Shedding of infectious SARS-COV-2 in two asymptomatic children / Excreción de SARS-CoV-2 infeccioso en dos niños asin tomáticos

Abstract Asymptomatic infections with SARS-CoV-2 are associ ated with viral transmission and have a key role in the propagation of the pandemic. Understanding viral shed ding during asymptomatic infections is critical. Unfor tunately, data on asymptomatic SARS-CoV-2 infection in children is extremely limited. To determine the presence of viral viable shedding, we prospectively followed two healthy children of a family where both parents devel oped mild COVID-19 (April 2021). SARS-CoV-2 detection was made by RT-PCR and virus isolation by cell culture from saliva samples. Positive samples were sequenced to identify variants of SARS-CoV-2. Serum samples were evaluated to determine the presence of antibodies using a single enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA, COVIDAR IgG). Both children were SARS-CoV-2 positive and asymptomatic. In addition, the virus grew in cell cul ture from saliva samples. Furthermore, one child showed viable SARS-CoV-2 for at least 17 days after the onset symptoms from his father. The recommended isolation period for asymptomatic contacts during the acquisition of data had been established for 10 days; however, this child remained with viable virus beyond that period. The positive samples from both children were consistent with B.1.1.28.1 lineage (Gamma). In both asymptomatic children, anti-Spike IgG was detected. Asymptomatic children may represent a source of infection that should not be underestimated during this pandemic.

Resumen Las infecciones asintomáticas por SARS-CoV-2 están asociadas a la transmisión viral y tienen un papel cla ve en la propagación de la pandemia. Comprender la excreción viral durante las infecciones asintomáticas es fundamental. Desafortunadamente, los datos sobre la infección asintomática por SARS-CoV-2 en niños son extremadamente limitados. Para determinar la presencia de excreción de virus viable, se siguió prospectivamente a dos niños sanos de una familia en la que ambos padres desarrollaron COVID-19 leve (abril 2021). La detección de SARS-CoV-2 se realizó por RT-PCR y el aislamiento del virus por cultivo celular a partir de muestras de saliva. Las muestras positivas se secuenciaron para identificar variantes de SARS-CoV-2. En las muestras de suero se determinó la presencia de anticuerpos utilizando un ensayo de ELISA (COVIDAR IgG). Ambos niños fueron positivos para SARS-CoV-2 y asintomáticos. Además, el virus creció en cultivos celulares a partir de muestras de saliva. Uno de los niños mantuvo SARS-CoV-2 via bles durante al menos 17 días después de la aparición de los síntomas de su padre. El período de aislamiento recomendado para contactos asintomáticos durante la adquisición de datos se había establecido en 10 días, sin embargo, este niño permaneció con virus viable más allá de ese período. Las muestras positivas de estos niños correspondieron al linaje B.1.1.28.1 (Gamma). En ambos niños asintomáticos se detectó anticuerpos IgG anti-Spike. Concluimos que los niños asintomáticos pueden representar una fuente de infección que no debe subestimarse durante esta pandemia.

Virus sincicial respiratorio en niños nacidos prematuros: 19 años de vigilancia epidemiológica activa en un hospital pediátrico / Respiratory syncytial virus in preterm infants: 19 years of active epidemiological surveillance in a children's hospital

Introducción. El virus sincicial respiratorio (VSR) es el principal agente causal de la infección respiratoria aguda baja (IRAB) en pediatría. Los niños prematuros tienen mayor riesgo de complicaciones asociadas con esta infección. Los objetivos fueron describir y comparar las características clínicas y epidemiológicas asociadas a IRAB por VSR en niños/as nacidos pretérmino y a término, y establecer predictores de letalidad en los prematuros.Métodos. Estudio prospectivo, transversal, de pacientes ingresados por IRAB, en el período 2000-2018. El diagnóstico virológico se realizó mediante inmunofluorescencia indirecta o reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa de aspirados nasofaríngeos. Se registraron las características clínico-epidemiológicas. Se desarrolló un modelo de regresión logística múltiple para establecer los predictores de letalidad en prematuros.Resultados. Se incluyeron 16 018 casos de IRAB; 13 545 (el 84,6 %) fueron estudiados; 6047 (el 45 %) positivos; VSR predominó en el 81,1 % (4907); mostró un patrón epidémico estacional; el 14 % (686) fueron prematuros.Los prematuros mostraron mayor frecuencia de comorbilidades, antecedentes respiratorios perinatales, cardiopatía congénita, desnutrición, enfermedad respiratoria crónica, displasia broncopulmonar, hospitalización previa por IRAB y enfermedad neurológica crónica (p < 0,001); requirieron más cuidados intensivos, mayor tiempo de internación y mayor tasa de letalidad (p < 0,01). La cardiopatía congénita fue predictor independiente de letalidad por VSR en prematuros [OR 3,67 (1,25-10,8), p = 0,01].Conclusión. VSR mostró un patrón epidémico, afectó a prematuros con ciertas comorbilidades con mayor morbimortalidad que los de término. La letalidad por VSR en prematuros se asoció con la cardiopatía congénita.

Introduction. Respiratory syncytial virus (RSV) is the leading cause of acute lower respiratory tract infection (ALRTI) in pediatrics. Preterm infants are at a higher risk for complications. We aimed to describe and compare the clinical and epidemiological characteristics associated with ALRTI due to RSV in preterm and term infants and to establish the predictors of fatality among preterm infants.Methods. Prospective, cross-sectional study of patients admitted due to ALRTI in the 2000-2018 period. Viral diagnosis was done by indirect immunofluorescence or reverse transcription polymerase chain reaction in nasopharyngeal aspirates. Clinical and epidemiological characteristics were recorded. A multiple logistic regression model established the predictors of fatality among preterm infants.Results. A total of 16 018 ALRTI cases were included; 13 545 (84.6 %) were tested; 6047 (45 %) were positive; RSV was prevalent in 81.1 % (4907), with a seasonal epidemic pattern; 14 % (686) were preterm infants.Comorbidities, perinatal respiratory history, congenital heart disease, malnutrition, chronic respiratory disease, bronchopulmonary dysplasia, prior hospitalization due to ALRTI, and chronic neurological disease (p < 0.001) were more common among preterm infants; they required more intensive care and a longer length of stay, and had a higher fatality rate (p < 0.01). Congenital heart disease was an independent predictor of fatality due to RSV among preterm infants (OR: 3.67 [1.25-10.8], p = 0.01).Conclusion. RSV showed an epidemic pattern and affected more preterm infants with certain comorbidities, with a higher morbidity and mortality, compared to term infants. RSV fatality among preterm infants was associated with congenital heart disease.

Estudio clínico-epidemiológico de las infecciones respiratorias agudas bajas causadas por adenovirus en niños hospitalizados. Diecinueve años de vigilancia epidemiológica activa / Clinical and epidemiological study of acute lower respiratory tract infections caused by adenovirus in hospitalized children. Nineteen years of active epidemiological surveillance

Introducción. La infección respiratoria aguda baja por adenovirus es una importante causa de morbimortalidad en niños. Objetivos: Describir el patrón clínico-epidemiológico y los factores asociados en niños hospitalizados.Métodos. Estudio transversal en niños ingresados por infección respiratoria aguda baja al Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez, Buenos Aires, en 2000-2018. El diagnóstico viral se realizó mediante inmunofluorescencia indirecta en secreciones nasofaríngeas. Se compararon características clínico-epidemiológicas de infección por adenovirus con otros virus respiratorios (virus sincicial respiratorio, influenza y parainfluenza). Se utilizó regresión logística múltiple para identificar predictores independientes de infección.Resultados. De 16018 pacientes con infección respiratoria aguda baja, 13545 fueron testeados para virus respiratorios y 6047 (el 45 %) fueron positivos. Adenovirus fue el agente menos frecuente [el 4,4 % (265) de los casos]; presentó una tendencia en descenso durante todo el período estudiado (pico en 2003) y circuló durante todo el año (pico en julio). El 63,8 % eran varones; mediana de edad: 11 meses (rango intercuartílico: 6-20). La presentación clínica más frecuente fue neumonía (el 63 %). El 50 % tenía internaciones previas por causa respiratoria; el 15,6 % eran reingresos; el 58,3 % tenía comorbilidades. El 19,2 % requirió asistencia ventilatoria; el 44 %registró complicaciones. La letalidad fue del 7,7 %. La infección por adenovirus se asoció a edad ≥ 12 meses, sexo masculino, presentación clínica de neumonía, internaciones previas por causas respiratorias y reinternaciones.Conclusiones. Los adenovirus fueron detectados con menor frecuencia que los otros virus respiratorios, aunque presentaron un importante perfil de morbimortalidad

Introduction. Acute lower respiratory tract infection (ALRTI) caused by adenovirus is a major cause of morbidity and mortality in children.Objectives. To describe the clinical and epidemiological pattern and associated factors in hospitalized children.Methods. Cross-sectional study in children admitted due to ALRTI to Hospital de Niños "Ricardo Gutiérrez," in the Autonomous City of Buenos Aires, between 2000 and 2018. Viral diagnosis was done by indirect immunofluorescence in nasopharyngeal secretions. The clinical and epidemiological characteristics of adenovirus infection were compared to other respiratory viruses (respiratory syncytial virus, influenza, and parainfluenza). A multiple logistic regression was done to identify independent predictors of infection.Results. Out of 16 018 patients with ALRTI, 13 545 were tested for respiratory viruses; 6047 (45 %) had a positive result. Adenovirus was the least common agent (4.4 % [265] of cases); it tended towards a reduction over the study period (peak in 2003) and circulated throughout the year (peak in July). In total, 63.8 % of patients were males; median age: 11 months (interquartile range: 6-20). The most common clinical presentation was pneumonia (63 %). Prior admissions due to respiratory conditions were seen in 50 %; 15.6 %were readmissions; 58.3 % had comorbidities. Ventilatory support was required by 19.2 %and complications were recorded in 44 %. The fatality rate was 7.7 %. Adenovirus infection was associated with age ≥ 12 months, male sex, clinical presentation of pneumonia, prior admissions due to respiratory conditions, and readmissions.Conclusions. Adenoviruses were less common than other respiratory viruses, although their morbidity and mortality were important

VSR: un futuro promisorio en vacunas / RSV: a promising future for vaccines

Las Infecciones Respiratorias Agudas Bajas (IRAB) persisten como una de las mayores causas de morbilidad y mortalidad en los países en vías de desarrollo, siendo el virus sincicial respiratorio (VSR) la principal causa de IRAB en bebés y niños pequeños a nivel mundial. Hasta el momento no existe terapia antiviral disponible ni vacuna eficaz aprobada para su prevención. El único método de profilaxis contra VSR disponible es el Palivizumab, un anticuerpo monoclonal humanizado contra la glicoproteína F que puede ser utilizado para prevenir la enfermedad severa en los grupos de alto riesgo, pero su alto costo y la necesidad de varias administraciones dificulta su uso. Hay aproximadamente un total de 60 estrategias entre vacunas y anticuerpos monoclonales humanizados contra el VSR en desarrollo, de las cuales 16 están en ensayos de Fase 1-3. El objetivo de esta revisión es describir las principales líneas de investigación vigentes

Acute lower respiratory infections (ALRI) are one of the main causes of morbidity and mortality in developing countries, with the respiratory syncytial virus (RSV) being the most important cause of ALRI in infants and young children worldwide. So far there is no available antiviral therapy or effective vaccine approved for its prevention. The only available method of prophylaxis against RSV is Palivizumab, a humanized monoclonal antibody against the F glycoprotein that can be used to prevent the severe disease in high-risk groups, but its high cost and the need for several administrations make its use difficult. Approximately 60 strategies between vaccines and humanized monoclonal antibodies against RSV are being developed, of which 16 are in Phase 1-3 trials. The aim of this review is to describe the main current lines of research in the field

Caracterización de Cepas de Virus Sincitial Respiratorio en el Gran Buenos Aires y Aspectos de su Diseminación / Characterization of Respiratory Syncytial Virus Strains in the Greater Buenos Aires and Spreading Aspects

INTRODUCCIÓN: El virus sincitial respiratorio (VSR) es el agente viral más frecuente de infecciones respiratorias agudas bajas (IRAB) en la primera infancia y el mayor responsable de las hospitalizaciones en el período invernal. OBJETIVOS: Describir las características de los brotes de VSR en la Zona Sanitaria VI de la provincia de Buenos Aires, establecer la diversidad de las cepas circulantes y realizar el análisis bioinformático y filogeográfico de las secuencias de la glicoproteína G. MÉTODOS: Se estudió a pacientes pediátricos internados con presentación compatible con IRAB durante dos picos epidémicos (2014-2015) en cuatro hospitales. Se recopilaron datos clínicos, demográficos y socio-sanitarios, y se detectaron patógenos virales en aspirados nasofaríngeos de estos pacientes por inmunofluorescencia (IF), obteniéndose la secuencia del gen de la proteína G en los VSR positivos. RESULTADOS: De 1296 casos estudiados, 317 fueron positivos para algún agente viral. De ellos, 266 (84%) fueron VSR positivos. Se hallaron asociaciones significativas entre las poblaciones positivas y negativas para VSR. Una tendencia al hacinamiento y vivienda precaria en los casos VSR positivos fue reflejada en los estudios filogeográficos. CONCLUSIONES: Los datos de firma molecular permitieron trazar orígenes y vías de diseminación del VSR. Esto ayuda a señalar zonas y situaciones de vulnerabilidad, estableciendo la población primaria blanco de planes de vacunación u otras medidas profilácticas.

INTRODUCTION: The respiratory syncytial virus (RSV) is the most frequent viral agent associated to acute lower respiratory infections (ALRIs) in early childhood, being the main responsible for hospitalizations during winter. OBJECTIVES: To describe the characteristics of RSV outbreaks in the Health Area VI of Buenos Aires Province, to establish the diversity of circulating strains and to perform a bioinformatic and phylogeographic analysis of glycoprotein G sequences. METHODS: Pediatric inpatients with ALRI-compatible x|presentation during two epidemic peaks (2014-2015) were studied in four hospitals. Clinical, demographic and socio-sanitary data were collected, viral pathogens were detected by immunofluorescence (IF), and the sequence of the G protein gene was obtained in the positive RSVs. RESULTS: From 1296 cases, 317 were positive for some viral agent and 266 (84%) out of these were RSV positive. Significant associations were found among the positive and negative populations for RSV. A trend towards overcrowding and precarious housing in positive RSV cases was reflected in phylogeographic studies. CONCLUSIONS: The molecular signature data allowed tracing origins and routes of RSV dissemination. This helps identify areas and situations of vulnerability, establishing the primary target population for vaccination plans or other prophylactic measures.

Virus respiratorio sincicial: Patrón clínico epidemiológico en niños internados en un hospital pediátrico durante los años 2000-2013 / Respiratory syncytial virus: Clinical and epidemiological pattern in pediatric patients admitted to a children's hospital between 2000 and 2013

Introducción. El virus respiratorio sincicial (VRS) es el principal agente asociado a infección respiratoria aguda baja en niños. El objetivo de este estudio fue describir el patrón clínico-epidemiológico e identificar los factores de riesgo de infección por VRS. Población y métodos. Estudio prospectivo de cohorte de pacientes internados por infección respiratoria aguda baja en el Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez, marzo-noviembre, 20002013. El diagnóstico viral para VRS, adenovirus, influenza y parainfluenza se realizó por inmunofluorescencia indirecta de aspirados nasofaríngeos. Resultados. Se incluyeron 12 555 niños; 38,2% (4798) presentaron rescate viral; el VRS representó el 81,8% (3924/4798) sin variaciones anuales significativas (71,2-88,1), con patrón epidémico estacional (mayo-julio); fue seguido por influenza (7,6%), parainfluenza (5,9%) y adenovirus (4,7%). Los casos con rescate de VRS (3924) tuvieron una mediana de edad de 7 meses (0-214 meses); 74,2% eran menores de 1 año; 43,1%, menores de 6 meses; 56,5%, varones; y la manifestación clínica más frecuente fue bronquiolitis (60,7%). El 41,6% tenía comorbilidades; las más frecuentes, enfermedad respiratoria crónica (74%), cardiopatías congénitas (14%) y enfermedad neurológica crónica (10,2%). El 25% presentó complicaciones. La letalidad fue 1,9% (74/3888). Los predictores independientes de infección por VRS fueron la edad < 3 meses OR 2,8 (2,14-3,67), p < 0,01 , la bronquiolitis como presentación clínica OR 1,54 (1,32-1,79), p < 0,01 y la presencia de hipoxemia al momento del ingreso OR 1,84 (1,42-2,37), p < 0,01 . Conclusiones. La infección por VRS presentó un patrón epidémico estacional y se asoció más a niños pequeños menores de tres meses con bronquiolitis e hipoxemia al momento del ingreso.

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Epidemiología molecular del virus sincicial respiratorio en pacientes pediátricos en un período de seis años / Molecular epidemiology of respiratory syncytial virus in pediatric patients in a six-year period

El virus sincicial respiratorio humano (HRSV) es la principal causa de infección respiratoria aguda baja (IRAB) grave en niños pequeños, no existiendo una vacuna eficaz para prevenirlo. Se analizaron muestras de aspirados nasofaríngeos de pacientes hospitalizados por IRAB en un período de seis años (1999-2004). Por RT-PCR se subtipificaron 353 muestras positivas para HRSV por inmunofluorescencia directa. Entre éstas, 65,7% pertenecieron al subtipo A y 34,3% al subtipo B. Por amplificación, RFLP y secuenciación del gen de la glucoproteína G, principal antígeno neutralizante, se estudiaron las relaciones filogenéticas. Para el subtipo A, se encontraron dos patrones de restricción principales (PA1 y PA2) y dos genotipos, GA2 y GA5, que cocircularon durante el período analizado. El análisis filodinámico determinó alternancia en la circulación de clados genéticos en el tiempo entre Argentina y otros países, mientras que otros cocircularon globalmente. El análisis del subtipo B, permitió describir un evento genético inusual, la duplicación de un segmento de 60 nucleótidos. Filodinámicamente se demostró que estos virus, denominados BA, circularon en Argentina durante todo el período analizado, asociándose con cepas del resto del mundo y mostrando un ancestro en común que probablemente se haya generado en Argentina entre 1997 y 1999. Este trabajo contribuye a un mejor conocimiento evolutivo del virus, dándole un rol fundamental al laboratorio de virología en la vigilancia molecular activa.

Human respiratory syncytial virus (HRSV) is the leading cause of acute lower respiratory tract infections (ALRI) in children. Despite considerable efforts there is as yet no satisfactory vaccine available. In this work, nasopharyngeal aspirates taken from hospitalized children with ALRI were analyzed over six consecutive epidemic seasons (1999-2004). By RT-PCR, 353 positive samples for HRSV by direct immunofluorescence were subtypified. Among them, 65.7% belonged to subtype A and 34.3% to subtype B. Therefore, a phylogenetic analysis was performed using RFLP and sequence analysis of the G-glycoprotein gene, the main neutralizing antigen. The results for A subtype, showed that there were two main restriction patterns (PA1 and PA2) and two genotypes (GA2 and GA5) cocirculating during the period studied. The phylodinamic analysis showed that there were some genetic clades which along this period of time alternated their circulation between Argentina and other countries and that other clades cocirculated worldwide. The subtype B analysis enabled the description of an unusual genetic event such us a 60 nucleotide duplication. The phylodinamic analysis showed that all of these viruses, designated BA, circulated in our country during the period studied and were associated with strains reported wordlwide, showing a common ancestor which had probably been generated in a single genetic event between 1997 and 1999 in Argentina. This work contributes to a better understandig of this virus evolution, giving a fundamental role to the virology laboratory in the active molecular surveillance.