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Sequence analysis of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region of rDNA for identifying Trichogramma species and evaluating genetic diversity / Análise de sequência do rDNA da região espaçadora do transcrito interno 2 (ITS2) para identificar espécies de Trichogramma e avaliar a diversidade genética
Viana, J B V; Querino, R B; Carvalho, L C B; Lima, P S C.
  • Viana, J B V; Universidade Federal do Piauí. Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento. Teresina. BR
  • Querino, R B; Embrapa Meio Norte. Teresina. BR
  • Carvalho, L C B; Universidade Federal do Piauí. Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento. Teresina. BR
  • Lima, P S C; Embrapa Meio Norte. Teresina. BR
Braz. j. biol ; 81(4): 928-933, Oct.-Dec. 2021. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1153425
ABSTRACT
Abstract Species of Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera Trichogrammtidae) are frequently used as biological control agents against Lepidoptera, but practical application of these egg endoparasitoids are complicated because of their complex taxonomy. This study aimed to compare sequences of internal transcribed spacer regions of ribosomal DNA (ITS2-rDNA) of Trichogramma accessions with those deposited in GenBank in order to access the reliability of the ITS2 as a barcode for discriminating species and evaluating the genetic diversity. ITS2-rDNA sequences obtained from seventeen specimens of Trichogramma confirmed previous identifications based on morphological characteristics. Multiple sequence alignment revealed the existence of highly conserved regions in ITS2 sequences while the neighbour-joining dendrogram indicated that the specimens formed three clusters comprising T. manicobai and T. marandobai (group I), T. galloi (group II) and T. pretiosum (group III). The ITS2 marker was shown to be a powerful DNA barcode for discriminating Trichogramma species and could be used to complement the morphological approach.
RESUMO
Resumo Espécies de Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera Trichogrammatidae) são freqüentemente usadas como agentes de controle biológico contra Lepidoptera, esses endoparasitóides de ovos apresentam taxonomia complexa, o que dificulta sua aplicação prática. Este estudo teve como objetivo comparar seqüências de regiões espaçadoras internas transcritas de DNA ribossômico (ITS2-rDNA) de acessos de Trichogramma com aquelas depositadas no GenBank, a fim de avaliar a confiabilidade do ITS2 barcode para discriminar espécies e avaliar a diversidade genética. As seqüências de ITS2-rDNA obtidas de dezessete espécimes de Trichogramma confirmaram identidades anteriores com base em características morfológicas. O alinhamento de múltiplas sequências revelou a existência de regiões altamente conservadas nas sequências ITS2, enquanto o dendrograma indicou que os espécimes formavam três grupos compreendendo T. manicobai e T. marandobai (grupo I), T. galloi (grupo II) e T. pretiosum (grupo III). O marcador ITS2 mostrou ser um poderoso DNA barcode para discriminar espécies de Trichogramma podendo ser usado como complemento da abordagem morfológica.
Subject(s)


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Hymenoptera Type of study: Diagnostic study / Prognostic study Limits: Animals Language: English Journal: Braz. j. biol Journal subject: Biology Year: 2021 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: Embrapa Meio Norte/BR / Universidade Federal do Piauí/BR

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