El enfoque Una Salud y la resistencia a los antimicrobianos: Implementación en el Perú / The One Health Approach and Antimicrobial Resistance: Implementation in Peru

RESUMEN La Resistencia a los Antimicrobianos (RAM) es un problema de salud pública de alcance global. De no lograrse contener su propagación, para el año 2050 se convertiría en la primera causa de muerte a nivel mundial, con un serio impacto en la economía mundial. Esta situación ha determinado la aplicación del enfoque «Una Salud¼ para su contención. Este enfoque reconoce que la salud de las personas, los animales, las plantas y el medio ambiente están estrechamente relacionados y son interdependientes. Desde el año 2015, la Organización Mundial de la Salud, en coordinación con otras organizaciones aprobaron el Plan de Acción Mundial para enfrentar la RAM, esto determinó que los estados miembros elaboraran e implementaran sus planes nacionales. El Perú inició el abordaje para la contención de la RAM aplicando el enfoque «Una Salud¼ desde el año 2017. Se registran algunos avances en la implementación de Plan nacional pero también los retos y acciones pendientes de alcanzar.

ABSTRACT Antimicrobial Resistance (AMR) is a public health problem of global scope, whose projections if its spread is not contained indicate that by the year 2050 it would become the leading cause of death worldwide with a serious impact on the world economy. This situation has determined the application of the "One Health" approach for its containment. The approach recognizes that the health of people, animals, plants and the environment are closely related and interdependent. Since 2015, the WHO, in coordination with other organizations, approved the Global Action Plan to face AMR, this determined that the Member States elaborate and implement their national plans. Peru began the approach to contain AMR applying the "One Health" approach since 2017. Some progress has been made in the implementation of the National Plan but also the challenges and actions pending to be achieved.

Clinical application and evaluation of rapid detection of carbapenem resistance genes in blood cultures by Xpert Carba-R / 中华检验医学杂志

This work aims to evaluate a rapid detection method of carbapenem resistance genes in blood cultures based on Xpert Carba-R and preliminarily evaluate its clinical application.Methods:Sixteen strains of Enterobacterales carrying different carbapenem resistance genes were selected to prepare simulated positive blood culture samples and Xpert Carba-R was used to directly detect carbapenem resistance genes in the simulated positive blood culture. From January 2022 to June, a prospective study was conducted on a total of 117 Enterobacteriaceae-positive blood culture samples in the First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University. Xpert Carba-R, detecting five kinds of carbapenem resistance genes in these samples, was evaluated in sensitivity and specificity compared to polymerase chain reaction sequencing. Meanwhile clinical data of positive patients was collected for prognostic analysis. Results:Of the 16 simulated specimens, 14 strains had carbapenem resistance genes detected by Xpert Carba-R, including 8 bla KPC, 5 bla NDM and 1 bla IMP, showing 100% agreement with the known results. As of the 117 clinical specimens, 28 cases were determined to be Enterobacterales harboring carbapenem resistance genes, including 24 bla KPC, 2 bla NDM and 2 bla KPC+ bla NDM. In comparison to the PCR sequencing, the sensitivity and specificity of Xpert Carba-R were both 100% for blood culture samples, and furthermore, the detection time was significantly reduced. Of the 25 positive patients, 9 cases were treated with monotherapy and 5 cases were effective, other 16 cases received combined treatment and 12 cases were effective. A total of 17 cases were effective, 8 cases were ineffective and 3 of them died, the mortality rate was 12% (3/25). Conclusion:Xpert Carba-R can rapidly and accurately detect carbapenem resistance genes in blood culture, which can provide evidence for rational drug therapy in early clinical stage.

Analysis of drug resistance of pathogens of puerperal infection in pregnant women with diabetes and its influence on toll like receptor 4 inflammatory pathway of peripheral blood mononuclear cells / 中国医师杂志

Objective:To explore the drug resistance of pathogens in puerperal infection of pregnant women with diabetes mellitus (GDM), and analyze the influence of puerperal infection on the expression of toll like receptor 4 (TLR4) inflammatory pathway in peripheral blood monocytes.Methods:A retrospective selection was conducted on 120 GDM postpartum women who underwent regular prenatal check ups and delivery at the 903th Hospital of the PLA (People′s Liberation Army) Joint Logistic Support Force from January 2020 to October 2022. The postpartum infection status, pathogenic characteristics of the infected pathogens, and drug resistance of the mothers were analyzed; According to the postpartum infection situation, the parturients were divided into an infected group and an uninfected group. Logistic regression analysis was used to analyze the relevant factors affecting postpartum infection, and the TLR4 protein and mRNA expression levels of peripheral blood mononuclear cells in the two groups were compared.Results:Among 120 GDM pregnant women, 21 cases (17.50%) developed post infection, including 8 cases (38.10%) of incision infection, 6 cases (28.57%) of uterine cavity infection, 4 cases (19.05%) of urinary system infection, and 3 cases (14.28%) of blood infection; A total of 43 pathogenic bacteria were detected, including 26 Gram negative bacteria (60.46%), 14 Gram positive bacteria (32.56%), and 3 fungi (6.98%). Among the main Gram negative bacteria, escherichia coli had the highest resistance rate to ceftazidime and tetracycline, and had not developed resistance to meropenem; Pseudomonas aeruginosa had the highest resistance rate to ceftazidime and gentamicin. Among the main Gram positive bacteria, staphylococcus aureus had the highest resistance rate to penicillin G and ceftazidime, and had not developed resistance to vancomycin; Enterococcus faecalis had the highest resistance rate to clindamycin. The results of multivariate logistic regression analysis showed that postpartum hemorrhage, premature rupture of membranes, and poor control of prenatal blood sugar were independent risk factors for postpartum infection in GDM mothers (all P<0.05). The expression rate of TLR4 protein, relative expression level of TLR4 mRNA, and levels of tumor necrosis factor-α (TNF-α), interleukin (IL)-1, and IL-10 in the infected group were significantly higher than those in the non infected group (all P<0.05). Conclusions:The distribution and drug resistance of pathogenic bacteria in postpartum infections of GDM mothers have certain characteristics. Postpartum hemorrhage, premature rupture of membranes, and poor control of prenatal blood sugar are independent risk factors affecting postpartum infections in GDM mothers; The TLR4 inflammatory pathway in peripheral blood mononuclear cells may be involved in the occurrence and development of postpartum infection in GDM mothers.

Identification and antimicrobial susceptibility profile of bacteria isolated from primary endodontic infections

Abstract This study aimed to identify and characterize the antimicrobial susceptibility profile of bacteria found in primary endodontic infections in the teeth of patients treated at the Dental Clinic of the University of Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil. From September to December 2019, samples were obtained from 21 patients with primary endodontic infections. The collections were carried out in triplicate using paper cones placed close to the total length of the root canal. Bacterial isolation was performed in Brain Heart Infusion agar, Blood agar, and other selective culture media cultured at 37°C for up to 48 h under aerobiosis and microaerophilic conditions. The bacterial species were identified using the Vitek 2 automated system. The disk diffusion method on agar Müeller-Hinton was used to assess antimicrobial susceptibility with the recommended antimicrobials for each identified bacterial species. A total of 49 antibiotics were evaluated. Fifteen of the 21 samples collected showed bacterial growth, and 17 bacterial isolates were found. There were 10 different bacterial species identified: Enterococcus faecalis (four isolates), Streptococcus mitis/oralis (three isolates), Streptococcus anginosus (three isolates) being the most common, followed by Staphylococcus epidermidis, Enterococcus faecium, Streptococcus constellatus, Streptococcus alactolyticus, Enterobacter cloacae, Klebsiella variicola, and Providencia rettgeri (one isolate of each species). The analysis demonstrated significant susceptibility to most of the tested antibiotics. However, some Enterococcus isolates resisted the antibiotic's erythromycin, ciprofloxacin, and tetracycline. A Staphylococcus epidermidis isolate was characterized as multidrug-resistant. Five Streptococcus isolates were non-susceptible to all antibiotics tested.

Actualización sobre la resistencia antimicrobiana en instituciones de salud de nivel III y IV en Colombia entre enero del 2018 y diciembre del 2021 / Update of antimicrobial resistance in level III and IV health institutions in Colombia between January 2018 and December 2021

Introducción. El comportamiento de la resistencia antimicrobiana es fundamental en el mejoramiento y ajuste de los programas de optimización de uso de antimicrobianos, la implementación de las guías terapéuticas y las precauciones que limitan la transmisión cruzada de bacterias resistentes entre pacientes. Desde el inicio del 2020, la pandemia del SARS-CoV-2 desafió profundamente al sistema de salud y, según algunos reportes, aumentó las tasas de resistencia antimicrobiana. Objetivo. Describir el comportamiento de la resistencia antimicrobiana en los microrganismos más frecuentes en veinte hospitales colombianos durante el periodo 2018-2021. Materiales y métodos. Se trata de un estudio descriptivo basado en la información microbiológica reportada por veinte instituciones de salud de nivel III y IV, entre enero de 2018 y diciembre de 2021, en doce ciudades de Colombia, las cuales hacen parte del "Grupo para el estudio de la resistencia nosocomial en Colombia", liderado por la Universidad El Bosque. La identificación de género y especie de los microorganismos más frecuentes, junto con su perfil de resistencia frente a antibióticos marcadores, se determinaron mediante el análisis de los datos vía WHONET. Resultados. En general, los 10 microorganismos más frecuentes analizados a lo largo de los 4 años no presentaron cambios estadísticamente significativos en sus perfiles de resistencia durante los cuatro años del periodo evaluado, de 2018 a 2021. En contraste, Pseudomonas aeruginosa aumentó su resistencia frente a piperacilinatazobactam y carbapenémicos, lo cual fue estadísticamente significativo. Conclusiones. Los cambios en la resistencia antimicrobiana en estos años no han sido estadísticamente significativos, excepto para P. aeruginosa, bacteria que mostró un incremento en las tasas de resistencia a piperacilina-tazobactam y carbapenémicos.

Introduction. Antimicrobial resistance surveillance is a fundamental tool for the development, improvement, and adjustment of antimicrobial stewardship programs, therapeutic guidelines, and universal precautions to limit the cross-transmission of resistant bacteria between patients. Since the beginning of 2020, the SARS-CoV-2 pandemic profoundly challenged the health system and, according to some reports, increased the rates of antimicrobial resistance. Objective. To describe the behavior of antimicrobial resistance of the most frequent bacterial pathogens in twenty Colombian hospitals from January 2018 to December 2021. Materials and methods. We conducted a descriptive study based on the microbiological information recorded from January 2018 to December 2021 in twenty levels III and IV health institutions in twelve Colombian cities. We identified the species of the ten most frequent bacteria along with their resistance profile to the antibiotic markers after analyzing the data through WHONET. Results. We found no statistically significant changes in most pathogens' resistance profiles from January 2018 to December 2021. Only Pseudomonas aeruginosa had a statistically significant increase in its resistance profile, particularly to piperacillin/ tazobactam and carbapenems. Conclusions. The changes in antimicrobial resistance in these four years were not statistically significant except for P. aeruginosa to piperacillin/tazobactam and carbapenems.

Tratamiento antibiótico de elección en sepsis urinaria asociada a litiasis ureteral en Chile. Estudio multicéntrico / Antibiotic treatment of choice for urinary sepsis associated with ureteral lithiasis in Chile. Multicenter study

INTRODUCCIÓN: El uso de un esquema antibiótico inadecuado en sepsis aumenta significativamente la morbimortalidad. Este estudio presenta un reporte multicéntrico de susceptibilidad antibiótica en urosepsis asociada a ureterolitiasis, buscando proponer un esquema empírico óptimo para el medio nacional. MÉTODOS: Se realizó un estudio observacional prospectivo en 7 hospitales de 4 regiones del país. Se incluyeron pacientes con criterios de sepsis asociada a ureterolitiasis confirmada radiológicamente. Se registraron sus datos demográficos, signos vitales y laboratorio de ingreso, así como sus estudios microbiológicos y radiológicos, realizándose estadísticas descriptivas de los datos obtenidos. RESULTADOS: Se ingresaron 119 pacientes, de los cuales 52 cumplieron criterios de inclusión. 77% eran mujeres, con una edad promedio de 52 años. Se tomaron hemocultivos en el 48,7% de los casos y urocultivos en el 100%. El microorganismo más común fue Escherichia coli (73%), seguido por Proteus mirabilis (9,6%) y Klebsiella pneumoniae (3,9%). Hubo dos casos de bacterias gram positivas. El 100% de las bacterias gram negativas fueron sensibles a amikacina. CONCLUSIÓN: Los microorganismos encontrados en nuestra cohorte fueron similares a los de los estudios internacionales. Dado que el mayor nivel de susceptibilidad fue para amikacina, proponemos su uso como terapia empírica para la urosepsis asociada a ureterolitiasis en Chile. Siempre es necesario considerar los posibles efectos ne-frotóxicos de la amikacina. Se debe considerar una asociación de betalactámicos y glicopéptidos en pacientes con factores de riesgo de infecciones enterocócicas.

BACKGROUND: Inadequate antibiotic coverage in septic patients is associated with higher morbidity and mortality. This multicentric study reports antibiotic susceptibility in patients with ureterolithiasis-associated urosepsis, aiming to propose an optimal empirical therapy for this disease in the Chilean population. METHODS: The prospective cohort study included patients from 7 Chilean hospitals who presented with ureterolithiasis and met sepsis criteria. We analyzed demographic data, vital signs at admission, and microbiological and radiological exams. We used descriptive statistics for the analysis of collected data. Results: Initially, the study included 119 patients; 52 met the inclusion criteria. 77% were female, with a mean age of 52. 100% of the cohort had a urine culture taken at admission, whereas 48,7% had blood cultures. Escherichia Coli was the most common microorganism (73%), followed by Proteus Mirabilis (9.6%) and Klebsiella Pneumoniae (3.9%). Only two patients presented gram-positive pathogens. 100% of gram-negative bacteria were sensible to amikacin. CONCLUSION: The microorganisms found in our cohort were similar to those in international reports. Since the highest level of susceptibility was for amikacin, we propose its use as empirical therapy for urosepsis associated with ureterolithiasis in Chile. It is always necessary to consider the potential nephrotoxic effects of amikacin. An association of beta-lactams and glycopeptides should be considered in patients with risk factors for enterococcal infections.

Resistencia antimicrobiana, una pandemia silenciosa / Antimicrobial resistance, a silent pandemic / Resistência antimicrobiana, uma pandemia silenciosa

Introducción: la resistencia a los antimicrobianos ha sido una problemática creciente a nivel global, la problemática afecta no solo la salud de personas, animales y el ambiente en general, sino que ha generado impactos de índole productivo y comercial. Una de las estrategias para abordar esta problemática es el enfoque de una salud. Este enfoque destaca la participación multidisciplinaria para combatir la resistencia antimicrobiana; y es así que cada profesión o actividad laboral genera unas responsabilidades innatas para la profesión veterinaria. Los veterinarios tienen un rol fundamental para este propósito, ya que son ellos quienes integran la aplicabilidad de estrategias de promoción y prevención a nivel agropecuario, y de consolidación e interlocución entre los diferentes componentes del enfoque (animal, humano, ambiente) desde el ámbito de la salud pública veterinaria. Materiales y Método: se realizó una búsqueda de la literatura en diferentes bases de datos, con el objetivo de realizar una revisión actualizada sobre la resistencia antimicrobiana. Resultados: dentro de las principales estrategias se debería fomentar un uso adecuado y bajo prescripción de antimicrobianos en la producción animal. Promover buenas prácticas de higiene, bioseguridad y vacunación, facilitando un correcto diagnóstico de enfermedades infecciosas en animales. Discusión: la adopción de normas internacionales para el uso responsable de los antibióticos y las directrices establecidas por la Organización Mundial de la Salud y Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura, a través del Codex Alimentarius y la Organización Mundial de Sanidad Animal, son fundamentales para hacer frente al desafío que representa el problema de la resistencia a los antimicrobianos.

Introduction: Antimicrobial resistance has been a growing problem at a global level, affecting not only the health of people, animals and the environment in general, but it has also generated impacts of a productive and commercial nature. One of the strategies to address this problem is the one-health approach. This approach emphasizes multidisciplinary participation to combat antimicrobial resistance; and thus, each profession or work activity generates innate responsibilities for the veterinary profession. Veterinarians have a fundamental role for this purpose, since they are the ones who integrate the applicability of promotion and prevention strategies at the agricultural level, and of consolidation and interlocution between the different components of the approach (animal, human, environment) from the field of veterinary public health. Materials and Method: a literature search was carried out in different databases, with the aim of carrying out an updated review on antimicrobial resistance. Results: one of the main strategies should be to promote an adequate use and under prescription of antimicrobials in animal production. Promote good hygiene, biosecurity and vaccination practices, facilitating a correct diagnosis of infectious diseases in animals. Discussion: the adoption of international standards for the responsible use of antibiotics and the guidelines established by the World Health Organization and the Food and Agriculture Organization of the United Nations, through Codex Alimentarius and the World Organization for Animal Health, are fundamental to face the challenge posed by the problem of antimicrobial resistance.

Introdução: A resistência antimicrobiana tem sido um problema crescente em todo o mundo, afetando não apenas a saúde dos seres humanos, dos animais e do meio ambiente em geral, mas também causando impactos na produção e no comércio. Uma das estratégias para lidar com esse problema é a abordagem One Health. Essa abordagem enfatiza o envolvimento multidisciplinar no combate à resistência antimicrobiana, com cada profissão ou atividade de trabalho gerando responsabilidades inatas à profissão veterinária. Os veterinários têm um papel fundamental nesse sentido, pois são eles que integram a aplicabilidade das estratégias de promoção e prevenção em nível agropecuário e de consolidação e interlocução entre os diferentes componentes da abordagem (animal, humano, ambiental) do campo da saúde pública veterinária. Materiais e Métodos: foi realizada uma pesquisa bibliográfica em diferentes bases de dados, com o objetivo de realizar uma revisão atualizada sobre a resistência antimicrobiana. Resultados: uma das principais estratégias deve ser a promoção do uso adequado e com baixa prescrição de antimicrobianos na produção animal. Promover boas práticas de higiene, biossegurança e vacinação, facilitando o diagnóstico correto de doenças infecciosas em animais. Discussão: A adoção de padrões internacionais para o uso responsável de antibióticos e as diretrizes estabelecidas pela Organização Mundial da Saúde e pela Organização das Nações Unidas para Agricultura e Alimentação, por meio do Codex Alimentarius e da Organização Mundial de Saúde Animal, são essenciais para enfrentar o desafio representado pelo problema da resistência antimicrobiana.

Study on awareness, knowledge, and practices towards antibiotic use among the educated and uneducated people of Khyber Pakhtunkhwa Province, Pakistan

INTRODUCTION: Antimicrobial resistance developed through the inadequate use of antibiotics; is an overriding task for global public health. OBJECTIVE: To explore awareness, knowledge, and practices, and compare the elements associated with antibiotic misuse in different University students and uneducated people of Khyber Pakhtunkhwa Province, Pakistan. METHODS: Cross-sectional study was conducted from July to December 2020 using a validated questionnaire. Data were collected from eleven different university students and uneducated people of Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan. RESULTS: 3,600 questionnaires were completed, consisting of 56.9% Male and 43.0% Female. 1,999 (55.5%) of the antibiotic users reported through the survey used non-prescription antibiotics within a one-month study period. Out of the participants, 230 (6.3%) were uneducated or their education level was below matric rest were university students. 1999 (55.5%) reported buying Antibiotics with Medical Prescription. Most self-medicated participants (56.9%) stop taking antibiotics when they feel better. More than 90% of the respondents answered that doctors and pharmacist staff do not guide them well that how to use antibiotics. 2,171 (60.03%) respondents mistakenly believed that antibiotics improve restoration from coughs and colds. Only 720 (20%) respondents knew that antibiotics also disturb normal flora and 547 participants (15.9%) agree that unnecessary use of antibiotics causes bacterial resistance. CONCLUSION: Finding from this study may have important implications for public health policy in Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan given the growing global resistance to antibiotics and the reported health issues related to their improper use.

Clinical analysis of 71 patients with Pseudomonas aeruginosa bloodstream infection / 中国基层医药

Objective:To investigate the clinical manifestations and related risk factors of patients with Pseudomonas aeruginosa (PAE) bloodstream infection, and to provide references for clinical diagnosis and treatment of PAE bloodstream infection after combining with bacterial resistance condition. Methods:The clinical data and biological data of all patients with PAE bloodstream infection who received treatment in the Third Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University from January 2019 to December 2020 were analyzed retrospectively. The independent influential factors of PAE bloodstream infection were analyzed using binary logistic regression. Results:Eighty-three patients had PAE bloodstream infection. Among them, 71 patients were included in the final analysis. Among the 71 patients, 36 patients (50.70%) had carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa ( CRPA). Univariate analysis showed that the history of hospitalization within 90 days ( χ2 = 3.90, P = 0.048), indwelling catheterization ( χ2 = 5.08, P = 0.024), septic shock ( χ2 = 4.00, P = 0.046), mechanical ventilation ( χ2= 12.35, P < 0.001), deep venous catheter ( χ2 = 4.08, P = 0.043), acute physiology and chronic health evaluation score II ≥ 10 points ( χ2 = 4.06, P = 0.044), and multi-drug resistance ( χ2 = 11.75, P = 0.001) were the suspicious influential factors of CRPA bloodstream infection. Multivariate logistic regression analysis showed that mechanical ventilation was an independent risk factor for CRPA bloodstream infection ( OR = 7.43, 95% CI 1.182-46.674, P = 0.032). Multi-drug resistance was an independent risk factor for CRPA bloodstream infection ( OR = 5.842, 95% CI 1.520-22.450, P = 0.010). Conclusion:Mechanical ventilation and multi-drug resistance are the independent influential factors of CRPA bloodstream infection. Invasive operations such as mechanical ventilation should be avoided in the clinic.

Prevalence and antimicrobial resistance of Escherichia coli and Salmonella spp. in animal feed in Colombia / Prevalencia y resistencia a los antimicrobianos de Escherichia coli y Salmonella spp. en los alimentos para animales en Colombia / Prevalência e resistência a antimicrobianos de Escherichia coli e Salmonella spp. em ração animal na Colômbia

ABSTRACT Objective. To determine the prevalence and antimicrobial resistance of Escherichia coli and Salmonella spp. in animal feed samples collected between 2018 and 2021 in Colombia. Methods. This was a laboratory-based cross-sectional study using routine data from the program for inspection, surveillance, and control of animal feed at the Colombian Agriculture Institute. Samples of animal feed for swine, poultry, canine, feline, leporine, piscine, and equine species were processed for detection of E. coli and Salmonella spp. using enrichment and selective culture methods. Isolates were tested for antimicrobial susceptibility using an automated microdilution method. Results. Of 1 748 animal feed samples analyzed, 83 (4.7%) were positive for E. coli and 66 (3.8%) for Salmonella spp. The presence of E. coli and Salmonella spp. was highest in feed for poultry (6.4% and 5.5%) and swine (6.1% and 4.3%). Antimicrobial resistance testing was performed in 27 (33%) E. coli isolates and 26 (39%) Salmonella isolates. Among E. coli, resistance was most frequently observed to ampicillin (44.5%) followed by cefazolin (33.3%), ciprofloxacin (29.6%), ampicillin/sulbactam (26%), and ceftriaxone (11.1%). The highest resistance levels in Salmonella spp. isolates were against cefazolin (7.7%) and piperacillin/tazobactam (7.7%). Conclusions. This is the first study from Colombia reporting on the prevalence and antimicrobial resistance of E. coli and Salmonella spp. in animal feed samples. Its results establish a baseline over a wide geographical distribution in Colombia. It highlights the need to integrate antimicrobial resistance surveillance in animal feed due to the emergence of resistant bacteria in this important stage of the supply chain.

RESUMEN Objetivo. Determinar la prevalencia y resistencia a los antimicrobianos de Escherichia coli y Salmonella spp. en muestras de piensos para animales tomadas entre el 2018 y el 2021 en Colombia. Métodos. Se trata de un estudio transversal realizado en el laboratorio a partir de los datos regulares del programa de inspección, vigilancia y control de alimentos para animales del Instituto Colombiano Agropecuario. Se procesaron muestras de alimentos utilizados en la cría de cerdos, aves de corral, cánidos, félidos, lepóridos, peces y equinos con el fin de detectar E. coli y Salmonella spp. por medio de métodos de enriquecimiento y cultivo selectivo. Se analizó la sensibilidad a los antimicrobianos de las cepas aisladas mediante microdilución automatizada. Resultados. De 1748 muestras de alimentos analizadas, 83 (4,7%) resultaron positivas para E. coli y 66 (3,8%) para Salmonella spp. La presencia de E. coli y Salmonella spp. fue mayor en los alimentos para aves de corral (6,4% y 5,5%) y cerdos (6,1% y 4,3%). Se realizaron pruebas de resistencia a los antimicrobianos en 27 (33%) cepas de E. coli y 26 (39%) de Salmonella. En las cepas de E. coli, se observó una mayor resistencia a la ampicilina (44,5%), seguida de la resistencia a la cefazolina (33,3%), la ciprofloxacina (29,6%), la ampicilina/sulbactam (26%) y la ceftriaxona (11,1%). En el caso de las cepas de Salmonella spp., los niveles de resistencia más elevados fueron para la cefazolina (7,7%) y piperacilina/tazobactam (7,7%). Conclusiones. Este es el primer estudio realizado en Colombia en el que se informa sobre la prevalencia y la resistencia a los antimicrobianos de E. coli y Salmonella spp. en muestras de alimentos para animales. Sus resultados establecen una línea de base para una zona geográfica mucho mayor dentro de Colombia. Se subraya la necesidad de integrar la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en los alimentos para animales debido a la aparición de bacterias resistentes en esta importante etapa de la cadena de suministro.

RESUMO Objetivo. Determinar a prevalência e a resistência a antimicrobianos de Escherichia coli e Salmonela spp. em amostras de ração animal coletadas entre 2018 e 2021 na Colômbia. Métodos. Estudo transversal de base laboratorial, usando dados de rotina do programa de inspeção, vigilância e controle de ração animal do Instituto Colombiano de Agricultura. Amostras de ração animal para as espécies suína, avícola, canina, felina, leporina, piscina e equina foram processadas para detecção de E. coli e Salmonella spp., usando métodos de enriquecimento e cultura seletiva. Os isolados foram testados quanto à suscetibilidade a antimicrobianos usando um método automatizado de microdiluição. Resultados. Das 1.748 amostras de ração animal analisadas, 83 (4,7%) foram positivas para E. coli e 66 (3,8%) para Salmonella spp. A presença de E. coli e Salmonella spp. foi maior em rações para aves (6,4% e 5,5%) e suínos (6,1% e 4,3%). O teste de resistência a antimicrobianos foi realizado em 27 (33%) isolados de E. coli e 26 (39%) isolados de Salmonella. Em E. coli, a resistência observada com maior frequência foi à ampicilina (44,5%), seguida da cefazolina (33,3%), ciprofloxacino (29,6%), ampicilina/sulbactam (26%) e ceftriaxona (11,1%). Os maiores níveis de resistência em isolados de Salmonella spp. foram contra cefazolina (7,7%) e piperacilina/tazobactam (7,7%). Conclusões. Este é o primeiro estudo da Colômbia a notificar a prevalência e resistência a antimicrobianos de E. coli e Salmonella spp. em amostras de ração animal. Os resultados estabelecem uma linha de base com ampla distribuição geográfica na Colômbia. Destaca-se a necessidade de integrar a vigilância da resistência a antimicrobianos na ração animal, devido ao surgimento de bactérias resistentes nesta importante etapa da cadeia de abastecimento.

Antibiotic resistance and consumption before and during the COVID-19 pandemic in Valle del Cauca, Colombia / Resistencia antibiótica y consumo de antibióticos antes y durante la pandemia de COVID-19 en el Valle del Cauca, Colombia / Resistência a antibióticos e consumo de antibióticos antes e durante a pandemia de COVID-19 no Valle del Cauca, Colômbia

ABSTRACT Objective. To assess changes in antibiotic resistance of eight of the World Health Organization priority bug-drug combinations and consumption of six antibiotics (ceftriaxone, cefepime, piperacillin/tazobactam, meropenem, ciprofloxacin, vancomycin) before (March 2018 to July 2019) and during (March 2020 to July 2021) the COVID-19 pandemic in 31 hospitals in Valle del Cauca, Colombia. Methods. This was a before/after study using routinely collected data. For antibiotic consumption, daily defined doses (DDD) per 100 bed-days were compared. Results. There were 23 405 priority bacterial isolates with data on antibiotic resistance. The total number of isolates increased from 9 774 to 13 631 in the periods before and during the pandemic, respectively. While resistance significantly decreased for four selected bug-drug combinations (Klebsiella pneumoniae, extended spectrum beta lactamase [ESBL]-producing, 32% to 24%; K. pneumoniae, carbapenem-resistant, 4% to 2%; Pseudomonas aeruginosa, carbapenem-resistant, 12% to 8%; Acinetobacter baumannii, carbapenem-resistant, 23% to 9%), the level of resistance for Enterococcus faecium to vancomycin significantly increased (42% to 57%). There was no change in resistance for the remaining three combinations (Staphylococcus aureus, methicillin-resistant; Escherichia coli, ESBL-producing; E. coli, carbapenem-resistant). Consumption of all antibiotics increased. However, meropenem consumption decreased in intensive care unit settings (8.2 to 7.1 DDD per 100 bed-days). Conclusions. While the consumption of antibiotics increased, a decrease in antibiotic resistance of four bug-drug combinations was observed during the pandemic. This was possibly due to an increase in community-acquired infections. Increasing resistance of E. faecium to vancomycin must be monitored. The findings of this study are essential to inform stewardship programs in hospital settings of Colombia and similar contexts elsewhere.

RESUMEN Objetivo. Evaluar los cambios en la resistencia a los antibióticos de ocho de las combinaciones de fármacos y agentes patógenos incluidos en la lista prioritaria de la Organización Mundial de la Salud y el consumo de seis antibióticos (ceftriaxona, cefepima, piperacilina/tazobactam, meropenem, ciprofloxacina, vancomicina) antes de la pandemia de COVID-19 (de marzo del 2018 a julio del 2019) y durante la pandemia (de marzo del 2020 a julio del 2021) en 31 hospitales del Valle del Cauca (Colombia). Métodos. En este estudio se analiza el antes y el después empleando datos recopilados de forma rutinaria. Para el consumo de antibióticos, se compararon las dosis diarias definidas (DDD) por 100 días-cama. Resultados. Hubo 23 405 cepas bacterianas aisladas prioritarias con datos sobre la resistencia a los antibióticos. El número total de cepas aisladas aumentó de 9 774 antes de la pandemia a 13 631 durante la pandemia. Si bien la resistencia disminuyó significativamente en las cuatro combinaciones seleccionadas de agentes patógenos y fármacos (Klebsiella pneumoniae, productora de betalactamasa de espectro extendido [BLEE], de 32% a 24%; K. pneumoniae, resistente a los carbapenémicos, de 4% a 2%; Pseudomonas aeruginosa, resistente a los carbapenémicos, de 12% a 8%; Acinetobacter baumannii, resistente a los carbapenémicos, de 23% a 9%), el nivel de resistencia de Enterococcus faecium a la vancomicina aumentó significativamente (de 42% a 57%). No hubo cambios en la resistencia en las tres combinaciones restantes (Staphylococcus aureus, resistente a la meticilina; Escherichia coli, productora de BLEE; E. coli, resistente a los carbapenémicos). El consumo de todos los antibióticos aumentó. Sin embargo, el consumo de meropenem disminuyó en los entornos de las unidades de cuidados intensivos (de 8,2 a 7,1 DDD por 100 días-cama). Conclusiones. Aunque el consumo de antibióticos aumentó, se observó una disminución en la resistencia a los antibióticos de cuatro combinaciones de agentes patógenos y medicamentos durante la pandemia, que posiblemente se debió a un aumento en las infecciones adquiridas en la comunidad. Es necesario vigilar el aumento de la resistencia de E. faecium a la vancomicina. Los resultados de este estudio son esenciales para que sirvan de orientación en los programas de optimización del uso de los antibióticos en los entornos hospitalarios de Colombia y en contextos similares en otros lugares.

RESUMO Objetivo. Avaliar as mudanças na resistência a antibióticos em oito das combinações microrganismo/antimicrobiano prioritárias da Organização Mundial da Saúde e o consumo de seis antibióticos (ceftriaxona, cefepima, piperacilina/tazobactam, meropeném, ciprofloxacino, vancomicina) antes (março de 2018 a julho de 2019) e durante (março de 2020 a julho de 2021) a pandemia de COVID-19 em 31 hospitais em Valle del Cauca, Colômbia. Métodos. Este foi um estudo antes/depois utilizando dados coletados rotineiramente. Para avaliar o consumo de antibióticos, foram comparadas doses diárias definidas (DDD) por 100 leitos-dias. Resultados. Havia dados sobre resistência a antibióticos para 23.405 isolados bacterianos prioritários. O número total de isolados aumentou de 9.774 para 13.631 antes e durante a pandemia, respectivamente. Embora a resistência tenha diminuído significativamente para quatro das combinações microrganismo/antimicrobiano selecionadas (Klebsiella pneumoniae, produtora de betalactamase de espectro estendido [ESBL], 32% a 24%; K. pneumoniae, resistente a carbapenêmicos, 4% a 2%; Pseudomonas aeruginosa, resistente a carbapenêmicos, 12% a 8%; Acinetobacter baumannii, resistente a carbapenêmicos, 23% a 9%), o nível de resistência de Enterococcus faecium a vancomicina aumentou significativamente (42% a 57%). Não houve mudança na resistência para as três combinações restantes (Staphylococcus aureus, resistente a meticilina; Escherichia coli, produtora de ESBL; E. coli, resistente a carbapenêmicos). O consumo de todos os antibióticos aumentou. Entretanto, o consumo de meropeném nas unidades de terapia intensiva diminuiu (de 8,2 para 7,1 DDD por 100 leitos-dias). Conclusões. Embora o consumo de antibióticos tenha aumentado, observou-se uma diminuição na resistência a antibióticos de quatro combinações microrganismo/antimicrobiano durante a pandemia. Isso ocorreu possivelmente devido a um aumento nas infecções adquiridas na comunidade. O aumento da resistência de E. faecium à vancomicina deve ser monitorado. Os achados deste estudo são essenciais para guiar os programas de gerenciamento de antimicrobianos em ambientes hospitalares da Colômbia e em outros contextos similares.

Whole-genome sequencing for surveillance of antimicrobial resistance in Ecuador: present and future implications / Secuenciación del genoma completo para la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en Ecuador: implicaciones actuales y futuras / Sequenciamento do genoma completo para vigilância da resistência aos antimicrobianos no Equador: implicações presentes e futuras

ABSTRACT Whole-genome sequencing is becoming the gold standard for pathogen characterization and offers considerable advantages for understanding the evolution and dissemination of new determinants of antimicrobial resistance. Despite the benefits of whole-genome sequencing for pathogen characterization, implementation costs and lack of expertise may limit its use by public health laboratories. This article reviews the advantages of whole-genome sequencing for pathogen characterization and the current status of the use of whole-genome sequencing for antimicrobial resistance surveillance in Ecuador. A roadmap is suggested for including whole-genome sequencing for pathogen characterization based on the needs of the health reference institutions through alliances with Ecuadorian universities. Establishing a partnership between public health institutions and academia would be valuable for clinicians, policy-makers, and epidemiologists who could then take reasonable measures in those areas and establish a basis for adapting One Health strategies to tackle antimicrobial resistance in Ecuador.

RESUMEN La secuenciación del genoma completo, que está pasando a ser el estándar de referencia para la caracterización de agentes patógenos, ofrece ventajas considerables para comprender la evolución y la diseminación de los nuevos determinantes de la resistencia a los antimicrobianos. Sin embargo, a pesar de los beneficios que genera, los costos de ejecución y la falta de experiencia pueden limitar su uso por parte de los laboratorios de salud pública. En este artículo se evalúan las ventajas de la secuenciación del genoma completo para la caracterización de agentes patógenos y el estado actual del uso de la secuenciación del genoma completo en la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en Ecuador. Se propone una hoja de ruta para incluir la secuenciación del genoma completo para la caracterización de agentes patógenos según las necesidades de las instituciones de salud de referencia, lo que se haría por medio de alianzas con universidades ecuatorianas. Establecer una asociación entre las instituciones de salud pública y los círculos académicos sería sumamente valioso para los médicos, los responsables de las políticas y los epidemiólogos, que podrían adoptar medidas razonables en sus ámbitos y sentar una base para adaptar las estrategias de "Una salud" a fin de abordar la resistencia a los antimicrobianos en Ecuador.

RESUMO O sequenciamento do genoma completo está se tornando o padrão ouro para a caracterização de patógenos e oferece vantagens consideráveis para a compreensão da evolução e disseminação de novos determinantes de resistência aos antimicrobianos. Apesar dos benefícios do sequenciamento do genoma completo para a caracterização de patógenos, os custos de implementação e a falta de especialização podem limitar seu uso pelos laboratórios de saúde pública. Este artigo analisa as vantagens do sequenciamento do genoma completo para a caracterização de patógenos e a situação atual do uso desta técnica para a vigilância da resistência aos antimicrobianos no Equador. Sugere-se um roteiro para incluir o sequenciamento de genomas completos para caracterização de patógenos com base nas necessidades das instituições de saúde de referência, por meio de alianças com universidades equatorianas. A criação de uma parceria entre instituições de saúde pública e entidades acadêmicas seria valiosa para clínicos, formuladores de políticas e epidemiologistas, que poderiam, assim, tomar medidas razoáveis nessas áreas e estabelecer uma base para adaptar estratégias de Saúde Única para combater a resistência aos antimicrobianos no Equador.

Bloodstream infections and antibiotic resistance at a regional hospital, Colombia, 2019-2021 / Infecciones del torrente sanguíneo y resistencia a los antibióticos en un hospital regional en Colombia, 2019-2021 / Infecções de corrente sanguínea e resistência a antibióticos em um hospital regional, Colômbia, 2019-2021

ABSTRACT Objectives. To assess antibiotic susceptibility of World Health Organization (WHO) priority bacteria (Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella spp., Staphylococcus aureus, and Streptococcus pneumoniae) in blood cultures at the Orinoquía regional hospital in Colombia. Methods. This was cross-sectional study using routine laboratory data for the period 2019-2021. Data on blood samples from patients suspected of a bloodstream infection were examined. We determined: the total number of blood cultures done and the proportion with culture yield; the characteristics of patients with priority bacteria; and the type of bacteria isolated and antibiotic resistance patterns. Results. Of 25 469 blood cultures done, 1628 (6%) yielded bacteria; 774 (48%) of these bacteria were WHO priority pathogens. Most of the priority bacteria isolated (558; 72%) were gram-negative and 216 (28%) were gram-positive organisms. Most patients with priority bacteria (666; 86%) were hospitalized in wards other than the intensive care unit, 427 (55%) were male, and 321 (42%) were ≥ 60 years of age. Of the 216 gram-positive bacteria isolated, 205 (95%) were Staphylococcus aureus. Of the 558 gram-negative priority bacteria isolated, the three most common were Escherichia coli (34%), Klebsiella pneumoniae (28%), and Acinetobacter baumannii (20%). The highest resistance of Staphylococcus aureus was to oxacillin (41%). For gram-negative bacteria, resistance to antibiotics ranged from 4% (amikacin) to 72% (ampicillin). Conclusions. Bacterial yield from blood cultures was low and could be improved. WHO priority bacteria were found in all hospital wards. This calls for rigorous infection prevention and control standards and continued surveillance of antibiotic resistance.

RESUMEN Objetivos. Evaluar la sensibilidad a los antibióticos de las bacterias incluidas en la lista prioritaria de la Organización Mundial de la Salud (OMS) (Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella spp., Staphylococcus aureus y Streptococcus pneumoniae) en hemocultivos en el Hospital Regional de la Orinoquía en Colombia. Métodos. Se trata de un estudio transversal que empleó datos rutinarios de laboratorio del período comprendido entre los años 2019 y 2021. Se examinaron datos de muestras de sangre de pacientes con presunción clínica de infección del torrente sanguíneo. Se determinó el número total de hemocultivos realizados y la proporción cultivos con resultados, las características de los pacientes con bacterias prioritarias, así como el tipo de bacterias aisladas y los patrones de resistencia a los antibióticos. Resultados. De 25 469 hemocultivos realizados, se aislaron bacterias en 1628 (6%); 774 (48%) con agentes patógenos prioritarios de la OMS. La mayoría de las cepas bacterianas prioritarias aisladas (558; 72%) eran gramnegativas y 216 (28%), organismos grampositivos. La mayoría de los pacientes con bacterias prioritarias (666; 86%) fueron hospitalizados en salas distintas de la unidad de cuidados intensivos, 427 (55%) eran varones y 321 (42%) tenían 60 años o más. De las 216 bacterias grampositivas aisladas, 205 (95%) eran Staphylococcus aureus. De las 558 bacterias prioritarias gramnegativas aisladas, las tres más comunes fueron Escherichia coli (34%), Klebsiella pneumoniae (28%) y Acinetobacter baumannii (20%). La mayor resistencia de Staphylococcus aureus fue a la oxacilina (41%). Entre las bacterias gramnegativas, la resistencia a los antibióticos varió del 4% (amikacina) al 72% (ampicilina). Conclusiones. El aislamiento de bacterias en los hemocultivos fue bajo y podría mejorarse. Se encontraron bacterias de la lista prioritaria de la OMS en todas las salas del hospital, por lo que es necesario aplicar rigurosas normas de prevención y control de infecciones y realizar una vigilancia continua de la resistencia a los antibióticos.

RESUMO Objetivos. Avaliar a suscetibilidade a antibióticos das bactérias consideradas prioritárias pela Organização Mundial da Saúde (OMS) (Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella spp., Staphylococcus aureus e Streptococcus pneumoniae) em hemoculturas coletadas no hospital regional de Orinoquía na Colômbia. Métodos. Estudo transversal utilizando dados laboratoriais de rotina do período 2019-2021. Foram examinados os dados de amostras de sangue de pacientes com suspeita de infecção de corrente sanguínea. Determinamos o número total de hemoculturas realizadas e a proporção de culturas com rendimento, as características dos pacientes com bactérias prioritárias, e o tipo de bactéria isolada e padrões de resistência a antibióticos. Resultados. Das 25.469 hemoculturas realizadas, 1.628 (6%) foram positivas para bactérias, sendo que 774 (48%) dessas bactérias eram da lista de agentes patogênicos prioritários da OMS. A maioria das bactérias prioritárias isoladas (558; 72%) eram gram-negativas e 216 (28%) eram gram-positivas. A maioria dos pacientes com bactérias prioritárias (666; 86%) estava internada em enfermaria, e não em unidade de terapia intensiva. 427 (55%) eram homens e 321 (42%) tinham ≥ 60 anos de idade. Das 216 bactérias gram-positivas isoladas, 205 (95%) eram Staphylococcus aureus. Das 558 bactérias gram-negativas prioritárias isoladas, as três mais frequentes foram Escherichia coli (34%), Klebsiella pneumoniae (28%) e Acinetobacter baumannii (20%). O Staphylococcus aureus apresentou maior resistência à oxacilina (41%). Entre as bactérias gram-negativas, a resistência aos antibióticos variou entre 4% (amicacina) e 72% (ampicilina). Conclusões. O rendimento bacteriano das hemoculturas foi baixo e pode ser melhorado. As bactérias consideradas prioritárias pela OMS foram encontradas em todas as enfermarias do hospital. Os achados exigem normas rigorosas de prevenção e controle de infecção, e vigilância contínua da resistência bacteriana a antibióticos.

High levels of antimicrobial resistance in Escherichia coli and Salmonella from poultry in Ecuador / Niveles elevados de resistencia antimicrobiana de las bacterias Escherichia coli y Salmonella en aves de corral en Ecuador / Altos níveis de resistência aos antimicrobianos em Escherichia coli e Salmonella de aves de criação no Equador

ABSTRACT Objective. To describe antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli and Salmonella spp. isolated from chicken carcasses and the antimicrobials commonly used in animals in Ecuador and provide information on antimicrobial resistance patterns for implementing evidence-based corrective measures. Methods. Meat samples were collected from chicken carcasses in 199 slaughterhouses across Ecuador as part of a national pilot study for monitoring antimicrobial resistance in agricultural sources in 2019. Samples were tested for E. coli and Salmonella spp. Sensitivity to 10 critically important and three highly important antimicrobials (from a human health perspective) was assessed. The country report submitted to the World Organization for Animal Health was accessed to extract the quantity of antimicrobials produced or imported for use in animals. Results. Of 383 samples, E. coli was isolated from 148 (39%) and Salmonella spp. from 20 (5%) samples. Ninety percent of the isolates were resistant to at least one critically important antimicrobial. Resistance was highest to erythromycin (E. coli 76%; Salmonella spp. 85%) and tetracycline (E. coli 71%; Salmonella spp. 90%). Critically or highly important antimicrobials (colistin, tetracycline, trimethoprim/sulfamethoxazole) formed the bulk (87%) of antimicrobials used in animals as per the World Organization for Animal Health report. Conclusions. High prevalence of antimicrobial resistance in poultry in Ecuador calls for the development of guidelines and regulations on the use of antimicrobials and for engagement with livestock producers. The existing surveillance system needs to be strengthened to improve the monitoring of antimicrobial use and evolving resistance patterns.

RESUMEN Objetivo. Describir los perfiles de resistencia antimicrobiana de las bacterias Escherichia coli y Salmonella spp. aisladas en carne de pollo y los antimicrobianos comúnmente empleados en animales en Ecuador, así como proporcionar información sobre los patrones de resistencia a los antimicrobianos para poner en marcha medidas correctivas basadas en la evidencia. Métodos. Se recogieron muestras de carne de pollo en 199 mataderos de todo Ecuador en el marco de un estudio piloto nacional para monitorear la resistencia a los antimicrobianos en fuentes agrícolas en el 2019. Se analizaron las muestras en busca de E. coli y Salmonella spp. Se evaluó la sensibilidad a diez antimicrobianos de importancia crítica y tres muy importantes (para la salud humana). Se accedió al informe de país presentado ante la Organización Mundial de Sanidad Animal para obtener la cantidad de antimicrobianos producidos o importados para su uso en animales. Resultados. De 383 muestras, se aisló E. coli en 148 (39%) y Salmonella spp. en 20 (5%). En total, 90% de las cepas aisladas fueron resistentes a al menos un antimicrobiano de importancia crítica. Hubo una mayor resistencia a la eritromicina (E. coli: 76%; Salmonella spp.: 85%) y a la tetraciclina (E. coli: 71%; Salmonella spp.: 90%). Los antimicrobianos de importancia crítica o muy importantes (colistina, tetraciclina, trimetoprima/sulfametoxazol) constituyeron la mayor parte (87%) de los antimicrobianos empleados en animales según el informe de la Organización Mundial de Sanidad Animal. Conclusiones. Debido a la alta prevalencia de la resistencia a los antimicrobianos en las aves de corral en Ecuador, son imprescindibles la elaboración de directrices y regulaciones sobre el uso de antimicrobianos y el compromiso con los productores pecuarios. Es necesario fortalecer el sistema de vigilancia existente para mejorar el seguimiento del uso de antimicrobianos y de la evolución de los patrones de resistencia.

RESUMO Objetivo. Descrever perfis de resistência aos antimicrobianos em Escherichia coli e Salmonella spp. isoladas de carcaças de frango e os antimicrobianos comumente usados em animais no Equador e fornecer informações sobre padrões de resistência aos antimicrobianos para implementar medidas corretivas baseadas em evidências. Métodos. Foram coletadas amostras de carne de carcaças de frango em 199 abatedouros em todo o Equador como parte de um estudo piloto nacional para monitorar a resistência aos antimicrobianos de origem agrícola em 2019. Foram testadas amostras de E. coli e Salmonella spp. Foi avaliada a sensibilidade a 10 agentes antimicrobianos de importância crítica e três agentes antimicrobianos muito importantes (do ponto de vista da saúde humana). O relatório do país apresentado à Organização Mundial de Saúde Animal foi acessado para extrair a quantidade de antimicrobianos produzidos ou importados para uso em animais. Resultados. De 383 amostras, E. coli foi isolada em 148 (39%) e Salmonella spp. em 20 (5%). Noventa por cento dos isolados foram resistentes a pelo menos um antimicrobiano de importância crítica. A resistência foi maior à eritromicina (E. coli, 76%; Salmonella spp., 85%) e à tetraciclina (E. coli, 71%; Salmonella spp., 90%). Antimicrobianos de importância crítica ou muito importantes (colistina, tetraciclina, trimetoprim/sulfametoxazol) responderam pela maior parte (87%) dos antimicrobianos utilizados em animais, conforme o relatório da Organização Mundial de Saúde Animal. Conclusões. A alta prevalência de resistência aos antimicrobianos na avicultura no Equador exige o desenvolvimento de diretrizes e regulamentos sobre o uso de antimicrobianos e o envolvimento com os produtores de gado e avícolas. O sistema de vigilância existente precisa ser reforçado para melhorar o monitoramento do uso de antimicrobianos e a evolução dos padrões de resistência.

Ação antimicrobiana de extratos de gengibre (Zingiber officinale) e quilaia (Quillaja saponaria) isolados e associados sobre Pseudomonas aeruginosa resistente a antibióticos / Antimicrobial action of isolated and associated extracts of ginger (Zingiber officinale) and quilaia (Quillaja saponaria) on antibiotic-resistant Pseudomonas aeruginosa

Extratos de plantas têm demonstrado diversos efeitos positivos para a saúde, incluindo ação antimicrobiana, no entanto, o uso clínico da fitoterapia ainda é discreto, de modo que mais estudos sobre os efeitos benéficos do sinergismo farmacológico de extratos poderiam contribuir para sua aplicação terapêutica. O objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos dos extratos glicólicos de gengibre (EG) e quilaia (EQ) isolados e em associação sobre 7 cepas clínicas de Pseudomonas aeruginosa e uma cepa padrão em forma planctônica e biofilmes monotípicos. Para a análise antimicrobiana sobre cultura planctônica foram feitos testes para determinação de Concentração Inibitória Mínima (CIM) e Concentração Microbicida Mínima (CMM) (CLSI, M07-A9) dos extratos isolados, além do Índice de Concentração Inibitória Fracionada (ICIF) e do Índice de Concentração Microbicida Fracionada (ICMF) para os extratos combinados. A análise estatística foi feita com método ANOVA e teste de Tukey para dados com distribuição normal e Kruskall-Wallis com Teste de Comparação Múltipla de Dunn para dados sem distribuição normal (significância de 5%). Para cepa padrão foram determinadas CIM igual a 3,12 mg/mL e CMM igual a 6,25 mg/mL para ambos os extratos. Para cepas clínicas as CIM do EG foram 3,12 ou 6,25 mg/mL e de EQ 1,56 ou 3,12 mg/mL, enquanto os valores de CMM foram de 6,25 mg/mL para EG e de 1,56, 3,12 ou 6,25 mg/mL para EQ. Os resultados de ICIF indicaram 15 associações sinérgicas e 4 associações aditivas dos extratos contra a cepa padrão e, dentre cepas clínicas, foram obtidos 15 resultados aditivos. A partir dos resultados de ICMF foram identificadas 6 associações sinérgicas e 1 associação aditiva contra a cepa padrão, além de 8 associações com efeito aditivo contra cepas clínicas. A partir dos resultados de testes em culturas planctônicas foi avaliada a ação antibiofilme sobre as cepas em que foram observadas reduções de viabilidade de 36,7 e 34% para o EG (50 e 25 mg/mL) e 51,3 e 51,4% para EQ (25 e 12,5 mg/mL) contra cepa padrão. As reduções em cepas clínicas variaram de 43 a 73% com EG e de 36 a 79% para EQ. As associações dos extratos promoveram reduções de viabilidade de 8 a 35% contra 5 das 7 cepas clínicas. Conclui-se que os extratos glicólicos de gengibre e quilaia apresentam ação antimicrobiana de forma isolada e combinados com efeito aditivo sobre a forma planctônica de cepas clínicas resistentes de P. aeruginosa. De forma isolada, os extratos apresentaram importante ação preventiva na formação dos biofilmes dessas cepas, podendo ser considerados potenciais fitoterápicos com aplicações terapêuticas para o combate das infecções por P. aeruginosa. (AU)

Plant extracts have demonstrated several positive health effects, including antimicrobial action, however, the clinical use of phytotherapy is still discreet, so that more studies on the beneficial effects of pharmacological synergism of extracts could contribute to its therapeutic application. The aim of this study was to evaluate the effects of glycolic extracts of ginger (EG) and quilaia (EQ) alone and in combination on 7 clinical strains of Pseudomonas aeruginosa and a standard strain in planktonic form and monotypic biofilms. For the antimicrobial analysis on planktonic culture, tests were performed to determine the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) and Minimum Microbicidal Concentration (MMC) (CLSI, M07-A9) of the isolated extracts, in addition to the Fractional Inhibitory Concentration Index (FICI) and the Fractionated Microbicidal Concentration Index (FICM) for the combined extracts. Statistical analysis was performed using the ANOVA method and Tukey's test for data with normal distribution and Kruskall-Wallis with Dunn's Multiple Comparison Test for data without normal distribution (5% significance). For the standard strain, MIC were determined equal to 3.12 mg/mL and MMC equal to 6.25 mg/mL for both extracts. For clinical strains the MIC of EG were 3.12 or 6.25 mg/mL and 1.56 or 3.12 mg/mL of EQ, while the MMC values were 6.25 mg/mL for EG and 1.56, 3.12 or 6.25 mg/ml for EQ. The FICI results indicated 15 synergistic and 4 additive associations of the extracts against the standard strain and, among clinical strains, 15 additive results were obtained. From the FICM results, 6 synergistic and 1 additive association against the standard strain were identified, in addition to 8 associations with additive effect against clinical strains. Based on the results of tests on planktonic cultures, the antibiofilm action were evaluated on the strains in which viability reductions of 36 and 34% were observed for EG (50 and 25 mg/mL) and 51% were observed for EQ (25 and 12, 5 mg/mL) against the standard strain. Reductions in clinical strains ranged from 43 to 73% with EG and from 36 to 79% for EQ. Associations of extracts promoted viability reductions of 8 to 35% against 5 out of 7 clinical strains. It is concluded that the glycolic extracts of ginger and quilaia have antimicrobial action in isolation and combined with additive effect on the planktonic form of resistant clinical strains of P. aeruginosa. Isolated, the extracts showed an important preventive action in the formation of biofilms of these strains and may be considered potential herbal medicines with therapeutic applications to combat P. aeruginosa infections. (AU)

READ-ing antimicrobial stewardship in the Caribbean: a tri-nation document review / El método READ y la administración de antimicrobianos en el Caribe: una revisión trinacional de documentos / Uso racional de antibióticos no Caribe com base na abordagem READ: revisão de documentos de três países

ABSTRACT Objective. To explore the antimicrobial stewardship policy landscape in three English-speaking Caribbean countries (Barbados, Guyana, and Saint Lucia) and examine the key enablers and challenges to the design and implementation of formal antimicrobial stewardship programs. Methods. A document analysis that searched for existing policy, communications, and contributions on antimicrobial stewardship from these three countries, adapting the READ (Ready materials; Extract data; Analyze data; Distill findings) approach, a systematic procedure for health policy document review. Results. The search strategy identified 726 initial records. Of those, 15 (2%) met the inclusion criteria. The analysis included official policy documents (n = 3), scholarly works/reviews (n = 3), advocacy documents (n = 2), news articles (n = 4), and confidential reports (n = 3) from the three countries. Conclusions. Critical matters such as cross-programmatic coordination, the significance of individual action, and the need for bidirectional knowledge discourse are prominent in optimizing antimicrobial stewardship adaptation in these countries. CARICOM regional coordination has positively impacted the integration of infection prevention and control with antimicrobial stewardship across this knowledge network.

RESUMEN Objetivo. Explorar el panorama de las políticas de optimización del uso de antimicrobianos en tres países caribeños de habla inglesa (Barbados, Guyana y Santa Lucía) y examinar los principales facilitadores y desafíos para elaborar y aplicar programas formales de optimización del uso de antimicrobianos. Métodos. Se adaptó el método READ (acrónimo en inglés de "materiales listos; extraer los datos; analizar los datos; destilar los resultados"), un procedimiento sistemático para la revisión de documentos sobre políticas de salud, a fin de realizar un análisis de documentos que buscó las políticas, comunicaciones y contribuciones existentes sobre la optimización del uso de antimicrobianos en esos tres países. Resultados. La estrategia de búsqueda permitió localizar 726 documentos iniciales. De ellos, 15 (el 2%) cumplían los criterios de inclusión. El análisis abarcó documentos oficiales de políticas (n = 3), trabajos académicos o revisiones (n = 3), documentos de promoción de la causa (n = 2), artículos de noticias (n = 4) e informes confidenciales (n = 3) de los tres países. Conclusiones. Varios aspectos críticos, como la coordinación interprogramática, la importancia de la acción individual y la necesidad de una comunicación bidireccional del conocimiento, son preponderantes para adaptar de la mejor manera la optimización del uso de antimicrobianos en estos países. La coordinación regional de la CARICOM ha influido positivamente para integrar la prevención y el control de infecciones con la optimización del uso de antimicrobianos en toda esta red de conocimientos.

RESUMO Objetivo. Explorar o cenário da política para uso racional de antibióticos em três países anglófonos do Caribe (Barbados, Guiana e Santa Lúcia) e examinar os principais fatores facilitadores e desafios para a elaboração e implementação de programas formais de uso racional de antibióticos. Métodos. Análise de documentos em busca de políticas, comunicações e contribuições existentes sobre o uso racional de antibióticos nesses três países, adaptando a abordagem READ (sigla em inglês para preparar materiais, extrair e analisar dados e destacar os principais achados), um procedimento sistemático para a revisão de documentos de políticas de saúde. Resultados. A estratégia de busca identificou 726 registros iniciais. Desses, 15 (2%) atenderam aos critérios de inclusão. A análise incluiu documentos oficiais de políticas (n = 3), trabalhos acadêmicos/revisões (n = 3), documentos em defesa da causa (n = 2), reportagens (n = 4) e relatórios confidenciais (n = 3) dos três países. Conclusões. Questões críticas, como a coordenação interprogramática, a importância da ação individual e a necessidade de um discurso bidirecional de conhecimento, se destacam na adaptação otimizada das diretrizes de uso racional de antibióticos nesses países. A coordenação regional da Comunidade do Caribe (CARICOM) contribuiu para integrar a prevenção e o controle de infecções ao uso racional de antibióticos em toda essa rede de conhecimento.

Perfiles de expresión de los genes ERG11, MDR1 y AFR1 en Cryptococcus neoformans var. grubii aislados de pacientes con HIV / Gene expression profiles of ERG11, MDR1 y AFR1 in Cryptococcus neoformans var. grubbi isolated from HIV patients

Introducción. El fluconazol es el antifúngico más utilizado para la prevención y el tratamiento de infecciones causadas por el género Cryptococcus, agente etiológico de la criptococosis. La resistencia al fluconazol en los aislamientos de Cryptoccocus neoformans puede hacer fracasar el tratamiento y generar recaídas de la infección. Objetivo. Evaluar los perfiles de expresión de los genes AFR1, MDR1 y ERG11 en aislamientos clínicos de C. neoformans var. grubii, durante la respuesta in vitro a la inducción con fluconazol. Materiales y métodos. Se estudiaron 14 aislamientos de C. neoformans var. grubii provenientes de pacientes con HIV, de los cuales 6 eran sensibles al fluconaol y 8 presentaban sensibilidad disminuida. Los niveles de expresión de los genes ERG11, AFR1 y MDR1 se determinaron mediante PCR en tiempo real. Resultados. Los aislamientos resistentes al fluconazol mostraron sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1, mientras que la expresión de los fenotipos de resistencia evaluados se mantuvo homogénea en ERG11, en todos los aislamientos de C. neoformans var. grubii. Conclusiones. La sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1 que codifican las bombas de eflujo, contribuye a la resistencia al fluconazol en los aislamientos estudiados. Sin embargo, los patrones de resistencia que se registran en este hongo, sumado a los casos de recaídas en pacientes con HIV, no pueden atribuirse únicamente a los casos de resistencia por exposición al fármaco. Otros mecanismos podrían también estar involucrados en este fenómeno, como la resistencia emergente (resistencia mediante otros genes ERG) y la heterorresistencia, los cuales deben ser estudiados en estos aislamientos.

Introduction: Fluconazole is the most used antifungal drug for prevention and treatment of Cryptococcus spp. infections, the etiological agent of cryptococcosis. Resistance to fluconazole among Cryptococcus neoformans isolates can lead to treatment failure and generate relapses. Objective: To evaluate the expression profles of the AFR1, MDR1 and ERG11 genes in C. neoformans var. grubii clinical isolates during the in vitro response to fluconazole induction. Materials and methods: Fourteen C. neoformans var. grubii isolates recovered from HIV patients were studied, in which 6 showed sensitivities to fluconazole and 8 decreased sensitivity. The expression levels of ERG11, AFR1 and MDR1 genes were determined by real-time PCR from extracted mRNA. Results: AFR1 and MDR1 genes from C. neoformans var. grubii were overexpressed in fluconazole resistant isolates, whereas ERG11 maintains homogeneous expression in all the evaluated resistance phenotypes of C. neoformans var. grubii isolates. Conclusions: The overexpression of AFR1 and MDR1 genes, which codify for efflux pumps, contributes to fluconazole resistance in the studied isolates. However, the resistance patterns in this fungus and the relapse cases in HIV patients cannot be attributed solely to the exposure to the drug. Heteroresistance and the emerging resistance (resistance through other ERG genes), might be other mechanisms involved in this phenomenon, which must be studied in these isolations.

Bioderecho y la resistencia a los antimicrobianos en Costa Rica / Biolaw and antimicrobial resistance in Costa Rica

La resistencia a los antimicrobianos representa un peligro para la salud humana ya que pone en riesgo el valor clínico de estos medicamentos para el tratamiento y prevención de enfermedades infecciosas. Este fenómeno es multisectorial y requiere de acciones inmediatas; por ello, la Organización Mundial de la Salud ha instado a los países miembros a adoptar planes de acción al respecto. Sin embargo, es necesario implementar un marco jurídico vinculante para la regulación del uso de antimicrobianos, especialmente en los sectores de mayor consumo. El establecimiento de una legislación que asegure el uso prudente de estos medicamentos en la industria de producción animal es posible desde el bioderecho. Con este artículo se procura proponer algunas recomendaciones para la regulación de los antimicrobianos en el sector pecuario fundamentadas en el derecho internacional. Se encontró que la efectividad de estos fármacos es un bien común intrínseco en el derecho a la salud humana, cuya protección, junto con declaraciones internacionales, respalda su regulación. En el sector pecuario resulta urgente implementar medidas vinculantes para reducir su uso, especialmente de aquellos categorizados como de importancia crítica para la salud humana.

Antimicrobial resistance represents a danger to human health since it jeopardizes the clinical value of these drugs for the treatment and prevention of infectious diseases. This multisectoral phenomenon requires immediate action, which is why the World Health Organization has urged member countries to adopt action plans against antimicrobial resistance, however, it is necessary to implement a binding legal framework for the regulation of the use of antimicrobials, especially in the sectors with the highest consumption. The formulation of legislation that ensures the prudent use of these drugs in the animal production industry is possible from biolaw. In this way, this article seeks to propose regulations for the optimization of antimicrobials in the livestock sector based on international law. The effectiveness of antimicrobials was found to be an intrinsic common good in the right to human health. The protection of this right, as well as different international declarations, support the regulation of antimicrobials. In the livestock sector, it is urgent to implement binding measures to reduce the use, especially of those categorized as critically important for human health.

Virulence, biofilm formation ability and antimicrobial resistance of staphylococcus aureus isolated from cell phones of university students / Virulência, capacidade de formação de biofilme e resistência antimicrobiana de staphylococcus aureus isolado de telefones celulares de estudantes universitários

INTRODUCTION: Contamination of cell phones can contribute to the dissemination of pathogens in the community and/or hospital environment. OBJECTIVE: To characterize Staphylococcus aureus strains isolated from cell phones of university students. METHODS: Samples were collected from 100 cell phones. Detection of genes associated with virulence factors such as biofilm formation (icaA and icaD), enterotoxins production (SEA, SEB, SEC, and SED), and resistance to methicillin (mecA and mecC) was performed in S. aureus isolates by PCR. Typing mecA gene performed by multiplex PCR. Susceptibility to antimicrobials and biofilm formation rate also evaluated by using disk diffusion test and crystal violet staining. RESULTS: S. aureus was present in 40% of the total samples and about 70% of them belonged to Nursing students. Of the isolates, 85% presented resistance to penicillin and 50% were classified as moderate biofilm producers. In addition, 92.5% of isolates contained the gene icaA and 60% of the gene icaD. Approximately 25% of the isolates presented the mecA gene. Typing of the mecA gene showed the presence of staphylococcal chromosome cassette SCCmec I and c III respectively in 20% and 10% of the isolates. 70% of the samples could not be typed by the technique. Regarding the enterotoxins, the most prevalent gene was SEA (30%) followed by the SEC gene (2.5%). The presence of SED and SEB genes not observed in any of the isolates. CONCLUSION: The cleaning and periodic disinfection of cell phones can contribute to the reduction of the risk of nosocomial infection.

INTRODUÇÃO: A contaminação de celulares pode contribuir para a disseminação de patógenos na comunidade e/ou ambiente hospitalar. OBJETIVO: Caracterizar cepas de Staphylococcus aureus de telefones celulares de estudantes universitários. MÉTODOS: Foram coletadas amostras de 100 telefones celulares. Detecção de genes associados a fatores de virulência quanto a: formação de biofilme (icaA e icaD), produção de enterotoxinas (SEA, SEB, SEC e SED) e resistência à meticilina (mecA e mecC) foi realizada em isolados de S. aureus por PCR. A Tipagem do gene mecA foi realizada por PCR multiplex. A susceptibilidade a antimicrobianos e a taxa de formação de biofilme pelo teste de difusão em disco e coloração com cristal violeta. RESULTADOS: S. aureus esteve presente em 40% do total de amostras, destas, 70% pertenciam a estudantes do curso de enfermagem. Dos isolados, 85% apresentaram resistência à penicilina e 50% foram classificados com moderada formação de biofilme. Além disso, 92,5% dos isolados continham o gene icaA e 60% o gene icaD. Aproximadamente 25% dos isolados apresentaram o gene mecA. A tipagem do gene mecA mostrou a presença do cassete cromossômico estafilocócico SSCmec I e III em respectivamente 20% e 10% dos isolados. 70% das amostras não puderam ser identificadas pela técnica. Das enterotoxinas, o gene mais prevalente foi o SEA (30%), seguido pelo gene SEC (2.5%). A presença dos genes SED e SEB não foi observada nos isolados. CONCLUSÃO: A limpeza e desinfecção periódica dos telefones celulares podem contribuir para a redução do risco de infecção nosocomiais.