RIPiT-Seq: a high-throughput approach for footprinting RNA:protein complexes.

Singh, Guramrit; Ricci, Emiliano P; Moore, Melissa J

Singh, Guramrit; Ricci, Emiliano P; Moore, Melissa J.

Afiliación

Singh G; Howard Hughes Medical Institute, RNA Therapeutics Institute, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01605, United States.
Ricci EP; Howard Hughes Medical Institute, RNA Therapeutics Institute, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01605, United States.
Moore MJ; Howard Hughes Medical Institute, RNA Therapeutics Institute, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01605, United States. Electronic address: melissa.moore@umassmed.edu.

Methods ; 65(3): 320-32, 2014 Feb.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-24096052

Asunto(s)

Huella de Proteína/métodos; ARN/química; Proteínas Recombinantes de Fusión/química; Ribonucleoproteínas/química; Transcriptoma; Sitios de Unión; Reactivos de Enlaces Cruzados/química; Formaldehído/química; Regulación de la Expresión Génica; Células HEK293; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Humanos; Inmunoprecipitación; Modelos Moleculares; Unión Proteica; ARN/genética; Proteínas Recombinantes de Fusión/genética; Ribonucleoproteínas/genética

Palabras clave

Formaldehyde crosslinking; High-throughput sequencing; Immunoprecipitation; RIP-Seq; RIPiT; RNA binding proteins

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Ribonucleoproteínas / Proteínas Recombinantes de Fusión / ARN / Huella de Proteína / Transcriptoma Límite: Humans Idioma: En Año: 2014 Tipo del documento: Article

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