Detalles de la búsqueda
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Oncogenic Signaling Pathways in The Cancer Genome Atlas.
Cell
; 173(2): 321-337.e10, 2018 04 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29625050
2.
SyBLaRS: A web service for laying out, rendering and mining biological maps in SBGN, SBML and more.
PLoS Comput Biol
; 18(11): e1010635, 2022 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36374853
3.
Newt: a comprehensive web-based tool for viewing, constructing and analyzing biological maps.
Bioinformatics
; 37(10): 1475-1477, 2021 06 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33010165
4.
Pathway Commons 2019 Update: integration, analysis and exploration of pathway data.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D489-D497, 2020 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31647099
5.
Community-driven roadmap for integrated disease maps.
Brief Bioinform
; 20(2): 659-670, 2019 03 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29688273
6.
cd2sbgnml: bidirectional conversion between CellDesigner and SBGN formats.
Bioinformatics
; 36(8): 2620-2622, 2020 04 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31904823
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PathwayMapper: a collaborative visual web editor for cancer pathways and genomic data.
Bioinformatics
; 33(14): 2238-2240, 2017 Jul 15.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28334343
8.
An algorithm for automated layout of process description maps drawn in SBGN.
Bioinformatics
; 32(1): 77-84, 2016 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26363029
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cd2sbgnml: bidirectional conversion between CellDesigner and SBGN formats.
Bioinformatics
; 36(19): 4975, 2020 12 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33146381
10.
Integrating biological pathways and genomic profiles with ChiBE 2.
BMC Genomics
; 15: 642, 2014 Aug 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25086704
11.
Software support for SBGN maps: SBGN-ML and LibSBGN.
Bioinformatics
; 28(15): 2016-21, 2012 Aug 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22581176
12.
A guide for developing comprehensive systems biology maps of disease mechanisms: planning, construction and maintenance.
Front Bioinform
; 3: 1197310, 2023.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37426048
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Analysis and Visualization of Longitudinal Genomic and Clinical Data from the AACR Project GENIE Biopharma Collaborative in cBioPortal.
Cancer Res
; 83(23): 3861-3867, 2023 12 01.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37668528
14.
VISIBIOweb: visualization and layout services for BioPAX pathway models.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20460470
15.
Discovering modulators of gene expression.
Nucleic Acids Res
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20466809
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fCoSE: A Fast Compound Graph Layout Algorithm with Constraint Support.
IEEE Trans Vis Comput Graph
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| MEDLINE | ID: mdl-34232882
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ChiBE: interactive visualization and manipulation of BioPAX pathway models.
Bioinformatics
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| MEDLINE | ID: mdl-20007251
18.
Analyzing causal relationships in proteomic profiles using CausalPath.
STAR Protoc
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34877547
19.
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Patterns (N Y)
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| MEDLINE | ID: mdl-34179843
20.
Systems biology graphical notation markup language (SBGNML) version 0.3.
J Integr Bioinform
; 17(2-3)2020 Jun 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32568733