Vírus da leprose dos citros: sequenciamento completo do genoma, diversidade genética e avaliação de genes potencialmente relacionados com patogenicidade / Citrus leprosis virus: genome sequencing, genetic diversity and evaluation of pathogenicity related genes

RESUMO

A partir das primeiras sequências genômicas do Cil V-C (Citrus leprosis virus ­tipo citoplasmático) através de bibliotecas de cDNA provenientes do produto da replicação viral (dsRNA) (locali, 2002), foi possível concluir o seqüenciamento completo do seu genoma. As informações obtidas possibilitaram caracterizá-lo como um vírus de genoma constituído por ssRNA (mais), bipartido (menos 14 Kb), contendo no RNA 1 duas ORFs, uma delas codificadora de uma poliproteína com três domínios envolvidos com replicase viral e um relacionado com protease. No RNA 2, foram detectadas quatro ORFs, uma delas codificadora da proteína de movimento. Foram identificadas caudas poli A nas extremidades 3 dos dois RNAs, bem como a presença de uma sequência conservada de nucleotídeos (GAUAAAUCU) nas extremidades 5 dos dois RNAs, sugerindo a presença de uma estrutura Cap. As informações até então conhecidas sobre o vírus associado à leprose dos citros e aos ácaros do gênero Brevipalpus os relacionavam à família Rhabdoviridae. Entretanto, através de análises estruturais e organizacionais do genoma do CilV-C ficou evidente que o vírus apresenta alguns (poucos) domínios conservados com membros de vários gêneros e famílias de fitovírus, mas não com rhabdovírus. Através de análises filogenéticas e associando estas informações às características morfológicas do virion, além dos efeitos citopáticos e sintomas induzidos por esses vírus em seus hospedeiros, sugerimos que o CilV-C seja considerado o membro-tipo de um novo gênero de vírus, denominado Cilevirus. Foi possível também determinar com segurança que ele não pertence a família Rhabdoviridae, como proposto anteriormente. Essas informações permitiram uma análise comparativa entre regiões genômicas do CilV-C com as de outros vírus transmitidos por Brevipa/pus (VTBs), entre eles, Orchid fleck virus - OFV, Coffee ringspot virus - CoRSV, e Ligustrum ringspot virus - LigRSV.