Within-host evolution of SARS-CoV-2 in an immunosuppressed COVID-19 patient as a source of immune escape variants.
Nat Commun
; 12(1): 6405, 2021 11 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: covidwho-1505001
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Este artigo de periódico científico é provavelmente baseado em um preprint previamente disponível, por meio do reconhecimento de similaridade realizado por uma máquina. A confirmação humana ainda está pendente.
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ABSTRACT
The origin of SARS-CoV-2 variants of concern remains unclear. Here, we test whether intra-host virus evolution during persistent infections could be a contributing factor by characterizing the long-term SARS-CoV-2 infection dynamics in an immunosuppressed kidney transplant recipient. Applying RT-qPCR and next-generation sequencing (NGS) of sequential respiratory specimens, we identify several mutations in the viral genome late in infection. We demonstrate that a late viral isolate exhibiting genome mutations similar to those found in variants of concern first identified in UK, South Africa, and Brazil, can escape neutralization by COVID-19 antisera. Moreover, infection of susceptible mice with this patient's escape variant elicits protective immunity against re-infection with either the parental virus and the escape variant, as well as high neutralization titers against the alpha and beta SARS-CoV-2 variants, B.1.1.7 and B.1.351, demonstrating a considerable immune control against such variants of concern. Upon lowering immunosuppressive treatment, the patient generated spike-specific neutralizing antibodies and resolved the infection. Our results suggest that immunocompromised patients could be a source for the emergence of potentially harmful SARS-CoV-2 variants.
Texto completo:
Disponível
Coleções:
Bases de dados internacionais
Base de dados:
MEDLINE
Assunto principal:
SARS-CoV-2
/
COVID-19
Tipo de estudo:
Relato de caso
/
Ensaios controlados aleatorizados
Tópicos:
Variantes
Limite:
Humanos
/
Masculino
/
Meia-Idade
Idioma:
Inglês
Revista:
Nat Commun
Assunto da revista:
Biologia
/
Ciência
Ano de publicação:
2021
Tipo de documento:
Artigo
País de afiliação:
S41467-021-26602-3
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