Detalles de la búsqueda
1.
m6 A modification of HSATIII lncRNAs regulates temperature-dependent splicing.
EMBO J
; 40(15): e107976, 2021 08 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34184765
2.
Remarkable improvement in detection of readthrough downstream-of-gene transcripts by semi-extractable RNA-sequencing.
RNA
; 29(2): 170-177, 2023 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36384963
3.
LncRNA-dependent nuclear stress bodies promote intron retention through SR protein phosphorylation.
EMBO J
; 39(3): e102729, 2020 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31782550
4.
QRNAstruct: a method for extracting secondary structural features of RNA via regression with biological activity.
Nucleic Acids Res
; 50(13): e73, 2022 07 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35390152
5.
The Effect of γ Phosphate Modified Deoxynucleotide Substrates on PCR Activity and Fidelity.
Chembiochem
; 24(14): e202200572, 2023 07 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37253903
6.
ConsAlifold: considering RNA structural alignments improves prediction accuracy of RNA consensus secondary structures.
Bioinformatics
; 38(3): 710-719, 2022 01 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34694364
7.
PBSIM2: a simulator for long-read sequencers with a novel generative model of quality scores.
Bioinformatics
; 37(5): 589-595, 2021 05 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32976553
8.
Improving the prediction accuracy of protein abundance in Escherichia coli using mRNA accessibility.
Nucleic Acids Res
; 48(14): e81, 2020 08 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32504488
9.
Exchange of endogenous and heterogeneous yeast terminators in Pichia pastoris to tune mRNA stability and gene expression.
Nucleic Acids Res
; 48(22): 13000-13012, 2020 12 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33257988
10.
Finding the direct optimal RNA barrier energy and improving pathways with an arbitrary energy model.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i227-i235, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657400
11.
RintC: fast and accuracy-aware decomposition of distributions of RNA secondary structures with extended logsumexp.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 210, 2020 May 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32448174
12.
A robust model for quantitative prediction of the silencing efficacy of wild-type and A-to-I edited miRNAs.
RNA Biol
; 17(2): 264-280, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31601146
13.
Jointly aligning a group of DNA reads improves accuracy of identifying large deletions.
Nucleic Acids Res
; 46(3): e18, 2018 02 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29182778
14.
Combining probabilistic alignments with read pair information improves accuracy of split-alignments.
Bioinformatics
; 34(21): 3631-3637, 2018 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29790902
15.
Capturing alternative secondary structures of RNA by decomposition of base-pairing probabilities.
BMC Bioinformatics
; 19(Suppl 1): 38, 2018 02 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29504917
16.
Evolutionary design of multiple genes encoding the same protein.
Bioinformatics
; 33(11): 1613-1620, 2017 Jun 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28130234
17.
Training alignment parameters for arbitrary sequencers with LAST-TRAIN.
Bioinformatics
; 33(6): 926-928, 2017 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28039163
18.
Rtools: a web server for various secondary structural analyses on single RNA sequences.
Nucleic Acids Res
; 44(W1): W302-7, 2016 07 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27131356
19.
Bioinformatics tools for lncRNA research.
Biochim Biophys Acta
; 1859(1): 23-30, 2016 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26271403
20.
CDSfold: an algorithm for designing a protein-coding sequence with the most stable secondary structure.
Bioinformatics
; 32(6): 828-34, 2016 03 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26589279