Detalles de la búsqueda
1.
Multiscale chromatin dynamics and high entropy in plant iPSC ancestors.
J Cell Sci
; 2024 May 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38738286
2.
Differentiation is accompanied by a progressive loss in transcriptional memory.
BMC Biol
; 22(1): 58, 2024 Mar 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38468285
3.
One model fits all: Combining inference and simulation of gene regulatory networks.
PLoS Comput Biol
; 19(3): e1010962, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36972296
4.
scAN1.0: A reproducible and standardized pipeline for processing 10X single cell RNAseq data.
In Silico Biol
; 15(1-2): 11-21, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37927254
5.
Hematopoietic differentiation is characterized by a transient peak of entropy at a single-cell level.
BMC Biol
; 20(1): 60, 2022 03 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35260165
6.
Evidence for close molecular proximity between reverting and undifferentiated cells.
BMC Biol
; 20(1): 155, 2022 07 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35794592
7.
Practical identifiability in the frame of nonlinear mixed effects models: the example of the in vitro erythropoiesis.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 478, 2021 Oct 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34607573
8.
Modeling and characterization of inter-individual variability in CD8 T cell responses in mice.
In Silico Biol
; 14(1-2): 13-39, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33554899
9.
The quiescent fraction of chronic myeloid leukemic stem cells depends on BMPR1B, Stat3 and BMP4-niche signals to persist in patients in remission.
Haematologica
; 106(1): 111-122, 2021 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32001529
10.
Reduction of a stochastic model of gene expression: Lagrangian dynamics gives access to basins of attraction as cell types and metastabilty.
J Math Biol
; 83(5): 59, 2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34739605
11.
Integrated time-lapse and single-cell transcription studies highlight the variable and dynamic nature of human hematopoietic cell fate commitment.
PLoS Biol
; 15(7): e2001867, 2017 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28749943
12.
WASABI: a dynamic iterative framework for gene regulatory network inference.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 220, 2019 May 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31046682
13.
SINCERITIES: inferring gene regulatory networks from time-stamped single cell transcriptional expression profiles.
Bioinformatics
; 34(2): 258-266, 2018 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28968704
14.
Calibration, Selection and Identifiability Analysis of a Mathematical Model of the in vitro Erythropoiesis in Normal and Perturbed Contexts.
In Silico Biol
; 13(1-2): 55-69, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31006682
15.
Single-Cell-Based Analysis Highlights a Surge in Cell-to-Cell Molecular Variability Preceding Irreversible Commitment in a Differentiation Process.
PLoS Biol
; 14(12): e1002585, 2016 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28027290
16.
Temperature-induced variation in gene expression burst size in metazoan cells.
BMC Mol Biol
; 16: 20, 2015 Nov 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26608344
17.
Quantifying the contribution of chromatin dynamics to stochastic gene expression reveals long, locus-dependent periods between transcriptional bursts.
BMC Biol
; 11: 15, 2013 Feb 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23442824
18.
Stochastic modeling of a gene regulatory network driving B cell development in germinal centers.
PLoS One
; 19(3): e0301022, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38547073
19.
Exogenous IL-2 delays memory precursors generation and is essential for enhancing memory cells effector functions.
iScience
; 27(4): 109411, 2024 Apr 19.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38510150
20.
Differential miRNA expression profiles in proliferating or differentiated keratinocytes in response to gamma irradiation.
BMC Genomics
; 14: 184, 2013 Mar 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23496899