Detalles de la búsqueda
1.
RNAhugs web server for customized 3D RNA structure alignment.
Nucleic Acids Res
; 2024 Apr 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38587206
2.
Machine learning for RNA 2D structure prediction benchmarked on experimental data.
Brief Bioinform
; 24(3)2023 05 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37096592
3.
WebTetrado: a webserver to explore quadruplexes in nucleic acid 3D structures.
Nucleic Acids Res
; 51(W1): W607-W612, 2023 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37158242
4.
When will RNA get its AlphaFold moment?
Nucleic Acids Res
; 51(18): 9522-9532, 2023 Oct 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37702120
5.
Evaluation of the stereochemical quality of predicted RNA 3D models in the RNA-Puzzles submissions.
RNA
; 28(2): 250-262, 2022 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34819324
6.
High-quality, customizable heuristics for RNA 3D structure alignment.
Bioinformatics
; 39(5)2023 05 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37166444
7.
ONQUADRO: a database of experimentally determined quadruplex structures.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D253-D258, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34986600
8.
RNAspider: a webserver to analyze entanglements in RNA 3D structures.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W663-W669, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35349710
9.
RNA tertiary structure prediction using RNAComposer in CASP15.
Proteins
; 91(12): 1790-1799, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37615316
10.
New prediction categories in CASP15.
Proteins
; 91(12): 1550-1557, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37306011
11.
How bioinformatics resources work with G4 RNAs.
Brief Bioinform
; 22(3)2021 05 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32898859
12.
RNAsolo: a repository of cleaned PDB-derived RNA 3D structures.
Bioinformatics
; 38(14): 3668-3670, 2022 07 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35674373
13.
DrawTetrado to create layer diagrams of G4 structures.
Bioinformatics
; 38(15): 3835-3836, 2022 08 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35703937
14.
RNAloops: a database of RNA multiloops.
Bioinformatics
; 38(17): 4200-4205, 2022 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35809063
15.
Entanglements of structure elements revealed in RNA 3D models.
Nucleic Acids Res
; 49(17): 9625-9632, 2021 09 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34432024
16.
RNA-Puzzles Round IV: 3D structure predictions of four ribozymes and two aptamers.
RNA
; 26(8): 982-995, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32371455
17.
Virxicon: a lexicon of viral sequences.
Bioinformatics
; 36(22-23): 5507-5513, 2021 Apr 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33367605
18.
RNA-Puzzles toolkit: a computational resource of RNA 3D structure benchmark datasets, structure manipulation, and evaluation tools.
Nucleic Acids Res
; 48(2): 576-588, 2020 01 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31799609
19.
Computational Pipeline for Reference-Free Comparative Analysis of RNA 3D Structures Applied to SARS-CoV-2 UTR Models.
Int J Mol Sci
; 23(17)2022 Aug 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36077037
20.
Topology-based classification of tetrads and quadruplex structures.
Bioinformatics
; 36(4): 1129-1134, 2020 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31588513