Detalles de la búsqueda
1.
Determinants of enhancer and promoter activities of regulatory elements.
Nat Rev Genet
; 21(2): 71-87, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31605096
2.
Transcription factor expression is the main determinant of variability in gene co-activity.
Mol Syst Biol
; 19(7): e11392, 2023 07 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37158788
3.
Endogenous retroviruses co-opted as divergently transcribed regulatory elements shape the regulatory landscape of embryonic stem cells.
Nucleic Acids Res
; 50(4): 2111-2127, 2022 02 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35166831
4.
Comparative transcriptomics of primary cells in vertebrates.
Genome Res
; 30(7): 951-961, 2020 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32718981
5.
Methods for fighting emerging pathogens.
Nat Methods
; 19(4): 395-397, 2022 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35396474
6.
A promoter-level mammalian expression atlas.
Nature
; 507(7493): 462-70, 2014 Mar 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24670764
7.
An atlas of active enhancers across human cell types and tissues.
Nature
; 507(7493): 455-461, 2014 Mar 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24670763
8.
Transcription start site analysis reveals widespread divergent transcription in D. melanogaster and core promoter-encoded enhancer activities.
Nucleic Acids Res
; 46(11): 5455-5469, 2018 06 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29659982
9.
The RNA exosome contributes to gene expression regulation during stem cell differentiation.
Nucleic Acids Res
; 46(21): 11502-11513, 2018 11 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30212902
10.
CAGEfightR: analysis of 5'-end data using R/Bioconductor.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 487, 2019 Oct 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31585526
11.
Shared activity patterns arising at genetic susceptibility loci reveal underlying genomic and cellular architecture of human disease.
PLoS Comput Biol
; 14(3): e1005934, 2018 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29494619
12.
Update of the FANTOM web resource: high resolution transcriptome of diverse cell types in mammals.
Nucleic Acids Res
; 45(D1): D737-D743, 2017 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27794045
13.
A unified architecture of transcriptional regulatory elements.
Trends Genet
; 31(8): 426-33, 2015 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26073855
14.
The frequent evolutionary birth and death of functional promoters in mouse and human.
Genome Res
; 25(10): 1546-57, 2015 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26228054
15.
Regulating retrotransposon activity through the use of alternative transcription start sites.
EMBO Rep
; 17(5): 753-68, 2016 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26902262
16.
Human Gene Promoters Are Intrinsically Bidirectional.
Mol Cell
; 60(3): 346-7, 2015 Nov 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26545074
17.
Genome-wide nucleosome map and cytosine methylation levels of an ancient human genome.
Genome Res
; 24(3): 454-66, 2014 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24299735
18.
Promoter or enhancer, what's the difference? Deconstruction of established distinctions and presentation of a unifying model.
Bioessays
; 37(3): 314-23, 2015 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25450156
19.
Analysis of the DNA methylome and transcriptome in granulopoiesis reveals timed changes and dynamic enhancer methylation.
Blood
; 123(17): e79-89, 2014 Apr 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24671952
20.
Nucleosome regulatory dynamics in response to TGFß.
Nucleic Acids Res
; 42(11): 6921-34, 2014 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24771338