An R Script to Estimate Which and How Many Landmarks Represent the Most Variable Parts of an Object / Un Script R para Estimar Cuáles y Cuántos Puntos de Referencia Representan las Partes más Variables de un Objeto

SUMMARY: The study of the shape variation in geometric morphometrics has an important limitation known as the Pinocchio effect. The Pinocchio effect produces artifactual variances of the landmarks and implies that it is not possible to know the morphological change structure of an object, other than by dividing the landmark sets and then comparing them. This, however, involves making prior assumptions about the pattern of variation of an object. In this study, we provide a code in R to iterate over a complete set of landmarks and test all possible combinations of landmarks until deliver those landmarks associated with the largest to the smallest morphological changes. We tested this on a sample of 28 landmarks in 143 3D models of human skulls. The results indicated that this process can result in a pooled variance of a subset of landmarks that is an order of magnitude larger than that of several other regions of the skull. This method makes it possible to describe the pattern of variation of any 2D or 3D object represented by fixed landmarks, to distinguish the shape features that have more morphological dispersion, and to avoid any aprioristic assumptions about how the morphological changes of an object behave.

El estudio de la variación de la forma en morfometría geométrica tiene una limitación importante conocida como efecto Pinocho. El efecto Pinocho produce variaciones artefactos de los puntos de referencia e implica que no es posible conocer la estructura del cambio morfológico de un objeto, salvo dividiendo los conjuntos de puntos de referencia y luego comparándolos. Sin embargo, esto implica hacer suposiciones previas sobre el patrón de variación de un objeto. En este estudio, proporcionamos un código en R para iterar sobre un conjunto completo de puntos de referencia y probar todas las combinaciones posibles de puntos de referencia hasta entregar aquellos puntos de referencia asociados con los cambios morfológicos más grandes a los más pequeños. Probamos esto en una muestra de 28 puntos de referencia en 143 modelos 3D de cráneos humanos. Los resultados indicaron que este proceso puede dar como resultado una variación combinada de un subconjunto de puntos de referencia que es un orden de magnitud mayor que el de varias otras regiones del cráneo. Este método permite describir el patrón de variación de cualquier objeto 2D o 3D representado por puntos de referencia fijos, distinguir las características de forma que tienen más dispersión morfológica y evitar suposiciones apriorísticas sobre cómo se comportan los cambios morfológicos de un objeto.

Importância do raciocínio etiológico e topográfico de lesões: relato de neuropatia óptica traumática conduzida como acidente vascular cerebral / Importance of etiological and topographic injury reactions: report of a traumatic optic neuropathy conducted as a cerebrovascular accident

Introdução: O trauma ocular ou periocular pode afetar o nervo óptico e causar baixa acuidade visual ou alteração de campo visual. Essa lesão, denominada neuropatia óptica, quando de etiologia traumática, pode ser classificada como direta, através da compressão, perfuração ou laceração do nervo óptico por ação de corpos estranhos, fraturas do assoalho da órbita ou hemorragias, e indireta, quando a partir de um trauma externo ao globo ocular há lesão por transmissão da onda de choque ou desaceleração, levando à lesão do nervo óptico pelo estiramento de suas fibras ou edema comprometendo sua vascularização, comum nos acidentes automobilísticos e nas quedas. Descrição do Caso: O presente estudo objetiva relatar um caso de neuropatia óptica traumática conduzida erroneamente como acidente vascular cerebral em uma paciente do sexo feminino de 29 anos, com história de queda da própria altura. Discussão: A investigação feita pela história clínica, evolução do quadro e novos achados fundoscópicos permitiu o diagnóstico correto e melhor orientação da paciente. Conclusão: O conhecimento da neuropatia óptica traumática e da anatomia da via óptica têm extrema importância no raciocínio topográfico e etiológico das lesões traumáticas que cursam com comprometimento visual, poupando o paciente de possíveis intervenções invasivas e desnecessárias (AU)

Introduction: Eye or periocular trauma can affect the optic nerve and cause low visual acuity or visual field alteration. This lesion, called optic neuropathy, when of traumatic etiology, can be classified as direct, through compression, perforation or laceration of the optic nerve by action of foreign bodies, fractures of the orbit floor or hemorrhages, and indirect, when from an external trauma to the eyeball there is injury by transmission of the shock wave or deceleration, leading to optic nerve injury by stretching its fibers or edema compromising its vascularization, common in automobile accidents and falls. Case Report: The present study aims to describe a case of traumatic optic neuropathy mistakenly conducted as a stroke in a 29-yearold female patient with a history of falling from his own height. Discussion: The investigation was possible because of the clinical history, evolution of the condition and new fundoscopic findings that allowed the correct diagnosis and better orientation of the patient. Conclusion: Knowledge of traumatic optic neuropathy and anatomy of the optical pathway have extreme importance in the topographic and etiological reasoning of traumatic lesions that present with visual impairment, saving the patient from possible interventions invasive and unnecessary. (AU)

Tips for studies with quantitative morphology (morphometry and stereology) / Consejos para los estudios de morfología cuantitativa (morfometría y estereología)

SUMMARY: The quantitative morphology contributes to making the studies less subjective and reproducible. Quantitative results are analyzed with statistics and should be based on a well-defined sample. Quantitative variables can be 'continuous' or 'discrete.' In this text, the term 'morphometry' is used to design a simpler procedure for measuring structures with a 'ruler.' The term 'stereology' is used in estimating quantities in the 3-dimensional space analyzing 2-D cut sections. Correction factors may be necessary for the retraction and compression of the tissues. In histological sections, the 'caps' of the objects that have been sectioned tangentially are lost when chemical agents remove the paraffin distorting the analysis. Moreover, the analyses based on digital images should consider the same format and the same size (pixels) to all pictures allowing a comparison between groups. Stereology can be 'model-based': points within a frame are counted to estimate the 'volume density' (Vv) of a structure, and intercepts are counted to assess the 'surface density' (Sv). Counting structures within a frame allow estimating the 'length density' (Lv). Newer and more complex 'design-based' procedures are considered unbiased. The key point is that design-based inference does not require assumptions about the material and uses the 'random sampling' approach. The estimation of the number of objects requires a 3-D (volume) probe and therefore the 'disector' technique. This review aimed to contribute to the execution of the project, the correct sampling and the data obtained with morphometry and stereology.

RESUMEN: La morfología cuantitativa contribuye a que los estudios sean menos subjetivos y reproducibles. Los resultados cuantitativos son analizados con estadística y deben basarse en una muestra bien definida. Las variables cuantitativas pueden ser "continuas" o "discretas". En este texto, el término 'morfometría' es usado para diseñar un procedimiento más simple para medir estructuras con una 'regla'. El término "estereología" se usa para estimar cantidades en espacio 3-D analizando secciones de corte en 2-D. Factores de corrección pueden ser necesarios por la retracción y compresión de los tejidos. En secciones histológicas, los "tapones" de las muestras que han sido seccionadas tangencialmente se pierden cuando los agentes químicos eliminan la parafina distorsionando así el análisis. Además, los análisis basados en imágenes digitales deben considerar el mismo formato y el mismo tamaño (píxeles) para todas las imágenes, lo que permite una comparación entre grupos. La estereología puede estar "basada en modelos": los puntos dentro de un marco se cuentan para estimar la "densidad de volumen" (Vv) de una estructura, y las interceptaciones o intersecciones son contadas para evaluar la "densidad de superficie" (Sv). Las estructuras contadas dentro de un marco permiten estimar la 'densidad de longitud' (Lv). Los procedimientos más nuevos y más complejos basados en el diseño se consideran imparciales y objetivos. El punto clave es que el diseño basado en la inferencia no requiere suposiciones acerca del material y utiliza el enfoque de "muestreo aleatorio". La estimación del número de objetos requiere una prueba 3-D (volumen) y, por lo tanto, la técnica "disector". Esta revisión tuvo como objetivo contribuir a la ejecución del proyecto, el muestreo correcto y los datos obtenidos con morfometría y estereología.

Uso da glicerina para a substituição do formaldeído na conservação de peças anatômicas / Gliceryn can replace formaldehyde for anatomic conservation

A formalização é a principal forma de conservação de corpos e peças anatômicas, devido principalmente ao seu baixo custo. A técnica baseia-se na utilização do formaldeído (5-20%) como fixador e conservador. Entretanto existem vários fatores negativos à sua utilização, como odor desagradável, escurecimento, aumento de peso e rigidez das peças e sérios problemas ambientais quando descartada de forma incorreta, além de ser um produto classificado pela Agência Internacional de Pesquisas em Câncer como altamente cancerígeno. Existem várias opções para substituir o formaldeído, a glicerinação é uma delas, cujo será tratada neste trabalho. A glicerina atua como antifúngico e bactericida, além de ter muitas vantagens em relação ao formol, tratando-se de odor, textura e coloração, além de não ser prejudicial a saúde. Porém o seu custo ainda é elevado e isso explica sua pouca utilização em laboratórios de anatomia. Este trabalho tem como objetivo mostrar as vantagens do uso da glicerina em relação ao formol e propor uma possível substituição deste produto cancerígeno para preservar a saúde dos alunos, funcionários e professores dentro do laboratório, além de permitir um ambiente mais agradável para o aprendizado.(AU)

The formalization is the main form of body and anatomic conservation, mainly due to its low cost. The technique is based on the use of formaldehyde (5-20%) as fixative and preservative. However there are several negative factors on their use, unpleasant smell, browning, weight gain and stiffness of parts and serious environmental problems if disposed of incorrectly, and is a product classified by the International Agency for Research on Cancer as highly carcinogenic. There are several options to replace formaldehyde and glicerinação is one of them, whose which will be treated in this work. Glycerin dehydrates the cell and acts as antifungal and antibacterial, and has many advantages compared to formaldehyde. But its cost is still high and this explains their limited use in the anatomy lab. This work aims to show the advantages of using glycerin in relation to formaldehyde and propose a possible replacement of this carcinogen to preserve the health of students, staff and teachers within the laboratory, and allows a more pleasant environment for learning.(AU)

Biomodelo para la docencia de grado y postgrado en pediatría / Biomodel for teaching undergraduate and graduate in pediatrics

Introducción: La incorporación de la Clínica y la Imagenología permiten una mejor comprensión de la Anatomía. El objetivo de este trabajo es desarrollar un prototipo rápido en material sintético que replique detalles anatómicos para ser utilizado en la docencia de grado y postgrado en Pediatría. Material y Método: Caso 1: Niña de 1 año de edad con síndrome de dificultad respiratoria a causa de una malformación vascular. Caso 2: recién nacido con malformación torácica. Con la finalidad de analizar una conducta adecuada, se solicitó la confección de un prototipo rápido a escala 1:1 que simulara una condición idéntica a la topografía torácica del paciente, utilizando imágenes virtuales 3D almacenadas en formato DICOM.Técnica de generación de prototipo rápido: Se obtuvouna malla digital tridimensional y se generó el código “g”que se utilizó para controlar el hardware de producción. Se efectuó simulación digital y producción en material plástico (ABS) con técnica de deposición y fusión (MDF).Se validó el prototipo comparándo lo con las mediciones testigos del modelo virtual en 3 D.Resultados y Discusión: El modelo replicó exactamente los defectos hallados en la tomografía y endoscopía, confirmando la presencia de la malformación vascular y su repercusión sobre el aparato respiratorio. El prototipo rápido muestra las estructuras internas y externas del cuerpo humano con máxima precisión permitiendo una visión topográfica de situaciones “normales o patológicas” que facilitaría la docencia y el entrenamiento del equipo quirúrgico para proponer un plan de tratamiento adecuado. Hay numerosas áreas de la medicina que sebeneficiarían con este modelo que podría ser construído con diversos tipos de materiales de diferente flexibilidad y consistencia. Conclusiones: El prototipo rápido le da estado físico a las imágenes virtuales 3D, permitiendo la docencia y entrenamiento del equipo quirúrgico.

Introduction: The incorporation of the clinic and the imaging allow a better understanding of anatomy. Theaim of this work is to develop a rapid prototype in synthetic material that replicates anatomical details to be used inteaching and surgical training in Pediatrics. Material and method: Case 1: one year old female with respiratory distress syndrome because of vascular malformation. Case 2: newborn patient with thoracic malformation. In order to discuss appropriate conduct, the making of rapid prototyping in scale 1:1 was requested to simulate an identical condition of the thoracic topography of the patients, using virtual 3D images stored in the DICOM format. Rapid prototype technique: code "g" was generated, which was used to control the hardware of production and a three-dimensional digital grid was obtained. Digital simulation and production in plastic (ABS) with deposition and fusion technique (MDF) was performed. The prototype was validated by comparing measurements with witnesses of the virtual model in 3 D. Results and discussion: the model replied exactly the defects found in the scan and endoscopy, confirming the presence of vascular malformation and its impact on the respiratory system. Rapid prototype shows the internal and external structures of the human body with maximum precision allowing a topographic view of "normal or pathological" situations that would facilitate the teaching and training of the surgical team to propose an appropriate treatment plan. There are many areas of medicine that would benefit from this model that couldbe built with different types of materials with different flexibility and consistency. Conclusions: Rapid prototype gives form to virtual 3D images, allowing teaching and training of the surgical team.

Anatomia dos órgãos vegetativos de Hymenaea martiana Hayne (Caesalpinioideae-Fabaceae): espécie de uso medicinal em Caetité-BA / Anatomy of vegetative organs of Hymenaea martiana Hayne (Fabaceae-Caesalpinioideae): a species of medicinal use in Caetité-Bahia State, Brazil

Hymenaea martiana Hayne (Fabaceae-Caesalpinioideae) apresenta grande valor na medicina popular em Caetité. A casca, entrecasca do caule e a resina, são utilizadas no tratamento de diversos males. Neste estudo são apresentadas a caracterização anatômica e histoquímica dos órgãos vegetativos. Amostras foram coletadas e processadas segundo técnicas usuais em anatomia vegetal e histoquímica. Todos os órgãos apresentam, em visão transversal, epiderme unisseriada e cavidades secretoras. Cutícula espessa ocorre em todos os órgãos aéreos. A raiz é tetrarca. Colênquima lacunar foi encontrado no caule. Bainha de fibras esclerenquimáticas envolve os feixes vasculares dos órgãos aéreos. Células pétreas ocorrem no pecíolo. Tricomas tectores ocorrem em ambas as faces da folha. A folha é hipoestomática com estômatos paracíticos e o mesofilo é dorsiventral. Cristais de oxalato de cálcio ocorrem no caule, pecíolo e lâmina foliar. Compostos fenólicos ocorrem na raiz, pecíolo e nervura central da folha. Grãos de amido ocorrem na raiz, caule e pecíolo. Lipídios ocorrem em todos os órgãos. Acredita-se que compostos fenólicos e cavidades secretoras de resina podem justificar a utilidade medicinal da espécie pela população de Caetité.

Hymenaea martiana Hayne (Fabaceae-Caesalpinioideae) shows a great value in folk medicine in Caetité. Its bark, stem-bark and resin are used to treat various ailments. In this study, the anatomical and histochemical characterization of vegetative organs is reported. Samples were collected and processed according to usual techniques of plant anatomy and histochemistry. All organs have, by cross-sectional view, uniseriate epidermis and secretory cavities. Thick cuticle occurs in all aerial organs. The root is tetrarch. Lacunar collenchyma was found in the stem. Sclerenchymatic sheath of fibers surrounds the vascular bundles of the aerial organs. Stone cells occur in the petiole. Trichomes occur on both sides of the leaves. The leaf is hypostomatic with paracytic stomata and the mesophyll is dorsiventral. Calcium oxalate crystals occur in the stem, petiole and leaf blade. Phenolic compounds occur in the root, petiole and midrib of the leaf. Starch grains occur in the root, stem and petiole. Lipids occur in all organs. It is believed that phenolic compounds and resin secretory cavities may justify the use of medicinal species by the population of Caetité.

Revision of the genus Macropsobrycon Eigenmann, 1915 (Characidae: Cheirodontinae: Compsurini)

The cheirodontine genus Macropsobrycon is redefined and considered monotypic. The type species, M. uruguayanae, is redescribed based on samples from the entire known geographical distribution of the species. Sexually dimorphic characters of M. uruguayanae are further described and the relationships of the species with the remaining Compsurini are discussed.

O gênero Macropsobrycon de Cheirodontinae é redefinido e considerado monotípico. A espécie-tipo, M. uruguayanae, é redescrita com base em amostras de toda a distribuição geográfica conhecida da espécie. Caracteres de dimorfismo sexual secundário de M. uruguayanae são descritos e as relações da espécie com outros Compsurini são discutidas.

Anatomía y competencias clínicas en odontología: estudio basado en apreciación de estudiantes / Anatomy and clinical competences in dentistry: study based on students appreciation

La Anatomía entrega a los estudiantes conceptos sobre la estructura, pero sobre todo un método de estudio y una nomenclatura que serán usados en asignaturas básicas y clínicas, motivo por lo que la disciplina se enseña en los primeros años de la Carrera. La educación basada en competencias enfatiza el producto final y define lo que debe saber el alumno al finalizar su formación, independiente de cómo lo enseñó el profesor o los sistemas de aprendizaje que utilizó. Las competencias finales determinan lo que se ha de enseñar e identifican lo esencial de lo superfluo. Representa el mejor método para acreditar la calidad del producto elaborado por cada institución de Educación Superior, el profesional que se envía al medio para cumplir su rol en la comunidad. Las competencias y habilidades del Cirujano Dentista general, dependerán de las exigencias que se establezcan en el ámbito público y privado para su desempeño profesional. La presente investigación pretende obtener información de todos los estudiantes que cursan las asignaturas clínicas de Odontología en la Universidad de Antofagasta (n=95), referente a apreciación del nivel curricular de la asignatura, la continuidad del aprendizaje, medios de reforzamiento y comprobar el factor de olvido de la Anatomía, mediante un cuestionario de preguntas básicas para realizar competencias clínicas. Los resultados de la evaluación demostraron que ningún curso alcanzó el 60 por ciento de rendimiento mínimo exigido. La mayoría de los alumnos recomiendan que la asignatura de Anatomía General se mantenga en el primer nivel curricular y que se establezca una asignatura de Anatomía de Cabeza y Cuello en cursos superiores, además, que en cada curso clínico, un anatomista aporte el enfoque anatómico requerido. Se destacan los medios de reforzamiento utilizados y la apreciación personal del conocimiento anatómico que se disponía al momento de iniciar cursos clínicos.

The Anatomy gives to the students concepts on the structure, but mainly a method of study and a nomenclature that will be used in clinical basic subjects. This is the main reason why the discipline is taught in the first years of the careers. The education based on competences emphasizes the product and defines what the student must know when finalizing, independent of how to the professor taught or the learning systems used. The final competences determine what it is had to teach and identify the essential of the superfluous things. It represents the best method to credit the quality of the "manufactured product" by each institution of higher education, the professional who is sent to fulfil his roll in the community. The competences and abilities of the surgeon general dentist will depend on the exigencies that settle down in the public and private sector for their professional performance. The present investigation tries to obtain data of all the students who attend the clinical subjects of dentistry in the University of Antofagasta (n=95). It deals with the appreciation that they have respect to the curricular level of the subject, the continuity of the learning, means of reinforcing, and to verify the factor of forgetfulness of the anatomy by means of a questionnaire of basic questions to make clinical competences. The results of the evaluation demonstrated that no course reached the required minimum of 60%. Most of the students recommend that the subject of General Anatomy stays in the first curricular level and that a subject of Anatomy of Head and Neck in superior courses settles down. In addition, that in each clinical course, an anatomist contributes the required anatomical approach. Stand out the means of reinforcing used and the personal appreciation of the anatomical knowledge that that each student has at the time of initiating clinical courses.

Confección de un modelo transparente de cerebro humano desmontable en secciones horizontales seriadas / Construction of a transparent model of a dismountable human brain in serial horizontal sections

Se describen paso a paso las etapas de confección de un modelo a escala 1:1 de un cerebro humano cortado serialmente en secciones horizontales de 5 mm. de grosor usando como materia prima una plancha de acrílico transparente de 5 mm. de grosor. El modelo terminado presenta características de tridimensionalidad, transparencia, desmontabilidad y fidelidad que permite a demostradores y estudiantes analizar con facilidad las relaciones espaciales de los Ventrículos Cerebrales con los Tálamos, Formación Hipocampal, Fórnix y Núcleos Basales

Uso de yeso emparafinado en la fabricación de modelos anatómicos / Use of paraffinated gypsum in the construction of anatomical models

Frente al problema de los insuficientes presupuestos de las Unidades de Anatomía, nace la necesidad de improvisar recursos materiales anatómicos en cantidad adecuada para utilizarlos como estrategias de apoyo didáctico en el diseño metodológico. Uno de los materiales más al alcance y de apropiadas características pueden ser el yeso corriente o el yeso dental. La técnica del yeso emparafinado implica desarrollar una batería que termina con la inclusión en parafina sólida de los modelos obtenidos de piezas cadavéricas u otros modelos que se puedan reproducir en serie de acuerdo a las necesidades académicas. El uso de modelos de yeso emparafinado permite, además el estudio ex-aula por parte de nuestros alumnos, lo que resuelve provechosamente el problema de la falta de tercera dimensión de las láminas de los textos

Contribución al estudio de la resina poliester para su uso en docencia e investigación anatómica / Contribution to the study of the polyester resin for teaching and anatomical research

En el presente trabajo se estudian las posibilidades de la resina poliester en relación con las técnicas anatómicas tradicionales y en otras originales. Se experimentó con la resina PALATAL A410., GELCOTH, y BIFENOLICA en: inyección de arterias, venas y linfáticos en vísceras. Inyección de vasos encefálicos. Corrosión de vísceras inyectadas con resina. Inclusión de cortes anatómicos con y sin fijación previa. Diafanizado de fetos inyectados por cordón umbilical con resina Palatal. Reproducción de preparaciones. Reproducción de modelos anatómicos. Moldes de cavidades cardíacas. Confección de macromodelos. Pintura y protección de estructuras en la disección. Poder de fijación de tejido de la resina. Los resultados confirman que es un material que puede utilizarse en docencia e investigación, de un costo relativamente bajo, posible de conseguir en nuestro país y de fácil manipulación