente. As correlações genéticas diretas e maternas entre os partos foram 0,25 (0,054) e 0,12 (0,021), respectivamente. Conclusões: Os resultados mostraram uma influência considerável dos fatores ambientais na LSB em cada paridade de ovelhas; também, parâmetros genéticos estatisticamente diferentes (p<0,05) foram obtidos de uma paridade para outra, indicando as diferentes e grandes influências de fatores genéticos e ambientais para cada paridade em ovinos. Os resultados deste estudo podem ser ainda mais definidos usando dados SNPs de todo o genoma em diferentes partes para lidar com uma ampla gama de problemas relacionados à interação do ambiente genético do traço LSB.

Genetic parameters for ultrasound-evaluated carcass and body traits in Anglo-Nubian goats / Parámetros genéticos para las características de la canal y del cuerpo evaluadas por ultrasonido en cabras Anglo-Nubianas / Parâmetros genéticos para características da carcaça avaliadas por ultrassom e corporais em caprinos Anglo-Nubianos

Abstract Background: Meat goat breeding programs should prioritize the identification and selection of genetically superior animals for traits related to meat quality and carcass yield in order to increase the value of the final product. Objective: To estimate (co)variance components and genetic parameters for ultrasound-measured carcass traits, body size and body weight in Anglo- Nubian breed goats raised in the Mid-North region of Brazil. Methods: (Co)variance components and genetic parameters were estimated using the single and two-trait animal model analyses via Bayesian inference for loin eye dimensions (area, length, and depth), sternal fat thickness, rump height, chest circumference and depth, leg perimeter, and body weight. Results: Heritability estimates were higher when two-trait analyses were used. This finding implies that it is possible to recover part of the additive genetic variance included in the residual variance due to the correlation between traits. Genetic correlations between carcass and body size traits showed different magnitudes. On the other hand, genetic correlations between the traits related to muscularity showed high magnitudes. Conclusions: Body weight was not a good indicator of muscularity; therefore, it is not recommended as a criterion for indirect selection to improve carcass traits of Anglo-Nubian goats. Leg perimeter and chest circumference may be important to construct selection indexes in meat goat breeding programs.

Resumen Antecedentes: los programas de mejoramiento de caprinos de carne deben priorizar la identificación y selección de animales genéticamente superiores para características relacionadas con la calidad de la carne y rendimiento de la canal, con el fin de agregar valor al producto final. Objetivo: estimar los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos para características de canal obtenidas por ultrasonografía, características de tamaño y peso corporal en caprinos de la raza Anglonubiana, criados en la región medio-norte de Brasil. Métodos: los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos fueron estimados mediante un modelo animal usando análisis uni y bi-carácter vía metodología Bayesiana para las dimensiones del ojo de lomo (área, profundidad y longitud), grosor de la grasa esternal, altura de la grupa, circunferencia y profundidad torácica, perímetro de la pierna y peso corporal. Resultados: las estimativas de heredabilidad obtenidas a partir del análisis bi-carácteristico fueron mayores que las obtenidas a partir del análisis uni-carácteristico. Este supuesto implica que es posible recuperar parte de la variancia genética aditiva incluida en la variancia residual, debido a la correlación entre las características. Las correlaciones genéticas entre las características de canal y las medidas corporales presentaron diferentes magnitudes. Por otro lado, las correlaciones genéticas entre las características relacionadas con musculatura presentaron alta magnitud. Conclusiones: el peso corporal no fue un buen indicador de musculatura; por eso no es recomendado como criterio de selección indirecta para mejorar la canal de caprinos Anglonubianos. El perímetro de la pierna y la circunferencia del pecho pueden ser importantes para la construcción de índices de selección en programas de mejoramiento de carne caprina.

Resumo Antecedentes: programas de melhoramento de caprinos de corte devem priorizar a identificação e seleção de animais geneticamente superiores para características relacionadas à qualidade da carne e rendimento de carcaça, para aumentar o valor ao produto final. Objetivo: estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para características de carcaça obtidas por ultrassonografia, características de tamanho e peso corporal em caprinos da raça Anglo-Nubiana criados na região Meio-Norte do Brasil. Métodos: os componentes de (co)variância e parâmetros genéticos foram estimados usando análises uni e bicaracterísticas de um modelo animal via metodologia Bayesiana para área, profundidade e comprimento de olho de lombo, espessura da gordura esternal, altura da garupa, circunferência e profundidade torácica, perímetro da perna e peso corporal. Resultados: as estimativas de herdabilidade obtidas a partir das análises bicaracterísticas foram maiores que as obtidas a partir das análises unicaracterísticas. Esse resultado implica que é possível recuperar parte da variância genética aditiva incluída na variância residual devido à correlação entre as características. As correlações genéticas entre as características de carcaça e as medidas corporais apresentaram magnitudes variáveis. Por outro lado, as correlações genéticas entre as características relacionadas à musculosidade apresentaram altas magnitudes. Conclusões: o peso corporal não se mostrou um bom indicador de muscularidade, de modo que não é recomendado como critério de seleção indireta para melhorar a carcaça de caprinos Anglo-Nubiano. O perímetro de perna e a circunferência torácica podem ser importantes para a construção de índices de seleção em programas de melhoramento de carne caprina.

Genetic associations between visual scores, body weight and age at first calving in nellore breed cattle / Associações genéticas entre escores visuais, peso corporal e idade ao primeiro parto de bovinos da raça Nelore

Body weight records of 231,416 Nellore females obtained from the Brazilian Association of Zebu Breeders were used to determine a linear combination between visual appraisal scores (body structure, precocity and muscling) using principal components analysis (PC), and to verify their genetic association with body weight at 12 months (BW) and age at first calving (AFC). The mixed linear model included the fixed effect of the contemporary group and the linear and quadratic effects of age at calving, random effects of genetic additive, maternal environment and temporary environment. Heritability estimates for BW, PC and AFC were 0.51, 0.30 and 0.17, respectively. Genetic additive correlations between BW and PC; BW and AFC, and PC and AFC were 0.48; -0.31 and -0.55; respectively. Spearman's correlations for the best-ranked bulls based on PC prediction were positive between BW and PC and negative among the other combinations. Heritability estimates and correlations indicate potential genetic gains for BW and CP with reduced AFC in cows. The use of PC allows positive responses on precocity and body weight development.(AU)

Utilizaram-se registros de pesos corporais de 231.416 fêmeas bovinas da raça Nelore, oriundos dos registros da Associação Brasileira de Criadores de Zebu-ABCZ, com o objetivo de estabelecer, por componentes principais, uma combinação linear (CP) das características de escores visuais de estrutura (E), precocidade (P) e musculosidade (M), bem como verificar sua associação genética com o peso corporal aos 12 meses (PC) e à idade ao primeiro parto (IPP). O modelo linear misto utilizado incluiu os efeitos fixos de grupo de contemporâneos e os efeitos linear e quadrático da idade da vaca ao parto, os efeitos aleatórios genético aditivo, ambiente materno e ambiente temporário. Estimativas de herdabilidade para PC, CP e IPP foram iguais a 0,51; 0,30 e 0,17, respectivamente. Correlações genéticas aditivas entre PC e CP; PC e IPP; e, ainda, CP e IPP foram iguais a 0,48; -0,31 e -0,55, respectivamente. As correlações de Spearman para os melhores reprodutores classificados em relação à predição de CP foram positivas entre PC e CP e negativas entre as demais combinações. Estimativas de herdabilidade e de correlações indicam possibilidade de ganhos genéticos expressivos para PC e CP com redução para IPP nas fêmeas. A utilização de CP possibilita respostas favoráveis para precocidade sexual e desenvolvimento ponderal.(AU)

Random regression models for the evaluation of the growth of goats of the Anglonubian breed / Modelos de regressão aleatória para avaliação do crescimento de caprinos da raça Anglonubiana

A total of 6593 weight records collected from 796 male and female Anglo-Nubian goats aged up to 130 days, offspring from 29 sires and 225 dams, were used to compare models and estimate genetic parameters throughout the growth curve by applying random regression models. Direct and maternal additive genetic effects and direct and maternal permanent environmental effects were included as random in the models. The contemporary groups were included as fixed effects and goat age at kidding was included as a covariable (linear and quadratic). The choice of the best model was based on the AIC, BIC and AICc criteria. Variance estimates of the four random effects increased as the animals aged. Direct heritability (h2) rose from 0.13 to 0.40 with age, whereas maternal heritability showed a low value. Genetic correlations of weight between closer ages were high. The most suitable random regression model to compare the fitting of random effects was that which employed the Legendre polynomials of quadratic order with homogeneous variance (3333-1).(AU)

Utilizaram-se 6593 pesos de 796 caprinos da raça Anglonubiana, coletados em machos e fêmeas com idade até 130 dias, descendentes de 29 reprodutores e 225 matrizes, com o objetivo de se compararem modelos e de se estimarem parâmetros genéticos ao longo da curva de crescimento com aplicação de modelos de regressão aleatória. Nos modelos, incluíram-se os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e os de ambiente permanente diretos e maternos como aleatórios; os grupos de contemporâneos foram incluídos como efeitos fixos, e a idade da cabra ao parto como covariável (linear e quadrática). A escolha do melhor modelo foi realizada pela avaliação dos critérios AIC, BIC e AICc. As estimativas de variâncias dos quatro efeitos aleatórios cresceram de acordo com o aumento da idade. A herdabilidade direta (h2) aumentou de 0,13 a 0,40 com a idade, e a materna apresentou baixo valor. As correlações genéticas do peso entre idades mais próximas foram altas. O modelo de regressão aleatório mais adequado ao se comparar o ajuste dos efeitos aleatórios foi o que empregou polinômios de Legendre de ordem quadrática com variância homogênea (3333-1).(AU)

Inbreeding depression and genetic variability in agricultural traits and resistance to phytopathogens in exotic maize populations / Depressão por endogamia e variabilidade genética em características agrícolas e resistência a fitopatógenos em populações exóticas de milho

The effect known as depression by inbreeding refers to the reduction on the average value of quantitative traits, related to plant reproduction and physiology, due to the homozygosis of deleterious alleles. This study evaluated the inbreeding depression and the genetic variability of agricultural traits and of the resistance to phytopathogens in inbred families of two exotic maize populations. The experiments were done in the experimental area of the Universidade Federal de Goiás, Regional Jataí, in the second harvest 2015. Fifty and 40 FS1 of NAP5 and NAP7 populations, respectively, were evaluated interplanting one row with a mixture of base population (family of Germanic siblings) at every ten plots to estimate depression by inbreeding of the traits evaluated. The experimental design was randomized blocks, with three replications. The following traits were evaluated: PH ­ plant height (cm), EH ­ ear height (cm), MF ­ male flowering (days), BP ­ number of broken plants, LP ­ number of lodged plants, KW ­ kernel weigh (kg plot-1), ET­ resistance to Exserohilum turcicum, WS(White Spot) ­ resistance to Pantoea ananatis, CS(Corn Stunt) ­ resistance to the corn stunt, PP ­ resistance to Puccinia polysora andCZ ­ resistance toCercospora zea-maydis. The greatest estimates of depression by inbreeding in the agricultural traits were observed for kernel production, with values of 51.2 and 38.9% for the populations NAP5 and NAP7, respectively. Among the traits of resistance to phytopathogens, the greatest estimate was observed for the stunting complex, with values of -58.9% in NAP5 and -74.2% in NAP7. Both populations under study presented genetic potential to be used in breeding programs with recurrent selection and, after some selection cycles, lineages with good agricultural standard and resistance to phytopathogens can be obtained.

O efeito denominado depressão por endogamia refere-se à redução do valor médio dos caracteres quantitativos, relacionados com a reprodução e a fisiologia da planta, devido ao estado de homozigose dos alelos deletérios. O objetivo deste trabalho foi avaliar a depressão por endogamia e a variabilidade genética de caracteres agronômicos e de resistência a fitopatógenos em famílias endogâmicas de duas populações exóticas de milho. Os experimentos foram realizados na área experimental da Universidade Federal de Goiás, Regional Jataí, na safrinha 2015. Foram avaliadas 50 e 40 FS1 das populações NAP5 e NAP7, respectivamente, intercalando a cada dez parcelas uma linha com a mistura da população base (família de irmãos germanos) para estimar a depressão por endogamia dos caracteres avaliados. Os experimentos foram instalados em delineamento de blocos casualizados, com três repetições. Foram avaliados os seguintes caracteres: PH ­ altura de planta (cm), EH ­ altura de espiga (cm), MF ­ florescimento masculino (dias), BP ­ número de plantas quebradas, LP ­ número de plantas acamadas, KW ­ produção de grãos (kg parcela-1), ET - resistência a Exserohilum turcicum, WS (White Spot) - resistência a Pantoea ananatis, CS (Corn Stunt) - resistência ao complexo de enfezamento, PP - resistência a Puccinia polysora e CZ - resistência a Cercospora zea-maydis. As maiores estimativas de depressão por endogamia nos caracteres agronômicos foram observadas para produção de grãos, com valores de 51,2 e 38,9% para as populações NAP5 e NAP7, respectivamente. Nos caracteres de resistência a fitopatógenos, a maior estimativa foi observada para o complexo de enfezamento, com valores de -58,9% na NAP5 e -74,2% na NAP7. As duas populações em estudo apresentaram potencial genético para serem utilizadas em programas de melhoramento com seleção recorrente e após alguns ciclos de seleção extrair linhagens com bom padrão agronômico e resistentes a fitopatógenos

Parámetros genéticos para crecimiento y reproducción en ganado Simmental mediante parentesco por pedigrí y genómico / Genetic parameters for growth and reproduction in Simmental cattle from pedigree and genomic relationship

RESUMEN Objetivo. Estimar parámetros genéticos para peso a los ocho meses de edad (W8M), edad al primer parto (AFC) y primer intervalo entre partos (FCI) usando parentesco genómico y por pedigrí. Materiales y métodos. Se utilizaron 481, 3063 y 1098 registros fenotípicos para W8M, AFC y FCI, respectivamente. La información genómica estuvo compuesta por una población de 718 animales genotipados con un chip que incluyó 30106 marcadores genéticos tipo polimorfismo de nucleótido simple (SNP). Modelos univariado y bivariado fueron construidos bajo la metodología del mejor predictor lineal insesgado convencional (BLUP) y genómico en una etapa (ssGBLUP). Resultados. Las heredabilidades para W8M, AFC y FCI variaron desde 0.25 a 0.26, 0.20 a 0.22 y 0.04 a 0.08, respectivamente. Los modelos de AFC y FCI con la metodología ssGBLUP disminuyeron ligeramente el error y aumentaron la varianza genética aditiva, respectivamente. Conclusiones. La inclusión de información genómica mejora levemente la precisión de las estimaciones genéticas en esta población. Sin embargo, una población de animales genotipados más grande y con mayor conectividad genética por parentesco permitiría aumentar para los criadores el potencial de la metodología ssGBLUP en ganado Simmental de Colombia.

ABSTRACT Objective. To estimate genetic parameters for weight at eight months of age (W8M), age at first calving (AFC) and first calving interval (FCI) using pedigree and genomic relationship. Materials and methods. Phenotypic data on 481, 3063 and 1098 animals for W8M, AFC and FCI were used, respectively. The genomic information came from a population of 718 genotyped animals with a density chip of 30,106 single nucleotide polymorphism markers (SNP). Univariate and bivariate models were used under the conventional (BLUP) and single step genomic best linear unbiased predictor (ssGBLUP) methodologies. Results. The heritabilities for W8M, AFC and FCI ranged from 0.25 to 0.26, from 0.20 to 0.22 and from 0.04 to 0.08, respectively. The AFC and FCI models under ssGBLUP slightly decreased the error and increased the additive genetic variance, respectively. Conclusions. The inclusion of genomic information slightly increases the accuracy of the genetic estimates in this population. However, a larger amount of genotyped animals and with a higher genetic relationship connectivity would allow breeders to increase the potential of the ssGBLUP methodology in Colombian Simmental cattle.

Genetic parameters between somatic cell score and production traits for Holstein cattle in Southern Brazil / Parámetros genéticos entre el conteo de células somáticas y las características productivas de bovinos Holstein del Sur de Brasil / Parâmetros genéticos entre escore de células somáticas e características produtivas em bovinos da raça Holandesa do Sul do Brasil

Abstract Background: Somatic cell score is an important parameter to predict milk quality and health of cows. However, in countries like Brazil, this trait is still not selected on a large scale, and no genetic parameters are reported in the literature. Objective: To estimate the variance components and genetic parameters for somatic cell score, milk yield, fat yield, protein yield, fat percentage, and protein percentage in Holstein cows. Methods: Records from 56,718 animals were used to estimate variance components, heritability, and genetic correlations using a multi-trait animal model by the REML method. Results: The heritability estimates were 0.19 for somatic cell score, 0.22 for milk yield, 0.26 for fat yield, 0.18 for protein yield, 0.61 for fat percentage, and 0.65 for protein percentage. The estimates of genetic correlations among analyzed traits ranged from -0.50 to 0.82. Conclusion: The low heritability observed for somatic cell score indicates that selection for this trait should result in benefits related to animal health and milk quality, but only in the long term. The low correlation between productive traits and somatic cell score indicates that inclusion of somatic cell score in animal breeding programs does not interfere negatively with the genetic selection for milk yield or solids.

Resumen Antecedentes: El conteo de células somáticas es un parámetro importante para predecir la calidad de la leche y la salud de las vacas. Sin embargo, en países como Brasil, esta característica aún no se selecciona a gran escala y no se reportan parámetros genéticos en la literatura. Objetivo: Estimar los componentes de varianza y parámetros genéticos para el conteo de células somáticas, producción de leche, producción de grasa, producción de proteína, porcentaje de grasa y porcentaje de proteína en vacas de la raza Holstein. Métodos: Se usaron registros de 56.718 animales para estimar los componentes de la varianza, heredabilidad y correlaciones genéticas usando un modelo animal multicaracterístico por medio del método REML. Resultados: Las estimaciones de heredabilidad fueron 0,19 para el conteo de células somáticas, 0,22 para la producción de leche, 0,26 para la producción de grasa, 0,18 para producción de proteína, 0,61 para el porcentaje de grasa y 0,65 para el porcentaje de proteína. Las estimaciones de correlación genética entre las características analizadas variaron entre -0,50 a 0,82. Conclusión: La baja heredabilidad encontrada para conteo de células somáticas demostró que la selección para esta característica podría resultar en beneficios para la salud animal y calidad de la leche, pero sólo a largo plazo. La baja correlación genética existente entre las características productivas y el conteo de células somáticas indica que la inclusión del conteo de células somáticas en programas de selección no interfiere negativamente en la selección genética para la producción de leche o sólidos.

Resumo Antecedentes: O escore de células somáticas é um parâmetro importante para a predição da qualidade do leite, bem como para a saúde das vacas. No entanto, em alguns países como o Brasil, essa característica não é selecionada em larga escala e não há parâmetros genéticos disponíveis na literatura. Objetivo: Estimar os componentes de variância e parâmetros genéticos para o escore de células somáticas, produção de leite, produção de gordura, produção de proteína, porcentagem de gordura e porcentagem de proteína em vacas da raça Holandesa. Métodos: Foi utilizado um total de 56.718 animais para estimar os componentes de variância, herdabilidade e correlações genéticas, considerando-se o modelo animal multicaracterística por meio do método REML. Resultados: As estimativas de herdabilidade foram de 0,19 para o escore de células somáticas, 0,22 para a produção de leite, 0,26 para a produção de gordura, 0,18 para produção de proteína, 0,61 para a porcentagem de gordura e 0,65 para a porcentagem de proteína. As estimativas de correlação genética entre as características analisadas variaram entre -0,50 a 0,82. Conclusão: A baixa herdabilidade encontrada para o escore de células somáticas demonstrou que a seleção para esta característica poderá resultar em benefícios para a saúde animal e qualidade do leite, porém, somente a longo prazo. A baixa correlação genética existente entre as características produtivas e o escore de células somáticas demonstrou que a inclusão do escore de células somáticas em programas de seleção não causa interferência negativa na seleção genética para a produção de leite ou sólidos.

Heritability of advertisement call properties of the Japanese quail / Herdabilidade de propriedades de chamada de anúncio da codorna japonesa

Abstract The objective of this study was to investigate genetic variances and covariances among features of the male Japanese quail advertisement call. Duration of the first, second and third syllable, the length of interval 1 (between the first and the second syllable), interval 2 (between the second and the third syllable) and damping (extension of the third syllable) were measured as temporal properties of the call. Spectral properties were peak frequencies of each syllable and the damping component. In this study, 1730 calls were recorded from 488 male Japanese quail. The restricted maximum likelihood procedure for repeated measurements was applied to estimate (co)variance components and genetic parameters for the examined traits. Heritability estimates of call parameters of the male Japanese quail ranged from low to high values (0.04-0.65) and they were generally higher for temporal properties than for spectral properties. Among the temporal properties of the call, the highest genetic correlation was between the first and the second syllable (0.96±0.251) while the lowest genetic correlation was between the first and the third syllable (0.03±0.231). Significant genetic correlations were generally high and positive among peak frequencies of the syllables. Despite the lack of apparent pattern, interval lengths tended to have positive correlation with spectral properties of the call, but the correlation of syllable lengths with spectral properties of the call was negative.

Resumo O objetivo deste estudo foi investigar as variâncias e covariâncias genéticas entre as características do canto de anúncio de codornas japonesas. A duração da primeira, segunda e terceira sílaba, o comprimento do intervalo 1 (entre a primeira e a segunda sílaba), o intervalo 2 (entre a segunda e a terceira sílaba) e o amortecimento (extensão da terceira sílaba) foram medidos como propriedades temporais da chamada. As propriedades espectrais foram as frequências de pico de cada sílaba e o componente de amortecimento. Neste estudo, 1730 chamadas foram registradas de 488 codornas japonesas masculinas. O procedimento de máxima verossimilhança restrita para medidas repetidas foi aplicado para estimar componentes de (co) variância e parâmetros genéticos para as características examinadas. As estimativas de herdabilidade dos parâmetros de chamada das codornas japonesas masculinas variaram entre valores baixos e altos (0,04-0,65) e foram geralmente mais elevadas para as propriedades temporais do que para as propriedades espectrais. Dentre as propriedades temporais da chamada, a maior correlação genética foi entre a primeira e a segunda sílaba (0,96 ± 0,251), enquanto a menor correlação genética foi entre a primeira e a terceira sílaba (0,03 ± 0,231). Correlações genéticas significativas foram geralmente altas e positivas entre as frequências de pico das sílabas. Apesar da falta de padrão aparente, os comprimentos de intervalo tenderam a ter uma correlação positiva com as propriedades espectrais da chamada, mas a correlação dos comprimentos das sílabas com as propriedades espectrais da chamada foi negativa.

Morphoagronomic characterization of sweet potato accessions from the germplasm bank of Embrapa hortaliças / Caracterização morfológica de acessos de batata-doce mantidos no banco de germoplasma da Embrapa Hortaliças

Studies on the determination of genetic divergence among genotypes are important tools in breeding programs, contributing to the identification of parents with considerable productive potential. However, little is known about the combinatorial capacity of sweet potato (Ipomoea batatas) accessions and its adaptation to the different regions of Brazil. The objective of this study was to evaluate the morpho-agronomic traits from 102 sweet potato accessions from the Germplasm Bank of Embrapa Hortaliças. The experiment was laid out as an augmented block design comprised of 102 treatments. Nineteen above ground traits were measured using descriptors for the respective parts. Estimated values of broad sense heritability were high for the traits mean branch length (95.75%), immature leaf color (85.06%), and predominant branch color (90.57%). Coefficients of environmental variation were below 30.00% for all variables, except for branch weight (51.62%). The 102 clones analyzed presented broad genetic variability for the different traits evaluated, especially for branch weight, and branch length, and mature leaf color.

Estudos de determinação de divergência genética entre genótipos são ferramentas de grande importância em programas de melhoramento, auxiliando na identificação de genitores com considerável potencial produtivo. No entanto, pouco ainda se sabe sobre a capacidade combinatória de acessos de batata-doce (Ipomoea batatas) e sobre a adaptação a diferentes regiões do Brasil. O objetivo deste trabalho foi avaliar características agronômicas de 102 acessos de batata-doce mantidos no Banco de Germoplasma da Embrapa Hortaliças. O experimento foi instalado utilizando o delineamento em blocos aumentados, com 102 tratamentos. Foram mensuradas 19 características da parte aérea utilizando-se descritores das respectivas partes. Os valores das estimativas de herdabilidade no sentido amplo foram altos para as características comprimento médio das ramas (95,75%), cor da folha imatura (85,06%) e cor predominante da rama (90,57%). Os coeficientes de variação foram inferiores a 30 % para todas as variáveis, exceto para peso das ramas (51.62%). Os 102 clones analisados apresentaram ampla variabilidade genética para as diferentes características avaliadas, principalmente para peso das ramas, comprimento das ramas e cor da folha madura

Interação genótipo x ambiente sobre o desempenho ponderal de animais da raça Nelore na região Centro-Oeste / Genotype environment interaction on the weight gain of animals of the Nelore breed in the Midwest

Utilizaram-se registros de pesos corporais padronizados aos 120, 210, 365 e 450 dias de idade, provenientes de 30.481 animais da raça Nelore, progênies de 211 reprodutores acasalados com 19.229 matrizes, oriundos de rebanhos dos estados de Mato Grosso, Mato Grosso do Sul e Goiás, com o objetivo de avaliar a presença de interação genótipo x ambiente entre os estados. As estimativas de herdabilidade entre os estados variaram de 0,09 a 0,14; 0,11 a 0,17; 0,16 a 0,27 e 0,17 a 0,35, respectivamente, para os pesos 120, 210, 365 e 450 dias de idade. As estimativas de correlação genética aditiva entre a mesma característica para os diferentes estados apresentaram valores inferiores a 0,80. As correlações de Spearman entre os valores genéticos para os pesos corporais se reduziram à medida que se aumentou a intensidade de seleção sobre os reprodutores. A presença de interação genótipo x ambiente causa maior impacto sobre a avaliação genética dos reprodutores sob intensidade de seleção elevada, sendo interessante sua consideração no processo de avaliação genética. Estimativas de tendências genéticas para todos os pesos corporais apresentaram-se crescentes ao longo dos anos nos três estados.(AU)

Data of adjusted alive weights at 120, 210, 365 and 450 days of age of 30,481 records of animals of the Nellore beef cattle breed from herds of states of Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, and Goiás were used to study the influence of environment genotype interaction on genetic evaluation of sires. Estimates of heritability between the states ranged from 0.09 to 0.14; 0.11 to 0.17; 0.16 to 0.27 and 0.17 to 0.35, respectively for live weights 120, 210, 365 and 450 days of age. The estimates of additive genetic correlation between the same characteristic for the different states presented values lower than 0.80. Spearman correlations between breeding values obtained from live weights of sires lowered as the intensity of selection on sires increased. The presence of environment genotype interaction has greater impact on the genetic evaluation of breeding under high intensity of selection, being an interesting consideration in the process of genetic evaluation. Estimates of genetic trends for all body weights have been increasing over the years in all three states.(AU)

Parameters and genetic trends for reproductive characteristics of a closed Angus herd / Parámetros y tendencias genéticas de características reprodutivas de um rebaño cerrado Angus / Parâmetros e tendências de carcaterísticas reprodutivas de um rebanho fechado Angus

Abstract Background: Closed breeding populations are useful to conduct basic and applied research. The Wye Angus herd is one of them. It was founded using only a few animals. The pedigree of the descendants of the original herd can be completely described by historical records resulting from strong selection. Wye Angus genetics has influenced that of Aberdeen Angus, Red Angus, and Brangus cattle worldwide. Objective: To evaluate parameters and genetic trends associated with the reproduction traits of the Wye Angus herd between the years 1937 and 2012. Methods: We used pedigree information of 11,692 individuals. The reproductive traits assessed were age at first calving (AFC), calving interval (CI), and scrotal circumference (SC). The covariance components were estimated by Bayesian inference. The genetic trends were obtained by linear regression of the genetic values over birth years of the animals. Results: The heritability estimates for AFC, and CI were negligible, although a small genetic gain was associated with CI. Because the AFC and CI values of the herd are small, past reproductive management has produced favourable results for the heifers. Conclusion: The Wye Angus herd has enough genetic variability for genetic gain through selection on SC.

Resumen Antecedentes: Las poblaciones reproductivas cerradas son útiles para realizar investigacion básica y aplicada. El hato Wye Angus es uno de ellos. Fue fundado utilizando sólo unos pocos animales. El pedigrí de los descendientes del hato original puede describirse completamente mediante registros históricos resultantes de una fuerte selección. La genética del Wye Angus ha influido en la del Aberdeen Angus, Red Angus y Brangus en todo el mundo. Objetivo: Evaluar los parámetros y las tendencias genéticas de características reproductivas del rebaño Wye Angus en el periodo entre 1937 y 2012. Métodos: Utilizamos información de pedigrí de 11.692 individuos. Las características evaluadas fueron circunferencia escrotal (SC), edad al primer parto (AFC) y el intervalo entre partos (CI). Los componentes de (co)variancia fueron obtenidos mediante metodología Bayesiana. Las tendencias genéticas fueron obtenidas por regresión lineal ponderada de los valores genéticos sobre el año de nacimiento del animal. Resultados: Las estimaciones de heredabilidad para AFC y CI fueron insignificantes, aunque se asoció un pequeño beneficio genético con CI. Sin embargo, la AFC y el CI del rebaño son bajos, indicando que el manejo reproductivo ha traído resultados favorables para las novillas. Conclusion: El rebaño Wye Angus posee suficiente variabilidad genética para la ganancia genética por medio de la selección para SC.

Resumo Antecedentes: O rebanho Wye Angus foi fundado a partir de poucos animais e destaca-se por ser um rebanho fechado, com informações completas de pedigree e forte seleção, oferecendo vantagens únicas em termos de realização de pesquisas em melhoramento genético animal. Além disso, a genética de Wye Angus tem influenciado os de Aberdeen Angus, Red Angus e Brangus em todo o mundo. Objetivo: Avaliar os parâmetros genéticos e tendências de características reprodutivas do rebanho Wye Angus no período entre 1937 e 2012. Métodos: Foram usadas informações do pedigree de 11.692 individuos. As características avaliadas foram: perímetro escrotal (SC), idade ao primeiro parto (AFC), e do intervalo entre partos (CI). Componentes de (co) variância foram obtidos por meio da metodologia Bayesiana. As tendências genéticas foram obtidas por regressão linear ponderada dos valores genéticos sobre o ano de nascimento do animal. Resultados: Hereditariedade para AFC e CI foram insignificantes, embora um pequeno ganho genético tenha sido associado a CI. No entanto, os valores para AFC e CI do rebanho são baixos, indicando que o manejo reprodutivo trouxe resultados favoráveis para as novilhas. Conclusão: O rebanho Wye Angus tem variabilidade genética suficiente para ganho genético através de seleção para SC.

Modelos para avaliação genética da produção de leite no dia do controle nas três primeiras lactações / Models for genetic evaluation of milk yield on the day of control in the three first lactations

Objetivou-se verificar se a utilização do modelo autorregressivo (MAR) é adequada para obtenção de parâmetros genéticos para produção de leite no dia do controle (PLDC) de bovinos leiteiros da raça Gir. Foram analisados 125.191 registros de produções diárias, nas três primeiras lactações, por meio dos modelos de repetibilidade (MREP) e MAR. No MREP, foi considerado o efeito de ambiente de curto prazo; no MAR, foi considerado, também, o efeito de ambiente de longo prazo. Os modelos foram comparados por meio do logaritmo da função de máxima verossimilhança (−2logL) . A herdabilidade estimada pelo MREP foi 0,18; no caso do MAR, as estimativas para primeira, segunda e terceira lactações foram 0,32, 0,28 e 0,26, respectivamente. A estimativa de autocorrelação dos componentes de variância de longo prazo foi próxima de zero, e as de curto prazo foram de alta magnitude para primeira (0,79), segunda (0,79) e terceira (0,81) lactações. Logo, a influência do ambiente de curto prazo dentro de cada lactação não é a mesma. O valor de −2logL mais próximo de zero foi obtido para o MAR (-294.884,7778) em relação ao MREP (-329.266,4810). Assim, o MAR é adequado para obtenção de estimativas de parâmetros genéticos para PLDC nas três primeiras lactações de bovinos leiteiros.(AU)

Aimed to verify if the autoregressive model (MAR) is adequate to obtain genetic parameters for Gyr dairy cattle milk yield on the test day in the three first lactations. Analysis was performed on 125,191 records of daily production of 9,242 cows using repeatability model (MREP) and MAR. On MREP, a long-term environment was considered, on MAR, the short-term environment was also taken into consideration. The models were compared by logarithm of the maximum likelihood function (−2logL) . The heritability estimated using the MREP model was 0.18, while the heritability estimated by MAR for first, second, and third lactations were 0.32, 0.28 and 0.26, respectively. The autocorrelation estimates of the components of long-term variance were close to zero, and those of the short-term were of high magnitude for first (0.79), second (0.79) and third (0.81) lactations. Therefore, the influence of the short-term environment within each lactation is not the same. The value of −2logL closer to zero was obtained for MAR (-294,884.7778) in relation to MREP (-329,266.4810). Thus, MAR is suitable for obtaining genetic parameters estimates for PLDC in the first three lactations of dairy cattle.(AU)

Genetic progress with selection of Coffea canephora clones of superior processed coffee yield / Progresso genético com a seleção de clones de Coffea canephora para produção superior de café beneficiado

ABSTRACT: The aim of this study was to select Coffea canephora clones of superior processed coffee productivity based on the estimates of the genetic parameters and of genetic progress with the plant selection. For this, the production of processed coffee from 130 clones was evaluated from 2014 to 2016 in a clonal test, installed in randomized complete blocks with four plants per plot and six replications, spaced 3 × 2m at the experiment station Embrapa Rondônia in the municipality of Ouro Preto do Oeste - RO. The estimation of genetic parameters and prediction of genotypic values were performed using REML/BLUP procedure (Restricted Maximum Likelihood/Best Unbiased Linear Prediction). Estimates of the genetic parameters confirmed the predominance of the genetic component in the expression of this trait, indicating the possibility of obtaining gains with the plant selection. Genetic progress of processed coffee productivity from the selection of 10% of the best clones was 49.88%, which is equivalent to an increase in average productivity from 42.57 bags.ha-1 to 66.95 bags.ha-1. The use of the harmonic mean of the genetic values helped to identify the clones of superior performance, with higher adaptability and stability for the northern region of Brazil.

RESUMO: O objetivo desse trabalho foi mensurar o progresso genético da produtividade de café beneficiado a partir da seleção de clones de Coffea canephora, com a obtenção de estimativas dos parâmetros genéticos e de ganhos com a seleção ao longo de três safras. Para isso, a produção de café beneficiado de 130 clones foi avaliada nas safras de 2014, 2015 e 2016 em ensaio clonal instalado em blocos completos casualizados, com quatro plantas por parcela e seis repetições, em espaçamento de 3 x 2m na estação experimental da Embrapa Rondônia no município de Ouro Preto do Oeste - RO. A estimação dos parâmetros genéticos e predição dos valores genotípicos foram realizadas utilizando procedimento REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita/melhor predição linear não-viesada). As estimativas dos parâmetros genéticos quantificaram predominância do componente genético na expressão dessa característica, indicando a possibilidade de obtenção de ganhos com a seleção de plantas. O progresso genético da produtividade de café beneficiado com a seleção de 10% dos melhores clones foi de 49,88%, que equivale a um incremento na produtividade média de 42,57 sacas.ha-1 para 66,95 sacas.ha-1. A média harmônica da performance relativa dos valores genotípicos (MHPRVG) permitiu identificar clones de desempenho superior estável em condições tropicais da região Amazônica.

Genetic evaluation of dystocia and its relationship with productive and reproductive traits in Holstein cows¤ / Evaluación genética de distocia y su relación con las características productivas y reproductivas en vacas Holstein / Avaliação genética de distocia e sua relação com características produtivas e reprodutivas em vacas da raça Holandesa

Abstract: Background: dystocia is one of the most economically significant secondary traits in dairy cows and has adverse effects on the subsequent survival, health, and performance of mothers and offspring. Objective: the aim of this study was to estimate direct and maternal genetic parameters for calving ease (CE) and its relationship with productive and reproductive traits in Iranian Holstein cows. Methods: data from 1991 through 2011 were collected from the Animal Breeding Center of Iran, and contained 132,831 records of CE, 183,203 records of productive traits including 305-d adjusted milk yield (MY305), 305-d adjusted fat yield (FY305) and 305-d adjusted protein yield (PY305), and 129,199 records of reproductive traits including days open (DO), days to first service (DFS) and calving interval (CI). Univariate and bivariate linear animal models were used for the analysis of traits in two different models on which direct genetic effect (model 1) and direct + maternal genetic effects (model 2) using AI-REML algorithm were included. Results: estimated heritabilities for CE in model 1 were 0.02 in univariate and 0.02-0.03 in bivariate analyses. Direct and maternal heritabilities in model 2 were 0.02 and 0.002 for univariate, and 0.03 and 0.0004-0.006 in bivariate analyses, respectively. Genetic correlations between direct effects of CE with MY305, FY305, and PY305 were -0.99, 0.02 and-0.07 in model 1, and -0.2, -0.02 and -0.13 in model 2, respectively. Conclusion: this study suggested that a selection index that includes both direct and maternal effects should be included in CE breeding programs.

Resumen Antecedentes: la distocia es uno de los rasgos secundarios económicamente más significativos en las vacas lecheras y tiene efectos adversos sobre la posterior supervivencia, salud y el rendimiento de las madres e hijos. Objetivo: estimar parámetros genéticos directos y maternos para facilidad de parto (CE) y su relación con las características productivas y reproductivas en vacas Holstein iraníes. Métodos: se recogieron datos desde 1991 hasta 2011 en el Centro de Reproducción Animal de Irán, que contenían 132.831 registros de la CE, 183.203 registros de características productivas, incluyendo 305-d ajustado la producción de leche (MY305), 305-d de rendimiento graso ajustado (FY305) y 305-d de producción de proteína ajustada (PY305), y 129.199 registros de características reproductivas, incluyendo días abiertos (DO), días al primer servicio (DFS) y el intervalo entre partos (CI). Se utilizaron modelos animales lineales univariantes y bivariantes para el análisis de rasgos en dos modelos diferentes en los que se incluyeron el efecto genético directo (modelo 1) y los efectos genéticos maternos directos + (modelo 2) usando el algoritmo AI-REML. Resultados: las heredabilidades estimadas para la CE en el modelo 1 fueron 0,02 en uni y 0,02-0,03 en los análisis bivariados. Las heredabilidades directas y maternas en el modelo 2 fueron 0,02 y 0,002 para univariado, y 0,03 y 0,0004 a 0,006 en el análisis bivariado, respectivamente. Las correlaciones genéticas entre los efectos directos de la CE con MY305, FY305 y PY305 fueron -0,99, 0,02 y -0,07 en el modelo 1 y -0,2, -0,02 y -0,13 en el modelo 2, respectivamente. Conclusión: este estudio sugiere que un índice de selección que incluye tanto los efectos directos y maternos se debe incluir en los programas de mejoramiento de la CE.

Resumo Antecedentes: distocia é uma das características secundárias economicamente mais significativas em vacas leiteiras e tem efeitos adversos sobre a subsequente sobrevivência, saúde e desempenho de mães e filhos. Objetivo: o objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos direto e maternos para facilidade de parto (CE) e sua relação com características produtivas e reprodutivas em vacas da raça Holandesa iranianos. Métodos: dados de 1991 a 2011 foram coletados a partir do Centro de Melhoramento Animal do Irã, estes continham 132.831 registros da CE, 183.203 registros de características produtivas, incluindo 305-d rendimento ajustado leite (P305), 305-d produção de gordura ajustada (FY305) e 305-d rendimento ajustado proteína (PY305), e 129.199 registros de características reprodutivas, incluindo jornadas de portas abertas (DO), dias para o primeiro serviço (DFS) e intervalo entre partos (CI). Modelos animais lineares univariados e bivariados foram utilizados para a análise de características em dois modelos diferentes em que foram incluídos efeito genético direto (modelo 1) e efeitos genéticos maternos diretos + (modelo 2) usando o algorítmo AI-REML. Resultados: a herdabilidade estimada para CE no modelo 1 foi 0,02 na análise univariada e 0,02-0,03 na análise bivariada. A herdabilidade direta e materna no modelo 2 foi 0,02 e 0,002 para univariada, e 0,03 e 0,0004-0,006 na bivariada, respectivamente. As correlações genéticas entre os efeitos diretos da CE com P305, FY305 e PY305 foram -0,99, 0,02 e -0,07 no modelo 1 e -0,2, -0,02 e -0,13 no modelo 2, respectivamente. Conclusão: este estudo sugere que um índice de seleção que inclua efeitos diretos e maternos deve ser incluído em programas de melhoramento para CE.

A importância da qualidade da informação na predição de valores genéticos para características de crescimento em bovinos da raça Nelore / The importance of quality information to predict breeding values for growth traits in Nelore cattle

Objetivou-se avaliar a influência da qualidade da informação na predição de valores genéticos para características de crescimento em bovinos da raça Nelore. Foram utilizadas informações de fazendas participantes do Programa Nelore Brasil da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores, considerando-se dados zootécnicos obtidos entre 2012 e 2013. Foram analisadas as características de crescimento relacionadas aos pesos aos 120 (P120), 210 (P210), 365 (P365) e 450 (P450) dias de idade, sob diferentes cenários: inclusão de todas as informações de lote de manejo (cenário de referência) e inclusão aleatória de 90%, 70%, 50%, 30% e 0% das informações de lote de manejo dos animais com medidas fenotípicas. Os valores genéticos foram preditos mediante análises unicaracterísticas sob modelo animal. Ocorreram alterações em todos os parâmetros genéticos quando comparados aos obtidos pelo cenário de referência. Houve um aumento nas estimativas de herdabilidade à medida que se reduziu o número de informações sobre os lotes de manejo. Esses resultados sugerem que o progresso genético estimado para rebanhos com baixa qualidade da informação zootécnica pode não expressar adequadamente o que realmente está ocorrendo com o rebanho, uma vez que as estimativas de herdabilidade podem estar infladas. Verificou-se que houve alteração na classificação dos animais para todas as características de crescimento avaliadas. A qualidade da informação zootécnica influencia na predição dos valores genéticos para as características de crescimento.

The objective was to evaluate the influence of information quality in the prediction of genetic values for the Nellore cattle's growth traits. The information came from cattle farms participating in the program of the Brazilian National Association of Breeders and Researchers (ANCP), from 2012 to 2013. Field data such as batch or management group were considered assessment criteria, and the growth traits related to body weight at 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365) and 450 (W450) days under different scenarios: inclusion of all management lot information; and random inclusion of 90%, 70%, 50%, 30% and 0% of the batch management of information from animals with phenotypic measurements. Breeding values were predicted by using univariate models in animal model. Changes on all genetic parameters were compared to those obtained in the reference scenario. There was an increase in the estimates of heritability as it reduced the number of details about lots of management. These results suggest that gene progress estimated herds with low quality information do not adequately represent what truly occurs with the herd, since heritability estimates may be inflated. Change in the classification of animals was found at all the growth traits. The quality information influences the prediction of breeding values for growth traits.

Performance of sweet potato clones for starch and ethanol in three regions of the state of Sergipe, Brazil / Desempenho de clones de batata doce para amido e etanol em três regiões do estado de Sergipe, Brasil

Sweet potato (Ipomoea batatas L.) is a species that belongs to the family Convolvulaceae, and is originated from Central America and South America. As the growing conditions have great influence on the crop, the determination of harvesting time may vary with the cultivar, the growing region, or with the type of consumption (in natura or industrial). The aim of this work was to evaluate the performance of Ipomoea batatas L. clones, cultivated in three regions in the state of Sergipe, for starch and ethanol production. Thirty-one sweet potato clones grown in three municipalities of the state of Sergipe were tested in a randomized block design. The following variables were analyzed: root dry matter content (RDMC), root starch content (SC), starch yield (SY), ethanol yield (EY), and ethanol yield per ton of root (EYR). EY values ranged from 5910.39 to 8516.12 L ha-1; from 5141.85 to 6937.63 L ha-1; and from 5829.62 to 8211.77 L ha-1 in the municipalities of São Cristóvão, Malhador, and Canindé de São Francisco, respectively, for clones IPB-075 and IPB-087 and cultivar Palmas. Estimates of heritability (h2) were above 50%. The values of the ratio between the coefficient of genetic variation (CVg) and the coefficient of environmental variation (CVe) for RDMC, SC, and EYR were high.

A batata doce é uma espécie pertencente a família Convolvulaceae, originária da América Central e do Sul. As condições de cultivo têm grande influência na produção, sendo que a determinação do tempo de colheita varia de acordo com a cultivar, com a região de cultivo e com a forma de consumo (in natura ou industrial). O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho de clones de batata-doce (Ipomoea batatas L.) cultivados em três regiões do estado de Sergipe para produção de amido e etanol. Testou-se, em delineamento de blocos casualizados, 31 genótipos de batata doce em três município do Estado de Sergipe. As características analisadas foram: teor de matéria seca de raízes (RDMC), teor de amido nas raízes (SC), rendimento de raízes (SY), rendimento de etanol (EY) e rendimento de etanol por tonelada de raiz (EYR). Os valores de EY variaram de 5910,39 a 8516,12 L.ha-1, de 5141,85 a 6937,63 L ha-1 e de 5829,62 a 8211,77 L ha-1 para São Cristóvão, Malhador e Canindé de São Francisco, respectivamente, para os clones IPB-075 e IPB-087 e a cultivar Palmas. As estimativas de herdabilidade (h2) foram superiores a 50 %. Os valores da razão entre o coeficiente de variação genotípica e o ambiental para RDMC, SC, e EYR foram altos.

Heritability of advertisement call properties of the Japanese quail

Abstract The objective of this study was to investigate genetic variances and covariances among features of the male Japanese quail advertisement call. Duration of the first, second and third syllable, the length of interval 1 (between the first and the second syllable), interval 2 (between the second and the third syllable) and damping (extension of the third syllable) were measured as temporal properties of the call. Spectral properties were peak frequencies of each syllable and the damping component. In this study, 1730 calls were recorded from 488 male Japanese quail. The restricted maximum likelihood procedure for repeated measurements was applied to estimate (co)variance components and genetic parameters for the examined traits. Heritability estimates of call parameters of the male Japanese quail ranged from low to high values (0.04-0.65) and they were generally higher for temporal properties than for spectral properties. Among the temporal properties of the call, the highest genetic correlation was between the first and the second syllable (0.96±0.251) while the lowest genetic correlation was between the first and the third syllable (0.03±0.231). Significant genetic correlations were generally high and positive among peak frequencies of the syllables. Despite the lack of apparent pattern, interval lengths tended to have positive correlation with spectral properties of the call, but the correlation of syllable lengths with spectral properties of the call was negative.

Resumo O objetivo deste estudo foi investigar as variâncias e covariâncias genéticas entre as características do canto de anúncio de codornas japonesas. A duração da primeira, segunda e terceira sílaba, o comprimento do intervalo 1 (entre a primeira e a segunda sílaba), o intervalo 2 (entre a segunda e a terceira sílaba) e o amortecimento (extensão da terceira sílaba) foram medidos como propriedades temporais da chamada. As propriedades espectrais foram as frequências de pico de cada sílaba e o componente de amortecimento. Neste estudo, 1730 chamadas foram registradas de 488 codornas japonesas masculinas. O procedimento de máxima verossimilhança restrita para medidas repetidas foi aplicado para estimar componentes de (co) variância e parâmetros genéticos para as características examinadas. As estimativas de herdabilidade dos parâmetros de chamada das codornas japonesas masculinas variaram entre valores baixos e altos (0,04-0,65) e foram geralmente mais elevadas para as propriedades temporais do que para as propriedades espectrais. Dentre as propriedades temporais da chamada, a maior correlação genética foi entre a primeira e a segunda sílaba (0,96 ± 0,251), enquanto a menor correlação genética foi entre a primeira e a terceira sílaba (0,03 ± 0,231). Correlações genéticas significativas foram geralmente altas e positivas entre as frequências de pico das sílabas. Apesar da falta de padrão aparente, os comprimentos de intervalo tenderam a ter uma correlação positiva com as propriedades espectrais da chamada, mas a correlação dos comprimentos das sílabas com as propriedades espectrais da chamada foi negativa.

Multi-Trait analysis of growth traits: fitting reduced rank models using principal components for Simmental beef cattle / Efetividade da redução da dimensão da matriz de covariância do efeito genético direto na avaliação genética do crescimento em bovinos Simental

ABSTRACT: The aim of this research was to evaluate the dimensional reduction of additive direct genetic covariance matrices in genetic evaluations of growth traits (range 100-730 days) in Simmental cattle using principal components, as well as to estimate (co)variance components and genetic parameters. Principal component analyses were conducted for five different models-one full and four reduced-rank models. Models were compared using Akaike information (AIC) and Bayesian information (BIC) criteria. Variance components and genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood (REML). The AIC and BIC values were similar among models. This indicated that parsimonious models could be used in genetic evaluations in Simmental cattle. The first principal component explained more than 96% of total variance in both models. Heritability estimates were higher for advanced ages and varied from 0.05 (100 days) to 0.30 (730 days). Genetic correlation estimates were similar in both models regardless of magnitude and number of principal components. The first principal component was sufficient to explain almost all genetic variance. Furthermore, genetic parameter similarities and lower computational requirements allowed for parsimonious models in genetic evaluations of growth traits in Simmental cattle.

RESUMO: Objetivou-se estudar a efetividade da redução da dimensão da matriz de covariância do efeito genético direto na avaliação genética do crescimento (pesos dos 100 aos 730 dias de idade) de bovinos Simental, por meio da análise de componentes principais, e estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos. A análise de componentes principais foi realizada ajsutando-se cinco diferentes modelos: um modelo multicaracterístico padrão, de posto completo, e quatro modelos de posto reduzido. Os modelos foram comparados via informação de Akaike (AIC) e informação Bayesiana de Schwarz (BIC). Os componentes de variância e parâmetros genéticos foram obtidos via REML. Os valores de AIC e BIC para os modelos testados foram similares, indicando a possibilidade da escolha de um modelo mais parcimonioso na avaliação genética da raça Simental. O primeiro componente principal explicou mais de 96% de toda variação genética aditiva direta em ambos os modelos. Os valores de herdabilidades foram maiores em idades mais avançadas e variaram de 0,05 (peso aos 100 dias) a 0,30 (peso aos 730 dias). As estimativas de correlações genéticas foram similares em todos os modelos e apresentaram mesma magnitude e comportamento independentemente do número de componentes principais adotado. Diante dos resultados, pode-se afirmar que apenas o primeiro componente principal foi suficiente para explicar quase que na totalidade a variação genética aditiva direta existente. Além disso, a similaridade dos parâmetros genéticos estimados e a menor demanda computacional são indicativos da possibilidade da utilização de modelos mais parcimoniosos na avaliação genética de bovinos Simental.