Enteropathogensddetected in a daycare center, sutheastern Brazil: bacteria, viirus, and parasite research / Enteropatógenos detectados em crianças de creche no Sudeste do Brasil: pesquisa de bactérias, vírus e parasitos

Introduction: The objective of this study was to determine the prevalence and etiological profile of enteropathogens in children from a daycare center. Methods: From October 2010 to February 2011 stool samples from 100 children enrolled in a government daycare center in the municipality of São José do Rio Preto, in the state of São Paulo, were collected and analyzed. Results: A total of 246 bacteria were isolated in 99% of the fecal samples; 129 were in the diarrheal group and 117 in the non-diarrheal group. Seventy-three strains of Escherichia coli were isolated, 19 of Enterobacter, one of Alcaligenes and one of Proteus. There were 14 cases of mixed colonization with Enterobacter and E. coli. Norovirus and Astrovirus were detected in children with clinical signs suggestive of diarrhea. These viruses were detected exclusively among children residing in urban areas. All fecal samples were negative for the presence of the rotavirus species A and C. The presence of Giardia lamblia, Entamoeba coli, Endolimax nana and hookworm was observed. A significant association was found between food consumption outside home and daycare center and the presence of intestinal parasites. Conclusions: For children of this daycare center, intestinal infection due to pathogens does not seem to have contributed to the occurrence of diarrhea or other intestinal symptoms. The observed differences may be due to the wide diversity of geographical, social and economic characteristics and the climate of Brazil, all of which have been reported as critical factors in the modulation of the frequency of different enteropathogens.

Introdução: O objetivo deste estudo foi determinar a prevalência e o perfil etiológico de enteropatógenos em crianças de uma creche. Métodos: No período de outubro de 2010 a fevereiro de 2011 foram coletadas e analisadas amostras de fezes de 100 crianças matriculadas em creche do governo no município de São José do Rio Preto, Estado de São Paulo. Resultados: Um total de 246 bactérias foram isoladas em 99% das amostras de fezes; 129 eram diarreicas e 117 não-diarreicas. Foram isoladas setenta e três cepas de Escherichia coli, 19 de Enterobacter, uma de Alcaligenes e uma de Proteus. Foram detectados 14 casos de colonização mista com Enterobacter e de E. coli. Norovírus e Astrovirus foram detectados em crianças com sinais clínicos sugestivos de diarréia. Estes vírus foram detectados exclusivamente entre as crianças residentes em áreas urbanas. Todas as amostras fecais foram negativas para a presença das espécies de rotavírus A e C. Foi observada a presença de Giardia lamblia, Entamoeba coli, Endolimax nana e ancilostomídeos. Foi encontrada associação significativa entre o consumo de alimentos fora do centro da casa e creche e a presença de parasitos intestinais. Conclusões: Para as crianças desta creche, a infecção intestinal por patógenos não parece ter contribuido para a ocorrência de diarreia ou outros sintomas intestinais. As diferenças observadas podem ser atribuídas à grande diversidade de características geográficas, sociais e econômicas e o clima do Brasil, as quais tem sido relatadas como fatores críticos para a modulação da frequência de diferentes enteropatógenos.

Detection of Mycobacterium tuberculosis complex by nested polymerase chain reaction in pulmonary and extrapulmonary specimens / Detecção do complexo Mycobacterium tuberculosis por nested polymerase chain reaction em espécimes pulmonares e extrapulmonares

OBJECTIVE: To compare the performance of nested polymerase chain reaction (NPCR) with that of cultures in the detection of the Mycobacterium tuberculosis complex in pulmonary and extrapulmonary specimens. METHODS: We analyzed 20 and 78 pulmonary and extrapulmonary specimens, respectively, of 67 hospitalized patients suspected of having tuberculosis. An automated microbial system was used for the identification of Mycobacterium spp. cultures, and M. tuberculosis IS6110 was used as the target sequence in the NPCR. The kappa statistic was used in order to assess the level of agreement among the results. RESULTS: Among the 67 patients, 6 and 5, respectively, were diagnosed with pulmonary and extrapulmonary tuberculosis, and the NPCR was positive in all of the cases. Among the 98 clinical specimens, smear microscopy, culture, and NPCR were positive in 6.00%, 8.16%, and 13.26%, respectively. Comparing the results of NPCR with those of cultures (the gold standard), we found that NPCR had a sensitivity and specificity of 100% and 83%, respectively, in pulmonary specimens, compared with 83% and 96%, respectively, in extrapulmonary specimens, with good concordance between the tests (kappa, 0.50 and 0.6867, respectively). CONCLUSIONS: Although NPCR proved to be a very useful tool for the detection of M. tuberculosis complex, clinical, epidemiological, and other laboratory data should also be considered in the diagnosis and treatment of pulmonary and extrapulmonary tuberculosis. .

OBJETIVO: Comparar o desempenho da técnica nested polymerase chain reaction (NPCR) com aquele de culturas na detecção do complexo Mycobacterium tuberculosis em espécimes pulmonares e extrapulmonares. MÉTODOS: Analisamos 20 e 78 espécimes pulmonares e extrapulmonares, respectivamente, de 67 pacientes hospitalizados com suspeita de tuberculose. Um sistema automatizado foi utilizado na identificação de culturas de Mycobacterium spp., e M. tuberculosis IS6110 foi utilizada como sequência alvo na NPCR. A estatística kappa foi utilizada para verificar a concordância entre os resultados. RESULTADOS: Entre os 67 pacientes, 6 e 5, respectivamente foram diagnosticados com tuberculose pulmonar e extrapulmonar, e a NPCR foi positiva em todos os casos. Entre os 98 espécimes clínicos, a baciloscopia, cultura e NPCR foram positivas em 6,00%, 8,16% e 13,26%, respectivamente. Comparando-se os resultados da NPCR com aqueles da cultura (padrão ouro) nos espécimes pulmonares, a sensibilidade e a especificidade foram 100% e 83%, respectivamente, enquanto essas nos espécimes extrapulmonares foram 83% e 96% respectivamente, com boa concordância entre os testes (kappa, 0,50 e 0,6867, respectivamente). CONCLUSÕES: Embora a NPCR tenha se mostrado uma ferramenta muito útil na detecção do complexo M. tuberculosis, No entanto, os resultados positivos da NPCR devem ser associados à clínica, dados clínicos, epidemiológicos e outros dados laboratoriais devem também ser considerados no diagnóstico e tratamento da tuberculose pulmonar e extrapulmonar. .

Mycobacterium tuberculosis detection in the penitentiary system

Descrevemos retrospectivamente a detecção de Mycobacterium tuberculosis (MT) e o seu perfil de suscetibilidade entre detentos de três presídios da região de São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil. Entre 2003 e 2006 foram avaliados 1.070 detentos com suspeita de tuberculose (TB). A positividadedo Mycobacterium sp. foi avaliada pela baciloscopia e cultura. A análise estatística foi realizada utilizando o Epi Info e BioEstat. Não houve diferença significante nos resultados positivos entre as três unidades penitenciárias. Foi encontrado um percentual de 6,9por cento de positividade para MT e operfil de sensibilidade mostrou que 4,2por cento dos detentos apresentaram isolados resistentes a isoniazida,enquanto 6,2por cento foram resistentes à rifampicina. Todos os isolados resistentes foram obtidos de presos bacilíferos, apontando para a possibilidade de transmissão intra-institucional. Nossos dados abrem portas para o entendimento da magnitude da tuberculose e o perfil de resistência às drogas do MT no sistema penitenciário do Estado de São Paulo.

Enteric parasites in HIV-1/AIDS-infected patients from a Northwestern São Paulo reference unit in the highly active antiretroviral therapy era / Enteroparasitas em pacientes infectados pelo HIV-1/AIDS em uma unidade de referência do noroeste paulista na era da terapia antirretroviral de alto impacto

INTRODUCTION: We describe the epidemiology of intestinal parasites in patients from an AIDS reference service in Northeastern São Paulo, Brazil. METHODS: Retrospective evaluation was done for all HIV-1/AIDS-positive patients whose Hospital de Base/São José do Rio Preto laboratorial analysis was positive for enteroparasites after diagnosis of HIV-1 infection, from January 1998 to December 2008. Statistical analysis was performed using the R statistical software version 2.4.1. The level of significance adopted was 5 percent. RESULTS: The most frequent protozoan was Isospora belli (4.2 percent), followed by Giardia lamblia (3.5 percent), Entamoeba coli (2.8 percent), and Cryptosporidium parvum (0.3 percent). Ancylostoma duodenale (1.4 percent) was the most frequently detected helminth, while Taenia saginata and Strongiloides stercoralis were found in 0.7 percent of the samples. The results showed that diarrhea was significantly associated with giardiasis and isosporiasis. However, no association was observed between CD4+ cell counts, viral load, and the characteristics of any particular parasite. CONCLUSIONS: Our data may be useful for further comparisons with other Brazilian regions and other developing countries. The data may also provide important clues toward improving the understanding, prevention, and control of enteric parasites around the world.

INTRODUÇÃO: Descrevemos a epidemiologia de enteroparasitoses em pacientes de um serviço de referência de AIDS, no noroeste paulista, Brasil. MÉTODOS: Durante o período de janeiro de 1998 a dezembro de 2008, foi realizado este estudo retrospectivo por meio da análise dos prontuários dos pacientes diagnosticados com HIV-1/AIDS atendidos no Ambulatório de Doenças Infecto-Parasitárias do Hospital de Base, São José do Rio Preto, São Paulo. As análises estatísticas foram realizadas usando a versão 2.4.1 do software estatístico R. O nível de significância adotado foi de 5 por cento. RESULTADOS: O protozoário mais frequente foi o Isospora belli (4,2 por cento), seguido da Giardia lamblia (3,5 por cento), Entamoeba coli (2,8 por cento) e Criptosporidium parvum (0,3 por cento). O Ancylostoma duodenalis (1,4 por cento) foi o helminto mais detectado, enquanto a Taenia saginata e o Strongiloides stercoralis foram observados em 0,7 por cento das amostras. Os resultados mostraram que a diarreia foi significativamente associada com giardíase e isosporíase. Entretanto, nenhuma associação foi observada entre as contagens de células T CD4+, carga viral e da característica de qualquer parasita em particular. CONCLUSÕES: Nossos dados podem ser úteis para futuras comparações com outras regiões do Brasil e outros países em desenvolvimento. Os dados também podem fornecer pistas importantes para a melhoria da compreensão, prevenção e controle de parasitas entéricos em todo o mundo.

Giardiasis as zoonosis: between proof of principle and paradigm in the Northwestern region of São Paulo State, Brazil

OBJECTIVE: In order to evaluate the potential zoonotic transmission of Giardia duodenalis, isolates from humans and dogs in the Northwestern region of the São Paulo State, Brazil were characterized based on the β-giardin gene. METHODS: The samples were analyzed by sequencing of the Nested-PCR products. RESULTS: The A1 and A2 subgenotypes were detected in human and dogs. Cysts of assemblage B, C and D have not been found in any isolates studied. CONCLUSIONS: These results are consistent with the view that giardiasis in the largest endemic region of the Brazil should not be seen as a single entity.

Enteroparasitoses numa população de escolares da rede pública de ensino do Município de Mirassol, São Paulo, Brasil / Enteroparasitoses in a population of students from a public school in the Municipality of Mirassol, São Paulo State, Brazil

Verificou-se a prevalência dos enteroparasitos em 310 alunos (2 a 15 anos) matriculados numa escola da rede pública do município de Mirassol, no Estado de São Paulo. Uma amostra fecal de cada criança foi coletada e processada pelos métodos Faust e de Hoffmann, Pons & Janer, usualmente empregados na detecção de protozoários e helmintos humanos. Das crianças analisadas apresentaram-se parasitadas 30,3 por cento, com pelo menos um parasito intestinal patogênico. Giardia Lamblia foi o protozoário mais frequente (15,16 por cento), seguido da Entamoeba histolytica (0,64 por cento). Os helmintos detectados foram: Ascaris lumbricoides (3,55 por cento), Strongiloides stercoralis e Taenia sp, que foram diagnosticados em 0,32 por cento das amostras avaliadas. Verificou-se associação significativa entre enteroparasitoses e uso de água de torneira. Não se observou significância estatística na comparação entre faixas etárias ou gênero e a presença de parasitos. Embora não tenhamos associado distúrbios gastrointestinais à presença de doenças parasitárias intestinais, a presença destes agentes pode provocar novos casos, visto que estas crianças podem funcionar como portadores e, portanto, fonte de contaminação. Este estudo sugere que um programa de educação continuada envolvido com a prevenção e tratamento das infecções parasitárias é uma medida fundamental para a sua erradicação.

This study observed the prevalence of intestinal parasites in 310 students (2 to 15 years old) enrolled in a public school in the Municipality of Mirassol, São Paulo State, Brazil. A stool sample was collected from each child and analyzed by the methods of Faust and Hoffmann, Pons and Janer, normally used for detection of protozoa and human helminths. A total of 30.3 per cent of the children analyzed were parasitized, with at least one pathogenic intestinal parasite. Giardia Lamblia was the most common protozoan (15.16 per cent), followed by Entamoeba histolytica (0.64 per cent). The helminths found were Ascaris lumbricoides (3.55 per cent), Strongiloides stercoralis and Taenia sp, which were diagnosed in 0.32 per cent of the samples. There was a significant association between the occurrence of enteroparasitoses and the use of tap water. The comparison between the age groups, gender and the presence of parasites showed no statistical relevance. Although there was no association between gastrointestinal disorders and the occurrence of intestinal parasitic diseases, these agents may cause new infections because the children can act as carriers and therefore a source of contamination. This article suggests that a continuing education program focused on the prevention and treatment of parasitic infections is a key measure for their eradication.

Concurrent dengue and malaria in the Amazon region / Co-infecção por dengue e malária na região Amazônica

INTRODUCTION: The Amazon region has extensive forested areas and natural ecosystems, providing favorable conditions for the existence of innumerous arboviruses. Over 200 arboviruses have been isolated in Brazil and about 40 are associated with human disease. Four out of 40 are considered to be of public health importance in Brazil: Dengue viruses (1-4), Oropouche, Mayaro and Yellow Fever. Along with these viruses, about 98 percent of the malaria cases are restricted to the Legal Amazon region. METHODS: This study aimed to investigate the presence of arboviruses in 111 clinical serum samples from patients living in Novo Repartimento (Pará), Plácido de Castro (Acre), Porto Velho (Rondônia) and Oiapoque (Amapá). The viral RNA was extracted and RT-PCR was performed followed by a Multiplex-Nested-PCR, using Flavivirus, Alphavirus and Orthobunyavirus generic and species-specific primers. RESULTS: Dengue virus serotype 2 was detected in two patients living in Novo Repartimento (Pará) that also presented active Plasmodium vivax infection. CONCLUSIONS: Despite scant data, this situation is likely to occur more frequently than detected in the Amazon region. Finally, it is important to remember that both diseases have similar clinical findings, thus the diagnosis could be made concomitantly for dengue and malaria in patients living or returning from areas where both diseases are endemic or during dengue outbreaks.

INTRODUÇÃO: A região Amazônica possui extensas áreas florestadas e ecossistemas naturais, provendo condições favoráveis para a existência de diversos arbovírus. Aproximadamente, 200 arbovírus foram isolados no Brasil, e 40 estão associados com doenças em humanos. Quatro destes 40 são considerados ser de importância para a saúde pública no Brasil: vírus da dengue (1-4), Oropouche, Mayaro e febre amarela. Juntamente com estes vírus, aproximadamente 98 por cento dos casos de malária estão restritos à região da Amazônia Legal. MÉTODOS: O objetivo deste estudo foi investigar a presença de arbovírus em 111 amostras clínicas de sangue de pacientes que residiam em Novo Repartimento (Pará), Plácido de Castro (Acre), Porto Velho (Rondônia) and Amapá (Macapá). O RNA viral foi extraído, RT-PCR foi realizada seguida de uma Multiplex-Nested-PCR, usando primers genéricos e espécie-específicos para Flavivirus, Alphavirus and Orthobunyavirus. RESULTADOS: Detectamos o vírus da dengue, sorotipo 2, em dois pacientes que residiam em Novo Repartimento (Pará), que também tinham infecção por Plasmodium vivax. CONCLUSÕES: Apesar de dados escassos, esta situação, provavelmente, ocorre mais frequência que a detectada na região Amazônica. Definitivamente, é importante lembrar que ambas as doenças possuem achados clínicos similares, assim o diagnóstico deveria ser feito concomitantemente para dengue e malária em pacientes que residem ou estão voltando de áreas onde ambas as doenças são endêmicas.

Osteomyelitis: a current challenge

Over the last 30 years, the pathogenesis of osteomyelitis has almost been totally elucidated, and many factors responsible for the persistence of this infection have been identified. Numerous antimicrobial agents with distinct spectrums of action, pharmacokinetics, and pharmacodynamics have been used in its treatment. Surgical techniques, including muscle grafts, the Ilizarov technique, and antibiotic bone cements, have been applied. However, bone infections are still a challenge. Despite the importance of isolation and identification of microorganisms to determine the antimicrobial treatment of bone infections, there are few systematic national studies about the etiological profile of these diseases. This article describes the current knowledge of osteomyelitis and summarizes published national data based on the experience of different Orthopedic and Traumatology Services. In general, S. aureus was described as an important etiological agent; however, the difference in design of national studies makes a comparison between the prevalence of bone infection, the associated risk factors, and the different therapeutic approaches difficult. In conclusion, effort is necessary in order to stimulate systematic national studies in different Orthopedics and Traumatology Services to obtain a better consensus on preventive measures and therapies of bone infections.

Catheter-related infections in a northwestern São Paulo reference unit for burned patients care

Despite improvements in care and rehabilitation of burned patients, infections still remain the main complication and death cause. Catheter-related infections are among the four most common infections and are associated with skin damage and insertion site colonization. There are few studies evaluating this kind of infection worldwide in this special group of patients. Padre Albino Hospital Burn Care Unit (PAHBCU) is the only reference center in the Northwestern São Paulo for treatment of burned patients. This paper presents the results of a retrospective study aiming at describing the epidemiological and clinical features of catheter-related infections at PAHBCU.

The frequency of HLA-DRB1 polymorphisms in Brazilian Plasmodium vivax malaria patients and in blood donors from the Amazon Region / Frequência de polimorfismos HLA-DRB1 em pacientes brasileiros com malária por Plasmodium vivaxe em doadores de sangue da Região Amazônica

We evaluated the frequency of different HLA-DRB1 alleles in Plasmodium vivax-infected individuals and in healthy blood donors from malaria endemic areas of Brazil. Low-resolution human leukocyte antigen-DRBl genotyping was performed for 73 malaria patients and 29 healthy blood donors. The most frequent alleles in individuals from northern Brazil were human leukocyte antigen-DRB1*04, *08, *07 and *13. The frequency of human leukocyte antigen-DRB1*07 was higher in malaria-infected individuals than in the control group, which reinforces the theory that this allele plays an important role in susceptibility to malaria. This study offers new information about a potential susceptibility factor for P. vivax malaria in a Brazilian population that is naturally exposed to malaria.

Este estudo avaliou a frequência de diferentes alelos HLA-DRB1 em indivíduos infectados por Plasmodium vivax e em doadores de sangue saudáveis provenientes de áreas endêmicas de malária do Brasil. Foi realizada uma genotipagem de baixa resolução dos alelos HLA-DRB1 em 73 pacientes com malária e em 29 doadores de sangue saudáveis. Os alelos mais frequentes em indivíduos do norte do Brasil foram HLA-DRB1 *04, *08, *07 e *13. A frequência de HLA-DRB1 *07 foi maior nos indivíduos infectados com malária do que no grupo controle, o que reforça a hipótese de que esse alelo desempenha um papel importante na suscetibilidade à malária. Esta pesquisa fornece novas informações sobre um fator potencial de suscetibilidade à malária por P. vivax em uma população brasileira naturalmente exposta à doença.

Etiological agents of diarrhea in patients infected by the human immunodeficiency virus-1: a review: [revision] / Agentes etiológicos da diarréia em pacientes infectados pelo vírus da imunodeficiência tipo-1: revisão: [revisão]

Despite the importance of understanding the epidemiology of agents responsible for infectious diarrhea in human immunodeficiency virus (HIV)/acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) population, the number of articles about this subject is relatively few. The current article summarizes published data on bacterial, fungal, viral and parasitic enteropathogens in the HIV/AIDS seropositive subjects in different countries, regions and localities. In general, there is a great difference in the frequencies of etiological agents due to factors which include immune status, geographical location, climate and socioeconomic conditions. It is important to stress that a great prevalence of infection by emergent agents has been reported in the more advanced stages of AIDS. Therefore, to establish specific treatment depends directly on knowledge of these agents and risk factors associated to their distribution. Moreover, the colonization by potential pathogenic agents verified in these individuals is high thus implicating that they act as carriers. Finally, public health measures of control and prevention must take into consideration the regional previously identified enteropathogens, especially in areas where HIV prevalence is high.

Muito embora a importância do conhecimento sobre a epidemiologia dos agentes responsáveis pela diarréia infecciosa nos portadores do vírus da imunodeficiência humana (HIV) e/ou doentes pela síndrome da imunodeficiência adquirida (SIDA), o número de artigos científicos sobre o tema é relativamente pequeno. Este artigo resume os dados já publicados sobre os enteropatógenos bacterianos, fúngicos, virais e parasitários que acometem os indivíduos soropositivos para o HIV e/ou doentes pela SIDA em diferentes países, regiões e localidades. Em geral, existe uma grande diferença nas freqüências dos agentes etiológicos, devido a fatores que incluem status imunológico, localização geográfica, clima e condições socioeconômicas. Ressalta-se, que é grande a prevalência de infecção por agentes emergentes nos estágios mais avançados da SIDA. Portanto, o estabelecimento de tratamento específico depende diretamente do conhecimento desses agentes bem como dos fatores de risco associados à sua distribuição. Ademais, a colonização por patógenos em potencial nesses indivíduos é elevada o que determina o estado de portadores assintomáticos. Por fim, medidas em saúde pública relativas ao controle e prevenção da diarréia nessa população devem considerar os enteropatógenos de importância regional, especialmente em áreas onde a prevalência do HIV é elevada.

Estudo de colonização por Candida sp. na cavidade oral de indivíduos soropositivos e soronegativos para HIV-1 no Noroeste Paulista, Brasil / Candida sp. in the oral cavities of HIV-1 serum positive and serum negative individuals from the Northeastern São Paulo State region, Brazil

Este estudo avaliou Candida sp. isolada da mucosa orofaríngea e sua sensibilidade antifúngica em 52 portadores do HIV/Aids, residentes na Região Noroeste Paulista e respectivos controles. Para tanto, foram utilizados testes clássicos, o “kit” API20IDAUX e a disco difusão para: anfotericina B, fluconazol, itraconazol e cetoconazol. O isolamento de Candida sp. foi maior (p < 0,05) em pacientes e controles, sendo o índice de colonização/infecção superior entre usuários de próteses dentárias, em ambos os grupos (p < 0,05). A freqüência de espécies “não-albicans” não diferiu (21%) nesses grupos. Todas as cepas obtidas foram sensíveis a anfotericina B, enquanto uma cepa de C. albicans foi resistente a todos os azóis. Treze por cento das cepas foram resistentes ao fluconazol, em ambos os grupos. Nossos resultados mostram que o grupo HIV/Aids é mais colonizado por Candida sp. que os soronegativos para este vírus, sem mudança na proporção Candida albicans/“não-albicans” ou no perfil de resistência aos azóis.

Genetic relatedness among clinical strains of Stenotrophomonas maltophilia in tertiary care hospital settings in São Paulo State, Brazil

Stenotrophomonas maltophilia is a Gram-negative bacillus, which is becoming widely recognized as an important nosocomial pathogen. The main objective of this study was to evaluate the genetic relatedness, by random amplified polymorphic DNA (RAPD) and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) of 86 clinical isolates of S. maltophilia (colonization 22, infection 64) obtained from 79 hospitalized patients, from different geographic regions of São Paulo State. The genotypic analysis performed by RAPD and PFGE was used in 24 isolates for genetic identity confirmation. The results were congruent between the two methods but it was not possible to link genetic profiles with the studied variables, clinical state and geographic area, probably due to the great variability among the strains. The analyses by PFGE confirmed identity in 5 pairs of microorganisms and RAPD, in this study, showed to be a useful tool for investigation of diversity leading the identification of 85 genetic profiles. The genetic diversity shown may be due to re-infection by different strains or co-infection by multiple strains which suggests multiple entry sources of the bacterium in the hospital setting or of acquisition by patient. In this setting, colonization, infection and re-infection occur with unknown frequency, raising the need for the establishment of specific control measures.

Stenotrophomonas maltophilia é um bacilo Gram-negativo, conhecido como importante patógeno nosocomial. O principal objetivo desse estudo foi avaliar a relação genética, através da análise randômica do polimorfismo de DNA (RAPD) e eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE), de 86 isolados clínicos de S. maltophilia (22 de colonização, 64 de infecção) obtidos de 79 pacientes hospitalizados em diferentes regiões geográficas do estado de São Paulo. A análise genotípica foi realizada através da técnica RAPD e o PFGE foi usado em 24 isolados para confirmar a identidade genética dos mesmos. Os resultados foram coerentes entre os dois métodos, mas não foi possível correlacionar um perfil genético com as variáveis estudadas, estado clínico e área geográfica, provavelmente pela ampla variabilidade entre as linhagens. A análise por PFGE confirmou a identidade genética em 5 pares de microrganismos e o RAPD, neste estudo, mostrou ser uma ferramenta útil para investigação da diversidade, possibilitando identificar 85 perfis genéticos. A diversidade genética observada através do RAPD pode ser devido à re-infecção por diferentes linhagens ou co-infecção por linhagens distintas, sugerindo múltiplas fontes de entrada da bactéria no hospital ou de aquisição pelo paciente. Nesse ambiente, a colonização, infecção e re-infecção ocorrem com freqüência, o que leva à necessidade do estabelecimento de medidas de controle específicas.

Molecular screening of Plasmodium sp. asymptomatic carriers among transfusion centers from Brazilian Amazon region

The transmission of malaria in Brazil is heterogeneous throughout endemic areas and the presence of asymptomatic Plasmodium sp. carriers (APCs) in the Brazilian Amazon has already been demonstrated. Malaria screening in blood banks is based on the selection of donors in respect to possible risks associated with travel or residence, clinical evidence and/or inaccurate diagnostic methods thereby increasing the probability of transfusion-transmitted infection. We evaluated the frequency of APCs in four blood services in distinct areas of the Brazilian Amazon region. DNA was obtained from 400 human blood samples for testing using the phenol-chloroform method followed by a nested-PCR protocol with species-specific primers. The positivity rate varied from 1 to 3 percent of blood donors from the four areas with an average of 2.3 percent. All positive individuals had mixed infections for Plasmodium vivax and Plasmodium falciparum. No significant differences in the results were detected among these areas; the majority of cases originated from the transfusion centres of Porto Velho, Rondônia State and Macapá, Amapá State. Although it is still unclear whether APC individuals may act as reservoirs of the parasite, efficient screening of APCs and malaria patients in Brazilian blood services from endemic areas needs to be improved.

A transmissão da malária no Brasil é heterogênea em todas as áreas endêmicas e a presença de portadores assintomáticos de Plasmodium sp. (PAPs) na Amazônia brasileira já foi demonstrada. A triagem de pacientes maláricos em bancos de sangue é baseada na seleção dos doadores com relação aos riscos possíveis associados com residência, evidência clínica e/ou os métodos diagnósticos não acurados que aumentam a probabilidade da infecção transmitida por transfusão. Avaliamos a freqüência de PAPs em quatro bancos de sangue em áreas distintas da região Amazônica brasileira. O DNA foi obtido a partir de 400 amostras de sangue humano usando o método do fenol-clorofórmio, seguido por um protocolo de nested-PCR com oligonucleotídeos espécie-específicos. A taxa de positividade variou de 1 a 3 por cento de doadores do sangue das quatro áreas, com uma média de 2,3 por cento. Todos os indivíduos positivos tinham infecções mistas entre o Plasmodium vivax e o Plasmodium falciparum. Nenhuma diferença significativa nos resultados foi detectada entre estas áreas; a maioria dos casos originou dos Hemocentros de Porto Velho, do Estado de Rondônia e de Macapá, Estado do Amapá. Embora ainda não esteja claro se os indivíduos PAPs possam agir como reservatórios do parasito, a triagem eficiente de PAPs e de pacientes com malária em bancos de sangue no Brasil das áreas endêmicas necessita ser implementada.

Polimorfismos GSTT1 e GSTM1 em indivíduos tabagistas com carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço / GSTT1 and GSTM1 polymorphism in cigarette smokers with head and neck squamous cell carcinoma

A variabilidade em genes relacionados aos processos de ativação e detoxificação de carcinógenos pode interferir na suscetibilidade ao câncer. OBJETIVO: Investigar a relação entre os polimorfismos GSTT1 e GSTM1 nulos e o risco para o carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço em indivíduos tabagistas. MATERIAL E MÉTODO: Este estudo caso-controle foi realizado na Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, Brasil. Foram avaliadas as freqüências dos genótipos nulos GSTT1 e GSTM1 por PCR multiplex em 60 pacientes com carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço e 60 indivíduos sem a doença. RESULTADOS: A cavidade oral foi o sítio de tumor mais freqüente. O genótipo GSTT1 nulo foi encontrado em 33,3 por cento dos pacientes e em 23,3 por cento dos indivíduos controles (p=0,311). Os grupos caso e controle apresentaram freqüências do genótipo GSTM1 nulo de 35 por cento e 48,3 por cento, respectivamente (p=0,582). Não foram encontradas associações entre o hábito etilista e genótipos nulos GSTT1 e GSTM1 em ambos os grupos (valores de p>0,05). O gênero masculino e o hábito etilista foram prevalentes em ambos os grupos. CONCLUSÃO: Neste estudo não foi possível estabelecer uma correlação entre os genótipos nulos GSTT1 e GSTM1 e o carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço em indivíduos tabagistas.

Gene variability related to carcinogen activation and detoxification may interfere with susceptibility to head and neck cancer. AIM: To investigate the relation between GSTT1 and GSTM1 null polymorphisms and the risk of head and neck squamous cell carcinoma in cigarette smokers. MATERIAL AND METHOD: A case-control study conducted at the Sao Jose do Rio Preto Medical School, Brazil. GSTM1 and GSTT1 null genotype frequencies were evaluated by multiplex PCR in 45 cigarette smokers with head and neck squamous cell carcinomas and 45 cigarette smokers without this disease. RESULTS: The oral cavity was the most prevalent tumor site for squamous cell carcinoma. The GSTT1 null genotype was found in 33.3 percent of the Experimental Group and 23.3 percent of the Control Group (p= 0.311). Experimental and Control Groups had GSTM1 null genotype frequencies of 35 percent and 48.3 percent (p=0.582). No association between alcohol consumption and GSTT1 and GSTMI null genotypes was found in these groups (p-values>0.05). There were more men, and alcohol consumption was prevalent in both groups. CONCLUSION: In this study we were unable to show a correlation between GSTM1 and GSTT1 genotypes and the development of head and neck squamous cell carcinomas in cigarette smokers.

Avaliação da influência da nulidade dos genótipos GSTT1 e GSTM1 na carcinogênese em cabeça e pescoço / Evaluation of the influence of GSTT1 and GSTM1 null genotypes in head and neck carcinogenesis

OBJETIVO: Avaliar a influência dos genótipos nulos dos genes GSTT1 e GSTM1 na carcinogênese em cabeça e pescoço. MÉTODOS: Foram avaliadas as freqüências dos genótipos nulos GSTT1 e GSTM1 pela técnica de reação em cadeia de polimerase (PCR) multiplex em 45 pacientes com carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço e 45 indivíduos sem história de doença neoplásica. Ambos os grupos foram compostos por indivíduos fumantes pareados por sexo, idade e etnia. RESULTADOS: O genótipo GSTT1 nulo foi encontrado em 24,4 por cento dos pacientes e em 17,8 por cento dos indivíduos controle (P = 0,606), enquanto 44,4 por cento dos pacientes e 48,9 por cento dos indivíduos controle revelou genótipo GSTM1 nulo (P = 0,832). Não foi observada correlação entre os genótipos nulos GSTT1 e GSTM1 e os sítios primários de tumor. CONCLUSÃO: Em nosso estudo não foi possível estabelecer a influência da nulidade dos genótipos GSTT1 e GSTM1 na carcinogênese em cabeça e pescoço.

BACKGROUND: To evaluate the influence of GSTM1 and GSTT1 null genotypes in head and neck carcinogenesis. METHODS: The frequencies of GSTM1 and GSTT1 null genotypes were evaluated by multiplex polymerase chain reaction (PCR) in 45 patients with head and neck squamous cell carcinoma and in 45 control group individuals. Both groups were composed of smokers paired by gender, age and race. RESULTS: The GSTT1 null genotype was found in 24.4 percent of the patients and 17.7 percent of the control group (P= 0.606), while 44.4 percent of the patients and 48.8 percent of the control group were bearers of the GSTM1 null genotype (P=0.832). No associations between GSTT1 and GSTMI null genotypes and primary tumor sites were found. CONCLUSION: In our study, it was impossible to establish the influence of the GSTT1 and GSTM1 null genotypes in head and neck carcinogenesis.

Polymorphisms of the DNA repair genes XRCC1 and XRCC3 in a Brazilian population

In several DNA repair genes, polymorphisms may result in reduced repair capacity, which has been implicated as a risk factor for various types of cancer. The frequency of the polymorphic alleles varies among populations, suggesting an ethnic distribution of genotypes. We genotyped 300 healthy Southeastern Brazilian individuals (262 of European ancestry and 38 of African ancestry) for polymorphisms of codons 194 and 399 of the XRCC1 base excision repair pathway gene and of codon 241 of the XRCC3 homologous recombination repair pathway gene. The allele frequencies were 0.07 for the Arg194Trp and 0.33 for the Arg399Gln codons of the XRCC1 gene and 0.35 for the Thr241Met codon of the XRCC3 gene. The genotypic frequencies were within Hardy-Weinberg equilibrium. These frequencies showed ethnic variability when compared with those obtained for different populations from several countries.

Evaluation of an immunochromatography test for malaria diagnosis under different storage conditions

Este estudo objetiva avaliar o desempenho do teste OptiMal de segunda geração para o diagnóstico de malária em diferentes condições de estocagem. Ele detectou todas as amostras positivas, exceto duas amostras de Plasmodium malariae. Futuras pesquisas avaliando as diversas condições ambientais são importantes para a aplicabilidade do ICT em áreas de malária brasileira.

Performance of an immunoenzymatic assay for Cryptosporidium diagnosis of fecal samples

We evaluated the diagnostic performance of a Cryptosporidium immunoenzymatic assay (ELISA). Fecal samples were collected from 94 HIV-seropositive patients. All specimens were processed with a commercially-available ELISA to detect C. parvum specific coproantigen and with a modified Ziehl-Neelsen stain (ZNm) microscope exam. Overall, sensitivity of the immunoenzymatic test was 100 percent, with a specificity of 96 percent; positive and negative predictive values were 89 percent and 100 percent, respectively. The commercial ELISA and ZNm proved to be valuable diagnostic tools for Cryptosporidium infection.