Detalles de la búsqueda
1.
MODOMICS: a database of RNA modifications and related information. 2023 update.
Nucleic Acids Res
; 52(D1): D239-D244, 2024 Jan 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38015436
2.
DEGRONOPEDIA: a web server for proteome-wide inspection of degrons.
Nucleic Acids Res
; 2024 Apr 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38567734
3.
SimRNAweb v2.0: a web server for RNA folding simulations and 3D structure modeling, with optional restraints and enhanced analysis of folding trajectories.
Nucleic Acids Res
; 2024 May 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38738621
4.
Conserved structures and dynamics in 5'-proximal regions of Betacoronavirus RNA genomes.
Nucleic Acids Res
; 52(6): 3419-3432, 2024 Apr 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38426934
5.
Structural interaction fingerprints and machine learning for predicting and explaining binding of small molecule ligands to RNA.
Brief Bioinform
; 24(4)2023 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37204195
6.
A comprehensive survey of long-range tertiary interactions and motifs in non-coding RNA structures.
Nucleic Acids Res
; 51(16): 8367-8382, 2023 09 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37471030
7.
RNA 3D structure modeling by fragment assembly with small-angle X-ray scattering restraints.
Bioinformatics
; 39(9)2023 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37647627
8.
DNAzymeBuilder, a web application for in situ generation of RNA/DNA-cleaving deoxyribozymes.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W261-W265, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35446426
9.
MODOMICS: a database of RNA modification pathways. 2021 update.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D231-D235, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34893873
10.
RNA tertiary structure prediction in CASP15 by the GeneSilico group: Folding simulations based on statistical potentials and spatial restraints.
Proteins
; 91(12): 1800-1810, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37622458
11.
RNA target highlights in CASP15: Evaluation of predicted models by structure providers.
Proteins
; 91(12): 1600-1615, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37466021
12.
fingeRNAt-A novel tool for high-throughput analysis of nucleic acid-ligand interactions.
PLoS Comput Biol
; 18(6): e1009783, 2022 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35653385
13.
DNAmoreDB, a database of DNAzymes.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D76-D81, 2021 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33053178
14.
Constrained peptides mimic a viral suppressor of RNA silencing.
Nucleic Acids Res
; 49(22): 12622-12633, 2021 12 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34871435
15.
Defining a novel domain that provides an essential contribution to site-specific interaction of Rep protein with DNA.
Nucleic Acids Res
; 49(6): 3394-3408, 2021 04 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33660784
16.
AnnapuRNA: A scoring function for predicting RNA-small molecule binding poses.
PLoS Comput Biol
; 17(2): e1008309, 2021 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33524009
17.
RNA and DNA G-quadruplexes bind to human dicer and inhibit its activity.
Cell Mol Life Sci
; 78(7): 3709-3724, 2021 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33733306
18.
RNAProbe: a web server for normalization and analysis of RNA structure probing data.
Nucleic Acids Res
; 48(W1): W292-W299, 2020 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32504492
19.
RNA-Puzzles toolkit: a computational resource of RNA 3D structure benchmark datasets, structure manipulation, and evaluation tools.
Nucleic Acids Res
; 48(2): 576-588, 2020 01 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31799609
20.
Genome-wide mapping of SARS-CoV-2 RNA structures identifies therapeutically-relevant elements.
Nucleic Acids Res
; 48(22): 12436-12452, 2020 12 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33166999